馬匹（Equus caballus）體尺性狀影響馬運動性能,利用新技術研究馬體尺性狀為馬匹運動性能的研究引入新方法。為豐富馬體尺性狀與運動性能的研究內(nèi)容,探索間接調(diào)控運動性能的基因,本研究利用全基因組關聯(lián)分析方法（genome-wide association study, GWAS）挖掘影響馬體尺性狀的遺傳標記和功能基因。利用馬670 K高密度芯片,對伊犁馬、純血馬、俄羅斯速步馬、奧爾洛夫馬共4個品種157個個體的體尺性狀（體高,體長,管圍,尻高）及體尺指數(shù)（體長率,管圍率,胸圍率）進行全基因組關聯(lián)分析。利用Plink1.9軟件對SNP位點進行質(zhì)控,質(zhì)控后剩余494 137個SNP用于后續(xù)關聯(lián)分析。利用Ensembl等數(shù)據(jù)庫進行基因注釋和基因功能分析,通過基因組水平的Bonferroni校正,從體高、管圍、尻高、胸圍率、管圍率5個性狀中分別檢測到3、15、1、1和9個潛在顯著關聯(lián)的SNP （P<9.29E-06）,未檢測到與體長和體長率顯著相關的SNP。結(jié)果發(fā)現(xiàn)泛素結(jié)合酶E2家族的第三亞家族（ubiquitin conjugating enzyme E2 E3,UBE2E3）、... 

【文章來源】：農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2020,28(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

群體結(jié)構多維度分析

馬體型結(jié)構影響馬匹的運動性能。馬匹的管部越長，運動過程中對肌腱和韌帶的壓迫較大，容易導致馬匹奔跑時腿部相互碰撞，從而使馬匹運動速度受阻；而管圍粗的馬匹，地面的沖擊對馬匹在運動時的前肢影響較大(Brenda,2007)。在傅曉峰(1990)研究中，管圍和速度之間的相關性呈較強的負相關。在裴紅羅(2003)的研究中，對于不同距離的比賽，管圍越小，馬匹的成績越好，且短距離的比賽對馬匹管圍的要求更高。在李敏等(2014)研究中，管圍和管圍率與伊犁馬的速度呈極顯著負相關。管圍的大小影響馬匹運動速度，則與管圍相關的基因影響馬匹的運動性能。3.1 UBE2E3基因與運動性能

本研究采用MLM對4個品種馬7個體尺指標性狀(體高,體長,管圍,尻高,體長率,胸圍率,管圍率)進行GWAS分析，校正方法為Bonferroni，即P值低于4.64 E-07 (0.05/107680)的SNP位點則認為與表型顯著相關；P值低于9.29E-06 (1/107680)的SNP位點則認為與表型潛在相關。由圖3可知，未發(fā)現(xiàn)在基因組水平與7個性狀顯著相關的SNP位點；與體高潛在關聯(lián)的位點有3個；與管圍潛在關聯(lián)的位點有15個；與尻高潛在關聯(lián)的位點有1個；與胸圍率潛在關聯(lián)的位點有1個；與管圍率潛在關聯(lián)的位點有9個；在全基因組水平?jīng)]有與體長、體長率性狀潛在關聯(lián)的SNP位點。尋找可能影響體尺性狀的關鍵位點，為關鍵基因的挖掘提供基礎資料。


本文編號：3436954