旨在系統(tǒng)鑒定豬基因組中的環(huán)狀RNAs（circular RNAs, circRNAs）,并對其分子特征進(jìn)行分析。本研究采集長白、通城和五指山豬16個發(fā)育階段（妊娠33、40、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100和105 d的胚胎以及出生后0和10 d）9種不同組織（背最長肌、心、脾、肺、肝、腎、胃、小腸和腿�。悠�,提取RNA再進(jìn)行等量混合,構(gòu)建鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫后,利用Illumina Genome Analyzer II平臺進(jìn)行測序,共獲得1.18億條總reads。采用CIRI2軟件鑒定circRNAs,再利用生物信息學(xué)工具對鑒定的circRNAs進(jìn)行分子特征分析。結(jié)果,共鑒定了8 486條circRNAs,其主要分布在1、6和13號染色體,91%的circRNAs為外顯子型,平均長度為350 nt,平均GC含量為47.11%,每條染色體上的circRNAs數(shù)目與mRNAs數(shù)目顯著正相關(guān)(R=0.84,P=1.285×10^-5)。最后,篩選出3條與骨骼肌生長發(fā)育相關(guān)的circRNAs（sus-MYH2₀025... 

【文章來源】：畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2020,51(12)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

circRNAs的鑒定與分布特征

circRNAs序列和蛋白編碼基因的特征

circRNAs和mRNAs的GC含量比較


本文編號：3395804