牛諾如病毒的分子檢測和基因組研究
發(fā)布時間:2021-10-16 07:08
牛諾如病毒(Bovine Norovirus,BNoV)是一種引起犢牛腹瀉的病原,并已經(jīng)在意大利,韓國和中國等19個國家報道檢出。BNoV屬于GIII,進一步可細分為GIII.1和GIII.2兩種基因亞型。2017年,本實驗室證明了BNoV在我國的存在,但BNoV在國內(nèi)的流行情況和基因組尚無研究,本研究的目的是調(diào)查我國BNoV的流行情況及基因組特征,取得以下成果:1首次證明BNoV在我國奶犢牛中廣泛流行,并具有獨特的進化特征牛諾如病毒是一種引起犢牛腹瀉的病原,本研究旨在調(diào)查該病毒在國內(nèi)部分地區(qū)BNoV的流行情況及分子特征。采用RT-PCR對采自國內(nèi)6省的25個養(yǎng)殖場的265份奶犢牛糞便樣本進行BNoV檢測,其中有211份腹瀉糞便樣本和54份健康糞便樣本。結(jié)果顯示:腹瀉樣本中BNoV檢出率為20.4%(43/211),顯著高于健康糞便樣本中9.26%的檢出率(P<0.01),證明該病毒與犢牛腹瀉息息相關(guān);四川省、遼寧省、河南省、新疆維吾爾自治區(qū)和山東省的腹瀉樣本中BNoV檢出率分別為34.8%(8/23),53.2%(25/47),11.1%(3/27),6.9%(6/87)和9....
【文章來源】:西南民族大學四川省
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
BNoV基因組結(jié)構(gòu)示意圖
NoVRdRp的結(jié)構(gòu)
牛諾如病毒的分子流行病學和基因組特征7圖3P結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu)Figure3X-raycrystalstructureofPdomain1.3.4ORF3及其編碼蛋白ORF3編碼次要衣殼蛋白(VP2),是基因組中的高變區(qū),其可以起到維持NoV病毒顆粒的穩(wěn)定性的作用(Lin,Fengling,Lianzhu,Yuxiu,&Yanhua,2014)。關(guān)于NoVVP2的研究較少,尚未見關(guān)于BNoVVP2的結(jié)構(gòu)與功能相關(guān)報道。1.4牛諾如病毒的重組NoV具有高的遺傳變異性,并且能夠進行重組,重組被認為是NoV進化的主要驅(qū)動因素之一(White,2014)。目前,在BNoV中報道的重組事件存在三種重組類型,分別為GIII.P1/GIII.2、GIII.P2/GIII.1和GIII.P2/GIII.4,重組位點位于ORF1/ORF2連接起點上游的9-19個核苷酸(DiFeliceetal.,2016)。2004年,Oliver等人在英國鑒定了第一個BNoV重組毒株Bo/Thirsk10/00/UK,該毒株具有
【參考文獻】:
期刊論文
[1]牛冠狀病毒RT-PCR檢測方法的建立及應用[J]. 何琪富,郭紫晶,李然,周軍,岳華,張斌,湯承. 畜牧獸醫(yī)學報. 2018(10)
[2]川藏地區(qū)牦牛牛病毒性腹瀉病毒分子流行病學調(diào)查及分離鑒定[J]. 陳新諾,肖敏,阮文強,覃思楠,岳華,湯承,張斌. 畜牧獸醫(yī)學報. 2018(03)
[3]牦牛輪狀病毒VP6基因序列分析及RT-PCR檢測方法的建立與應用[J]. 周芳,岳華,張斌,李凡,陳曦,湯承. 畜牧獸醫(yī)學報. 2016(07)
本文編號:3439385
【文章來源】:西南民族大學四川省
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
BNoV基因組結(jié)構(gòu)示意圖
NoVRdRp的結(jié)構(gòu)
牛諾如病毒的分子流行病學和基因組特征7圖3P結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu)Figure3X-raycrystalstructureofPdomain1.3.4ORF3及其編碼蛋白ORF3編碼次要衣殼蛋白(VP2),是基因組中的高變區(qū),其可以起到維持NoV病毒顆粒的穩(wěn)定性的作用(Lin,Fengling,Lianzhu,Yuxiu,&Yanhua,2014)。關(guān)于NoVVP2的研究較少,尚未見關(guān)于BNoVVP2的結(jié)構(gòu)與功能相關(guān)報道。1.4牛諾如病毒的重組NoV具有高的遺傳變異性,并且能夠進行重組,重組被認為是NoV進化的主要驅(qū)動因素之一(White,2014)。目前,在BNoV中報道的重組事件存在三種重組類型,分別為GIII.P1/GIII.2、GIII.P2/GIII.1和GIII.P2/GIII.4,重組位點位于ORF1/ORF2連接起點上游的9-19個核苷酸(DiFeliceetal.,2016)。2004年,Oliver等人在英國鑒定了第一個BNoV重組毒株Bo/Thirsk10/00/UK,該毒株具有
【參考文獻】:
期刊論文
[1]牛冠狀病毒RT-PCR檢測方法的建立及應用[J]. 何琪富,郭紫晶,李然,周軍,岳華,張斌,湯承. 畜牧獸醫(yī)學報. 2018(10)
[2]川藏地區(qū)牦牛牛病毒性腹瀉病毒分子流行病學調(diào)查及分離鑒定[J]. 陳新諾,肖敏,阮文強,覃思楠,岳華,湯承,張斌. 畜牧獸醫(yī)學報. 2018(03)
[3]牦牛輪狀病毒VP6基因序列分析及RT-PCR檢測方法的建立與應用[J]. 周芳,岳華,張斌,李凡,陳曦,湯承. 畜牧獸醫(yī)學報. 2016(07)
本文編號:3439385
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