DNA甲基化是在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下，將S-硫代腺苷甲硫氨酸中的甲基基團轉(zhuǎn)移到胞嘧啶的第五個碳原子上，使DNA分子中堿基結(jié)合甲基的過程。DNA甲基化在基因表達、X染色體的失活、遺傳印記、細胞分化、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)維持、胚胎發(fā)育、癌癥的發(fā)生和胚胎發(fā)育中扮演著重要角色。DNA甲基化作為一種重要的表觀遺傳修飾，其功能主要是通過基因表達抑制來實現(xiàn)。顯著的甲基化水平差異已經(jīng)在不同組織中發(fā)現(xiàn)，并且在相同組織具有不同的功能。很多研究表明不同的甲基化水平可能與組織特異性轉(zhuǎn)錄和某些性狀有關(guān)，并且對正常的分化和發(fā)育以及一些性狀起到至關(guān)重要的作用。肉質(zhì)性狀是個復(fù)雜的性狀，由多基因控制，因此控制肉質(zhì)性狀基因的甲基化水平的改變必然影響其表達，進而對肉質(zhì)性狀產(chǎn)生效應(yīng)。DNA甲基化水平受到品種、性別、年齡、環(huán)境、飼養(yǎng)管理水平等諸多因素的影響，并且在時間和空間上存在差異表達。本研究采用熒光標記的甲基化敏感性擴增多態(tài)性技術(shù)對汶上蘆花雞9種組織基因組DNA甲基化水平進行了檢測，共計檢測到19,795個片段，其中非甲基化片段8,935個；半甲基化片段5,668個，全甲基化片段5,192個。半甲基化比率胸肌顯著高于其他組織（P... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：109 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

DNA甲基化示意圖

DNA發(fā)生去甲基化，而另外50%的DNA處于半甲基化狀態(tài)。有研究表MBD2具有去甲基的能力，認為MBD2就是一種去甲基化酶[19-21]。動去甲基化存在機制的可能有以下五種：（1）核苷酸外切修復(fù)機制G二核苷酸。（2）脫氨酶參與的堿基切除修復(fù)：5-mC脫氨變成胸腺入堿基切除修復(fù)途徑。（3）DNA轉(zhuǎn)葡糖基酶參與的堿基切除修復(fù)：直接去除。（4）水解去甲基化：水解胞嘧啶的甲基基團，使其以甲醇化去甲基化：發(fā)生氧化反應(yīng)打開碳-碳鍵，直接去除甲基基團[22]。 甲基化轉(zhuǎn)移酶的分類能和序列的同源性，真核生物DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶又分為4類：維持DT1或維持甲基化酶）、甲基化轉(zhuǎn)移酶2（DNMT2）、從頭甲基化酶（甲基化轉(zhuǎn)移酶的家族成員結(jié)構(gòu)如圖2所示。

對照組用 Cy3 標記），然后與芯片雜交。芯片上每個探針的Cy5/Cy3 強度比例顯示出該區(qū)域的甲基化程度。其原理和具體過程如圖 3 所示。圖3 免疫共沉淀分析基因組整體水平甲基化的原理和具體過程示意圖3.1.6 基于二代測序平臺的全基因組甲基化分析新一代測序儀的飛速發(fā)展使得全基因組甲基化測序的研究成為可能。近年來利用高通量測序相結(jié)合，繪制出了甲基化圖譜。全基因組重亞硫酸鹽測序（whole genome bisulfite sequencing）又稱為“金標準”BS-seq 測序，它是基于二代測序平臺的全基因組甲基化分析。其原理是首先用重亞硫酸鹽對基因組 DNA 進行處理，將未發(fā)生甲基化的C 堿基轉(zhuǎn)換成 U，進行 PCR 擴增后變成 T，與原本具有甲基化修飾的 C 堿基區(qū)分開來，再結(jié)合高通量測序技術(shù)，特別適用于繪制單堿基分辨率的全基因組 DNA 甲基化圖譜。全基因組重亞硫酸鹽測序成本比較高，而其中的甲基化 DNA 免疫共沉淀測序（MeDIP-seq）和簡化的表觀亞硫酸?

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Twin-Based DNA Methylation Analysis Takes the Center Stage of Studies of Human Complex Diseases[J]. Dongfeng Zhang~(a,*),Shuxia Li~b,Qihua Tan~(b,c),Zengchang Pang~(a,d) a Department of Public Health,Qingdao University Medical College,38 Dengzhou Street,Qingdao 266021,China b Institute of Clinical Research,Unit of Human Genetics,University of Southern Denmark,Sdr.Boulevard 29,Odense C DK-5000,Denmark c Epidemiology,Institute of Public Health,University of Southern Denmark,J.B.Winslows Vej 9b,Odense C DK-5000,Denmark d Qingdao Center for Disease Control and Prevention,175 Shandong Road,Qingdao 266033,China.  遺傳學(xué)報. 2012(11)
[2]DNA甲基化及其生物學(xué)功能[J]. 沈秀平,林月霞,徐琪.  中國畜牧獸醫(yī). 2012(06)
[3]DNA去甲基化機制的研究進展[J]. 曹領(lǐng)改,張旸,藍興國,李玉花.  現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進展. 2012(01)
[4]DNA甲基化的研究進展[J]. 謝松松,王寶峰,周宗瑤.  現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進展. 2009(17)
[5]DNA甲基化與胚胎發(fā)育的研究進展[J]. 黃鈞,蔣小青,蔣犁.  國外醫(yī)學(xué)(婦產(chǎn)科學(xué)分冊). 2007(01)
[6]DNA甲基化與細胞分化[J]. 付曉蘭,李雪峰.  廣西農(nóng)業(yè)生物科學(xué). 2006(S1)
[7]DNA甲基化研究方法的回顧與評價[J]. 顧婷婷,張忠明,鄭鵬生.  中國婦幼健康研究. 2006(06)
[8]雞H-FABP和A-FABP基因表達與肌內(nèi)脂肪含量相關(guān)研究[J]. 李文娟,李宏賓,文杰,陳繼蘭,趙桂蘋,鄭麥青.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2006(05)
[9]DNA甲基化及其生物學(xué)功能[J]. 宮時玉,蔣曹德,鄧昌彥.  華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2005(06)
[10]DNA甲基化的分析與狀態(tài)檢測[J]. 朱燕.  現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2005(09)



本文編號：3400702