豬CAST基因多態(tài)性分析及發(fā)育性表達(dá)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-10-24 08:07
CAST基因被認(rèn)為是影響肉質(zhì)性狀的候選基因,本試驗(yàn)從基因多態(tài)性水平和基因表達(dá)水平研究不同豬種CAST基因第2內(nèi)含子和外顯子9的多態(tài)性分布,以及CAST基因在馬身豬和大白豬背最長(zhǎng)肌組織中的表達(dá)分析,以期為馬身豬優(yōu)良肉質(zhì)遺傳分子機(jī)理提供理論基礎(chǔ)。豬CAST基因第2內(nèi)含子中存在以GT為核心序列的微衛(wèi)星座位。本試驗(yàn)檢測(cè)了5個(gè)豬種(馬身豬、山西黑豬、大白豬、長(zhǎng)白豬、杜洛克豬)共227個(gè)個(gè)體在該座位的遺傳多態(tài)性,檢測(cè)到4個(gè)等位基因:A(171bp)、B(179bp)、C(185bp)、D(191bp)。所檢測(cè)的豬群體中,馬身豬群體以B等位基因?yàn)橹鳎ɑ蝾l率為0.6310),山西黑豬和杜洛克豬群體以D等位基因?yàn)橹鳎ɑ蝾l率分別為0.6389和0.5143),長(zhǎng)白豬和大白豬群體中4種基因頻率相近。所選擇的豬群體中,共有10種基因型被檢測(cè)到,大白豬和長(zhǎng)白豬群體的基因型以純合子為主,遺傳純合度分別為0.7037和0.6667。馬身豬和山西黑豬群體的基因型以雜合子為主,遺傳雜合度分別為0.5476和0.6111。采用PCR-SSCP技術(shù)檢測(cè)了杜洛克豬、大白豬、長(zhǎng)白豬、晉汾白豬、山西黑豬和馬身豬6個(gè)品種共41...
【文章來(lái)源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:53 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
中英文縮略對(duì)照表
前言
文獻(xiàn)綜述
1 鈣蛋白酶系統(tǒng)簡(jiǎn)介
1.1 鈣蛋白酶系統(tǒng)的發(fā)現(xiàn)
1.2 鈣蛋白酶系統(tǒng)的功能
1.3 影響鈣蛋白酶系統(tǒng)的因素
2 CAST基因的研究進(jìn)展
2.1 CAST基因的發(fā)現(xiàn)及定位
2.2 CAST蛋白的結(jié)構(gòu)
2.3 CAST蛋白的作用機(jī)制
2.4 CAST基因多態(tài)性的研究
2.5 CAST基因表達(dá)及功能的研究
試驗(yàn)一 關(guān)于5個(gè)豬種CAST基因第2內(nèi)含子的微衛(wèi)星多態(tài)性分析
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及材料
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 豬基因組DNA的提取
2.2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
2.3 微衛(wèi)星多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
2.4 豬CAST基因第二內(nèi)含子微衛(wèi)星多態(tài)性檢測(cè)及分析
3 討論
3.1 豬CAST基因遺傳多態(tài)性及群體遺傳學(xué)分析
3.2 各豬種間遺傳結(jié)構(gòu)比較
試驗(yàn)二 關(guān)于6個(gè)豬種CAST基因第9外顯子多態(tài)性分析
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及材料
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 CAST基因第9外顯子PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.2 CAST基因第9外顯子SSCP結(jié)果
2.3 不同豬種CAST基因單倍型頻率及顯著性檢驗(yàn)
2.4 豬CAST基因SSCP多態(tài)位點(diǎn)與生長(zhǎng)發(fā)育性狀的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 豬CAST基因外顯子9的多態(tài)性
3.2 CAST基因外顯子9的單倍型對(duì)豬體重和體尺性狀的影響
試驗(yàn)三馬身豬和大白豬CAST基因發(fā)育性表達(dá)研究
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及組織
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 總RNA提取結(jié)果
2.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立與分析
2.3 部分樣品擴(kuò)增動(dòng)力學(xué)曲線
2.4 樣品擴(kuò)增溶解曲線
2.5 CAST基因MRNA的相對(duì)豐度分析
3 討論
3.1 關(guān)于RTQF-PCR方法
3.2 試驗(yàn)結(jié)果的誤差分析
3.3 背最長(zhǎng)肌CAST基因表達(dá)與豬發(fā)育的相關(guān)性分析
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
Abstract
致謝
本文編號(hào):3454912
【文章來(lái)源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:53 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
中英文縮略對(duì)照表
前言
文獻(xiàn)綜述
1 鈣蛋白酶系統(tǒng)簡(jiǎn)介
1.1 鈣蛋白酶系統(tǒng)的發(fā)現(xiàn)
1.2 鈣蛋白酶系統(tǒng)的功能
1.3 影響鈣蛋白酶系統(tǒng)的因素
2 CAST基因的研究進(jìn)展
2.1 CAST基因的發(fā)現(xiàn)及定位
2.2 CAST蛋白的結(jié)構(gòu)
2.3 CAST蛋白的作用機(jī)制
2.4 CAST基因多態(tài)性的研究
2.5 CAST基因表達(dá)及功能的研究
試驗(yàn)一 關(guān)于5個(gè)豬種CAST基因第2內(nèi)含子的微衛(wèi)星多態(tài)性分析
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及材料
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗(yàn)方法
1.4 統(tǒng)計(jì)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 豬基因組DNA的提取
2.2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
2.3 微衛(wèi)星多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
2.4 豬CAST基因第二內(nèi)含子微衛(wèi)星多態(tài)性檢測(cè)及分析
3 討論
3.1 豬CAST基因遺傳多態(tài)性及群體遺傳學(xué)分析
3.2 各豬種間遺傳結(jié)構(gòu)比較
試驗(yàn)二 關(guān)于6個(gè)豬種CAST基因第9外顯子多態(tài)性分析
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及材料
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 CAST基因第9外顯子PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.2 CAST基因第9外顯子SSCP結(jié)果
2.3 不同豬種CAST基因單倍型頻率及顯著性檢驗(yàn)
2.4 豬CAST基因SSCP多態(tài)位點(diǎn)與生長(zhǎng)發(fā)育性狀的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 豬CAST基因外顯子9的多態(tài)性
3.2 CAST基因外顯子9的單倍型對(duì)豬體重和體尺性狀的影響
試驗(yàn)三馬身豬和大白豬CAST基因發(fā)育性表達(dá)研究
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及組織
1.2 主要儀器與試劑
1.3 試驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 總RNA提取結(jié)果
2.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立與分析
2.3 部分樣品擴(kuò)增動(dòng)力學(xué)曲線
2.4 樣品擴(kuò)增溶解曲線
2.5 CAST基因MRNA的相對(duì)豐度分析
3 討論
3.1 關(guān)于RTQF-PCR方法
3.2 試驗(yàn)結(jié)果的誤差分析
3.3 背最長(zhǎng)肌CAST基因表達(dá)與豬發(fā)育的相關(guān)性分析
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
Abstract
致謝
本文編號(hào):3454912
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