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解析VRTN基因因果突變調(diào)控豬胸椎數(shù)的分子機理

發(fā)布時間:2021-06-23 03:27
  脊椎數(shù)是豬重要經(jīng)濟性狀,影響豬胴體長、單位產(chǎn)肉量及乳頭數(shù)。本實驗室及日本Mikawa研究小組利用一系列的遺傳學(xué)分析在7號染色體(SSC7)上鑒別一個顯著影響豬脊椎數(shù)的數(shù)量性狀位點(QTL),該位點的單個等位基因可使胸椎數(shù)(TVN)增加0.5,vertnin(VRTN)被認(rèn)為是該位點的候選因果基因,且該基因上的兩個突變位點被鑒定為候選因果突變位點(QTNs),它們很可能起源于中國地方豬并在歷史上被導(dǎo)入到歐洲豬中。本研究旨在前期工作基礎(chǔ)上對VRTN基因進行深入的功能驗證,解析豬胸椎數(shù)變異的分子機理。本研究首先使用60K SNP芯片判定了609頭杜長大雜交豬39,367個SNP的基因型,與胸椎數(shù)進行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),發(fā)現(xiàn)最強關(guān)聯(lián)位點是位于SSC7上的MARC0038565(P=1.87×10-51),通過連鎖不平衡分析確定了400 kb的QTL置信區(qū)間。在置信區(qū)間內(nèi)增加分子標(biāo)記密度后,再次開展GWAS分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)VRTN基因中的g.8063G>A、g.13066C>T、g.19034A>C和g.2031120312i... 

【文章來源】:江西農(nóng)業(yè)大學(xué)江西省

【文章頁數(shù)】:163 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

解析VRTN基因因果突變調(diào)控豬胸椎數(shù)的分子機理


豬脊椎骨骼圖

過程圖,脊椎動物,發(fā)育生物學(xué),過程


圖 1-2 脊椎動物胚胎的發(fā)育過程(引自張紅衛(wèi),發(fā)育生物學(xué),2006[7])Figure 1.2 Developmental process of embryos in vertebrate(cited from Zhang et al, Developmental biology, 2006[7])

安利,發(fā)育生物學(xué)


圖 1-3 中胚層的分化(引自安利國,發(fā)育生物學(xué),2010[9])Figure 1.3 Differentiation of mesoderm(cited from An et al, Developmental biology,2010[9])

【參考文獻】:
期刊論文
[1]豬F2代資源家系的群體結(jié)構(gòu)對QTL定位的影響[J]. 郭源梅,張勤,任軍,周利華.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(04)
[2]X-連鎖遲發(fā)性脊椎骨骺發(fā)育不良一家系報道[J]. 郭奕斌,王晶晶.  中國優(yōu)生與遺傳雜志. 2008(01)
[3]畜禽數(shù)量性狀基因座位的精細(xì)定位[J]. 魯紹雄,連林生.  中國牛業(yè)科學(xué). 2006(01)

博士論文
[1]鑒別豬7號染色體影響脊椎數(shù)變異的因果突變位點[D]. 范寅.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]利用系譜傳遞不平衡檢驗精細(xì)定位QTL[D]. 丁向東.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004

碩士論文
[1]豬7號染色體上位置候選基因PROX2在西方商業(yè)豬群中對脊椎數(shù)變異影響效應(yīng)的分析[D]. 范寅.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011



本文編號:3244135

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