系譜記錄是明確個體間親緣關(guān)系,以個體選擇為主的現(xiàn)代育種實踐,是動物遺傳育種的重要信息來源。然而,隨著社會經(jīng)濟的不斷發(fā)展,人類對高產(chǎn)的盲目追求,加上大量高產(chǎn)外來品種的引進,導致大尾寒羊品種受到了前所未有的破壞,存欄量逐年下降。目前,在山東省內(nèi)建立大尾寒羊國家級保種群已迫在眉睫。由于大尾寒羊個體來源復雜,原保種群管理不嚴格,存在分子系譜不清楚,遺傳結(jié)構(gòu)不清晰等問題,為保護大尾寒羊遺傳資源,需通過分子手段了解大尾寒羊個體間的親子關(guān)系,構(gòu)建分子系譜,識別雜交個體,制定育種計劃。本研究對大尾寒羊保種群145只個體為材料,選取25個微衛(wèi)星位點,預實驗采用40只個體進行混池檢測,篩選了15個多態(tài)性較高的微衛(wèi)星位點,用于親權(quán)鑒定和分子系譜構(gòu)建。Cervus3.0進行親子關(guān)系分析,例如:雜合度（H）、多態(tài)性信息含量（PIC）、給定候選親本與子代基因型,排除候選親本的概率（NE-1P）、給定已知親本基因型、候選親本基因型和子代基因型,排除候選親本的概率（NE-2P）和多個位點的累積排除概率（CEP）,以及Hardy-Weinberg平衡檢測。用Pedigraph3.0軟件,繪制具有復雜近交系結(jié)構(gòu)的家系系譜... 

【文章來源】：山東農(nóng)業(yè)大學山東省

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

大尾寒羊血液基因組DNA提取凝膠電泳圖，M：DL2000DNAMarkerFigure1GelelectrophoresismapofbloodgenomicDNAofLargeTailedHanSheep，M：DL2000DNAMarker

山東農(nóng)業(yè)大學碩士專業(yè)學位論文21結(jié)果用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測，使用凝膠成像系統(tǒng)觀察并拍照，檢測產(chǎn)物有無擴增出，部分微衛(wèi)星標記的PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測，見圖2，圖3，圖4，圖5。Marker為100-3000bp的marker。通過瓊脂糖電泳檢測結(jié)果可以看出，PCR擴增產(chǎn)物電泳圖條帶清晰，效果較好，擴增的片段長度與目的長度吻合，可以用來進行后續(xù)實驗。圖2基因座BMS574的PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖3基因座OarFCB20的PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure2PCRamplificationofBMS574Figure3PCRamplificationofOarFCB20圖4基因座BMS1248的PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖5基因座MB023的PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure4PCRamplificationofBMS1248Figure5PCRamplificationofMB0233.3遺傳參數(shù)分析3.3.1微衛(wèi)星位點多態(tài)性在預實驗的40只大尾寒羊中，對25個位點進行多態(tài)性篩選，通過等位基因數(shù)，多態(tài)信息含量等因素，選取了15個等位基因數(shù)目較多、多態(tài)性較高的微衛(wèi)星位點用于大尾寒羊分子系譜的構(gòu)建和遺傳結(jié)構(gòu)分析。通過Cervus3.0中AlleleFrequencyAnalysis程序，會得到各種遺傳參數(shù)，具體信息見表5。

山東農(nóng)業(yè)大學碩士專業(yè)學位論文21結(jié)果用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測，使用凝膠成像系統(tǒng)觀察并拍照，檢測產(chǎn)物有無擴增出，部分微衛(wèi)星標記的PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測，見圖2，圖3，圖4，圖5。Marker為100-3000bp的marker。通過瓊脂糖電泳檢測結(jié)果可以看出，PCR擴增產(chǎn)物電泳圖條帶清晰，效果較好，擴增的片段長度與目的長度吻合，可以用來進行后續(xù)實驗。圖2基因座BMS574的PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖3基因座OarFCB20的PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure2PCRamplificationofBMS574Figure3PCRamplificationofOarFCB20圖4基因座BMS1248的PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖5基因座MB023的PCR擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Figure4PCRamplificationofBMS1248Figure5PCRamplificationofMB0233.3遺傳參數(shù)分析3.3.1微衛(wèi)星位點多態(tài)性在預實驗的40只大尾寒羊中，對25個位點進行多態(tài)性篩選，通過等位基因數(shù)，多態(tài)信息含量等因素，選取了15個等位基因數(shù)目較多、多態(tài)性較高的微衛(wèi)星位點用于大尾寒羊分子系譜的構(gòu)建和遺傳結(jié)構(gòu)分析。通過Cervus3.0中AlleleFrequencyAnalysis程序，會得到各種遺傳參數(shù)，具體信息見表5。

【參考文獻】：
期刊論文
[1]利用微衛(wèi)星標記分析安徽地方種豬的遺傳多樣性[J]. 丁勇,尚金男,徐怡亮,丁月云,崔文竹,高亞飛,殷宗俊,張曉東.  云南農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學). 2019(05)
[2]岷縣黑裘皮羊微衛(wèi)星遺傳多樣性分析[J]. 張瑞,郎俠,吳建平,劉婷,宮旭胤,王彩蓮,遲浩斌,梁婷玉.  中國畜牧獸醫(yī). 2019(08)
[3]西藏崗巴綿羊種質(zhì)特異標記研究[J]. 洛桑催成,德慶卓嘎,巴桑吉巴,格桑加措,平措班旦,扎西,普布次仁,張立,旦巴,大格桑羅布.  畜禽業(yè). 2019(06)
[4]山東省濟寧青山羊群體遺傳多樣性分析[J]. 王可,劉昭華,曹洪防,楚惠民,崔緒奎.  山東農(nóng)業(yè)科學. 2019(05)
[5]灘羊微衛(wèi)星標記多態(tài)性及與體尺性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 李標,張瑞瑩,王小琪,張存芳,段子淵.  生物技術(shù)通報. 2019(06)
[6]阿拉善沙漠雙峰駝的微衛(wèi)星多態(tài)性與體尺性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 烏仁套迪,斯琴圖雅,白俊艷.  畜牧與獸醫(yī). 2018(09)
[7]阿拉善戈壁雙峰駝的微衛(wèi)星多態(tài)性與體尺性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 烏仁套迪,白俊艷,巴拉,周俊文,張文彬.  中國畜牧獸醫(yī). 2018(07)
[8]布拖黑綿羊微衛(wèi)星標記遺傳多樣性研究[J]. 周明亮,陳明華,龐倩,楊平貴,李燕.  草學. 2018(02)
[9]MiniFiler及Yfiler試劑盒無創(chuàng)產(chǎn)前親子鑒定的可能性探究[J]. 蔣浩君,尹路,穆豪放,陳芳,何農(nóng)躍,杜舟.  中國法醫(yī)學雜志. 2017(01)
[10]新疆羅布羊群體遺傳多樣性及系統(tǒng)進化分析[J]. 鄭永富,王姍姍,高慶華,錢夢陽,宮昌海,陳曉利,韓春梅.  生物技術(shù). 2016(06)

碩士論文
[1]兩個山羊品種分子系譜的構(gòu)建及家系遺傳特征分析[D]. 紀志賓.山東農(nóng)業(yè)大學 2010
[2]7個微衛(wèi)星標記與波爾山羊生長性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 蘇杰.華中農(nóng)業(yè)大學 2009
[3]中國9個地方山羊品種遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[D]. 樊睿.西北農(nóng)林科技大學 2009
[4]六個miniSTR基因座群體遺傳學研究[D]. 李霞.河北醫(yī)科大學 2009
[5]山東地方山羊種群邊際多樣性和優(yōu)先保護次序[D]. 李培培.山東農(nóng)業(yè)大學 2008
[6]利用微衛(wèi)星標記分析部分山羊品種的遺傳多樣性[D]. 趙艷紅.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2003



本文編號：3288052