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寧夏荷斯坦青年母牛全基因組選擇與BLUP選種效果分析

發(fā)布時(shí)間:2021-08-12 18:06
  本研究以寧夏地區(qū)荷斯坦青年母牛為研究對(duì)象,利用全基因組選擇的方法,對(duì)五批次2511頭青年母牛進(jìn)行育種值計(jì)算;選擇參加全基因組測(cè)定的989頭青年母牛的產(chǎn)奶的四個(gè)性狀(305d產(chǎn)奶量,乳脂率,乳蛋白以及體細(xì)胞評(píng)分)數(shù)據(jù),利用BLUP法對(duì)其進(jìn)行了遺傳評(píng)估,通過(guò)秩相關(guān)對(duì)全基因組和BLUP法的計(jì)算結(jié)果進(jìn)行相關(guān)性分析,及兩種方法遺傳進(jìn)展的對(duì)比。結(jié)果表明:寧夏地區(qū)荷斯坦青年母牛五批基因組選擇奶牛GCPI均值從第一批的283.32上升到第五批910.46,呈逐批上升的趨勢(shì),其中,產(chǎn)奶量的基因組育種值均值最大的是第四批為576.54;乳脂率、乳蛋白、乳房、肢蹄和體型基因組育種值均值都為第五批為最大值;體細(xì)胞評(píng)分基因組育種值均值五批次呈現(xiàn)逐漸下降的趨勢(shì),第四、五批均值最小,為3.00。七個(gè)性狀五批次的基因組育種值估計(jì)準(zhǔn)確性的均值在0.44到0.75之間,其中最大的為第四批泌乳系統(tǒng)的估計(jì)準(zhǔn)確性為0.75,最小的為第三批體細(xì)胞評(píng)分的估計(jì)準(zhǔn)確性為0.44。最終選取989頭奶牛多胎次產(chǎn)奶數(shù)據(jù)的四個(gè)性狀運(yùn)用DMU軟件進(jìn)行計(jì)算,得到育種值與估計(jì)準(zhǔn)確性均低于基因組選擇數(shù)據(jù)。根據(jù)育種值與其他遺傳參數(shù)計(jì)算得到CPI2指數(shù),... 

【文章來(lái)源】:寧夏大學(xué)寧夏回族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

寧夏荷斯坦青年母牛全基因組選擇與BLUP選種效果分析


圖2-1技術(shù)路線??Figure?2-1?Technical?route??12??

選擇過(guò)程,基因組,技術(shù)平臺(tái),參考群體


高通量測(cè)序法進(jìn)行測(cè)序,標(biāo)記SNP的基因型,再進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,然后再根據(jù)測(cè)得的候選個(gè)體??芯片的標(biāo)記信息,結(jié)合GS技術(shù)平臺(tái)的每個(gè)標(biāo)記的效應(yīng)值,最終計(jì)算出候選個(gè)體的性狀基因??組育種(GEBV),如圖2-2所示。??|?DNA高通置測(cè)序|??基因組肓種ii ̄|<?^統(tǒng)計(jì)分析卜('?|??^?.7?’??圖2-2青年母牛基因組選擇過(guò)程圖??Figure?2-2?Genome?selection?process?map?of?heifer??本研宂借助中國(guó)荷斯坦牛GS技術(shù)平臺(tái)進(jìn)行估計(jì)標(biāo)記效應(yīng),該技術(shù)平臺(tái)是中國(guó)農(nóng)業(yè)大??學(xué)張沅教授和張勤教授課題組率先在提出,并在國(guó)內(nèi)開(kāi)展了基因組選擇的理論和方法研宄,??掌握了關(guān)鍵技術(shù),建立了高密度SNP效應(yīng)估計(jì)和基因組育種計(jì)算分析平臺(tái),同時(shí)由本課題??組提出育種值估計(jì)的TABLUP方法,并組建了中國(guó)荷斯坦牛參考群體。通過(guò)該參考群體可??15??

變化趨勢(shì),育種值,基因組,性狀


性狀的基因組育種值和估計(jì)準(zhǔn)確性,根據(jù)各性狀的基因組育種值計(jì)算得到GCPI指數(shù)。??分別對(duì)五批次基因組選擇的青年母牛GCPI指數(shù)和各性狀的基因組育種值結(jié)果進(jìn)行對(duì)??比,通過(guò)表3-7和圖3-1可以看出,GCPI值逐漸升高,最高的是第五批為910.46;產(chǎn)奶量??基因組育種值均值最高的是第四批為576.54;乳脂率基因組育種值均值在第四、第五批次??提升為正數(shù),最高值為第五批的0.09;乳蛋白率、乳房和肢蹄評(píng)分的基因組育種值均值最高??28??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
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[2]寧夏地區(qū)荷斯坦牛遺傳評(píng)估及選擇指數(shù)構(gòu)建[D]. 李欣.寧夏大學(xué) 2017
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[8]缺失數(shù)據(jù)對(duì)內(nèi)蒙古絨山羊估計(jì)育種值準(zhǔn)確性的影響[D]. 梁永厚.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007



本文編號(hào):3338810

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