偽狂犬病病毒野毒株新型可視化環(huán)介導等溫擴增檢測方法的建立
發(fā)布時間:2021-10-25 22:51
利用環(huán)介導等溫擴增(LAMP)與pH指示劑結合的方式建立偽狂犬病病毒(PRV)野毒株的快速檢測方法,并優(yōu)化反應體系。結果顯示,該方法特異性良好、敏感性較高,檢測限達100.5TCID50,與熒光定量PCR的敏感性一致。對52份臨床樣品進行檢測,用熒光定量PCR檢測出30份陽性樣品,LAMP檢測出27份陽性樣品,二者的符合率為94.2%。結果表明,PRV野毒株新型可視化LAMP檢測方法操作簡便、結果判別明顯、檢測成本低,可預期應用于PRV帶毒豬的快速篩查,這對于豬偽狂犬病的凈化具有重要意義。
【文章來源】:中國獸醫(yī)科學. 2020,50(08)北大核心CSCD
【文章頁數】:5 頁
【部分圖文】:
LAMP的擴增結果
LAMP的特異性試驗
顯。本研究中建立的新型可視化LAMP檢測方法的陽性結果為黃色,陰性結果為紫紅色,檢測結果直觀且容易分辨。其靈敏度和熒光定量PCR一致,檢測限可以達到100.5TCID50。采用本研究中建立的方法與熒光定量PCR分別對52份臨床樣品進行檢測,二者的符合率為94.2%。其中,LAMP檢測結果為假陰性的樣品的Ct值分別為37.43、37.19、37.67,這3個樣品屬于弱陽性。本研究中建立的豬偽狂犬病病毒野毒株新型可視化LAMP快速檢測方法可預期應用于PRV帶毒豬的快速篩查,這對于豬偽狂犬病的凈化具有重要意義。12345678圖3LAMP的敏感性試驗Figure3ThesensitivitytestofLAMP1~7:105.5、104.5、103.5、102.5、101.5、100.5、10-0.5TCID50;8:陰性對照。1—7:105.5,104.5,103.5,102.5,101.5,100.5,10-0.5TCID50;8:Negativecontrol.10.2649.2648.2647.2646.2645.2644.2643.2642.2641.2640.264熒光強度Fluorescence(533-580)12345651015202530354045循環(huán)數Cycles78檢測結果ResultLAMP熒光定量PCRQuantitativePCR陽性數Positivecounts1720陰性數Negativecounts3532總計Total5252參考文獻(References)[1]高澤文,范桂芳,趙婷婷,等.豬偽狂犬病病毒流行株遺傳進化及序列比對分析[J].中國獸醫(yī)學報,2018,38(1):1-10.GAOZe-wen,FANGui-fang,ZHAOTing-ting,etal.Phy-logeneticandsequencealignmentanalysisofepi-demicswinepseudorabiesvirus[J].ChineseJournalofVeterinaryScience,2018,38(1):1-10.(inChi-nese)[2]龍曉婷,劉俊磊,郭洪,等.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]小反芻獸疫病毒環(huán)介導等溫擴增檢測方法的建立[J]. 徐瀅,郝玉青,付明哲,張琪,李勤凡,許信剛. 動物醫(yī)學進展. 2019(03)
[2]豬偽狂犬病病毒流行株遺傳進化及序列比對分析[J]. 高澤文,范桂芳,趙婷婷,徐守興,吳斌. 中國獸醫(yī)學報. 2018(01)
[3]犬副流感病毒反轉錄-環(huán)介導等溫擴增檢測方法的建立[J]. 王鳳雪,程世鵬,溫永俊. 中國獸醫(yī)科學. 2016(04)
[4]腸出血性大腸桿菌O157∶H7 LAMP-LFD快速檢測方法的建立及初步應用[J]. 王利麗,張莉,李秀麗,任衛(wèi)科,池晶晶,楊春蕾,鄢明華. 中國獸醫(yī)科學. 2015(08)
[5]可視化LAMP快速檢測豬偽狂犬病毒[J]. 王樹芬,王德國,薛白,李學伍,趙東,張改平. 河南農業(yè)科學. 2012(06)
[6]豬偽狂犬病病毒環(huán)介導等溫擴增檢測方法的建立[J]. 張莉,鄢明華,王東,鮑士國,韓偉,任衛(wèi)科. 中國獸醫(yī)科學. 2011(07)
[7]偽狂犬病毒在潛伏感染豬體內的組織分布[J]. 龍曉婷,劉俊磊,郭洪,習楊,邱德新,陳煥春,周銳. 畜牧獸醫(yī)學報. 2008(05)
[8]偽狂犬病病毒潛伏感染的研究[J]. 懷濟森,陳煥春. 動物醫(yī)學進展. 1997(03)
本文編號:3458312
【文章來源】:中國獸醫(yī)科學. 2020,50(08)北大核心CSCD
【文章頁數】:5 頁
【部分圖文】:
LAMP的擴增結果
LAMP的特異性試驗
顯。本研究中建立的新型可視化LAMP檢測方法的陽性結果為黃色,陰性結果為紫紅色,檢測結果直觀且容易分辨。其靈敏度和熒光定量PCR一致,檢測限可以達到100.5TCID50。采用本研究中建立的方法與熒光定量PCR分別對52份臨床樣品進行檢測,二者的符合率為94.2%。其中,LAMP檢測結果為假陰性的樣品的Ct值分別為37.43、37.19、37.67,這3個樣品屬于弱陽性。本研究中建立的豬偽狂犬病病毒野毒株新型可視化LAMP快速檢測方法可預期應用于PRV帶毒豬的快速篩查,這對于豬偽狂犬病的凈化具有重要意義。12345678圖3LAMP的敏感性試驗Figure3ThesensitivitytestofLAMP1~7:105.5、104.5、103.5、102.5、101.5、100.5、10-0.5TCID50;8:陰性對照。1—7:105.5,104.5,103.5,102.5,101.5,100.5,10-0.5TCID50;8:Negativecontrol.10.2649.2648.2647.2646.2645.2644.2643.2642.2641.2640.264熒光強度Fluorescence(533-580)12345651015202530354045循環(huán)數Cycles78檢測結果ResultLAMP熒光定量PCRQuantitativePCR陽性數Positivecounts1720陰性數Negativecounts3532總計Total5252參考文獻(References)[1]高澤文,范桂芳,趙婷婷,等.豬偽狂犬病病毒流行株遺傳進化及序列比對分析[J].中國獸醫(yī)學報,2018,38(1):1-10.GAOZe-wen,FANGui-fang,ZHAOTing-ting,etal.Phy-logeneticandsequencealignmentanalysisofepi-demicswinepseudorabiesvirus[J].ChineseJournalofVeterinaryScience,2018,38(1):1-10.(inChi-nese)[2]龍曉婷,劉俊磊,郭洪,等.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]小反芻獸疫病毒環(huán)介導等溫擴增檢測方法的建立[J]. 徐瀅,郝玉青,付明哲,張琪,李勤凡,許信剛. 動物醫(yī)學進展. 2019(03)
[2]豬偽狂犬病病毒流行株遺傳進化及序列比對分析[J]. 高澤文,范桂芳,趙婷婷,徐守興,吳斌. 中國獸醫(yī)學報. 2018(01)
[3]犬副流感病毒反轉錄-環(huán)介導等溫擴增檢測方法的建立[J]. 王鳳雪,程世鵬,溫永俊. 中國獸醫(yī)科學. 2016(04)
[4]腸出血性大腸桿菌O157∶H7 LAMP-LFD快速檢測方法的建立及初步應用[J]. 王利麗,張莉,李秀麗,任衛(wèi)科,池晶晶,楊春蕾,鄢明華. 中國獸醫(yī)科學. 2015(08)
[5]可視化LAMP快速檢測豬偽狂犬病毒[J]. 王樹芬,王德國,薛白,李學伍,趙東,張改平. 河南農業(yè)科學. 2012(06)
[6]豬偽狂犬病病毒環(huán)介導等溫擴增檢測方法的建立[J]. 張莉,鄢明華,王東,鮑士國,韓偉,任衛(wèi)科. 中國獸醫(yī)科學. 2011(07)
[7]偽狂犬病毒在潛伏感染豬體內的組織分布[J]. 龍曉婷,劉俊磊,郭洪,習楊,邱德新,陳煥春,周銳. 畜牧獸醫(yī)學報. 2008(05)
[8]偽狂犬病病毒潛伏感染的研究[J]. 懷濟森,陳煥春. 動物醫(yī)學進展. 1997(03)
本文編號:3458312
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