鴨疫里氏桿菌06537/06542基因缺失株的構建及其生物學特性研究
發(fā)布時間:2021-06-20 21:01
鴨疫里氏桿菌(Riemerella anatipestifer,RA)感染是當前危害全球養(yǎng)鴨業(yè)的重要傳染病之一。目前發(fā)現(xiàn)RA至少有21種血清型。但即使是在同一種血清型中,不同來源菌株之間的毒力也存在較大差異。一旦鴨疫里氏桿菌感染鴨群,它可以造成該病的廣泛流行且徹底根除十分困難,而且存在反復感染發(fā)作的可能性,所以我們急需要一種安全有效的疫苗以預防該病。而目前有關鴨疫里氏桿菌感染的分子致病機理及免疫機制的研究報道較少。運用分子生物學的方法深入研究鴨疫里氏桿菌感染的分子致病機理及免疫機制來預防該病的發(fā)生是當前研究的熱點。本研究以鴨疫里氏桿菌血清1型云夢株(RA-YM)為親本株,選取了其中一對雙組份調控系統(tǒng)06537/06542為研究對象,通過構建重組自殺性質粒,采用接合轉移方法構建了RA-YM株的06537/06542基因缺失株,對該基因缺失株的生物學特性進行了研究,并比較了其與RA-YM親本株對雛鴨的致病性。取得的主要研究結果如下:1構建了RA-YM 06537/06542基因缺失株根據(jù)RA-YM株06537/06542基因的序列,通過重組自殺性質粒p RE112-LSR,利用接合轉移同源...
【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
pMD18-T質粒圖譜
cript II SK(+),自殺性質粒 pRE112(圖 3-2)及宿主菌 保存。觀霉素抗性(SpcR)基因 pIC333 質粒由本實驗室保存。體的結構示意圖如下:圖 3-1:pMD18-T 質粒圖譜Fig.3-1:Restriction map of pMD18-T
結構 RNA 聚合酶發(fā)生相互作用。而在 373bp-462bp 的位置上還有蛋白甘露糖基轉移酶結構域。從中可以看出,06542 基因符合反應調控因子 RR 一般結構特點。通過生物信息學分析,發(fā)現(xiàn) 06537/06542 是一對分別具有 BaeS 和 OmpR 保守性區(qū)域的雙組份調控系統(tǒng)。已有的研究報道發(fā)現(xiàn) BaeS 通常與 BaeR 組成一對雙組份調控系統(tǒng),而 OmpR 則通常與 EnvZ 組成一對雙組份調控系統(tǒng),BaeS 和 OmpR 這種組合的雙組份系統(tǒng)當前尚無研究報道。而且,06537 基因的 BaeS 保守性區(qū)域前還具有一個與細菌 SNF2 解旋酶相關的結構域,這種 SNF2_assoc-HisKA-HATPase_c 的HK 結構域組合當前也未被報道過(附錄圖 3)。因此,這種新的 HK 結構域組合和新的 TCS 組合對鴨疫里氏桿菌生物學特性和致病性的影響也是后續(xù)研究的重點。運用TMHMM 軟件對RAYM_06537和RAYM_06542的跨膜螺旋區(qū)域進行分析(圖 4-1A,圖 4-1B),結果發(fā)現(xiàn) RAYM_06537 有兩個跨膜區(qū),其中第 1-4 氨基酸位于細胞膜內,第 5-27 氨基酸為跨膜螺旋區(qū),第 28-258 氨基酸在細胞膜外,第259-281 氨基酸為第二個跨膜螺旋區(qū),第 282-514 氨基酸在細胞膜內;RAYM_06542上無跨膜區(qū)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鴨傳染性漿膜炎的診治[J]. 朱二勇,殷麗霞,王曉春,趙慶遠,鄭楊,劉翠娥,王本玲. 當代畜禽養(yǎng)殖業(yè). 2015(02)
[2]鴨疫里默氏桿菌的GAPDH同源體:一種有生物活性的胞外蛋白(英文)[J]. Ji-ye GAO,Cui-lian YE,Li-li ZHU,Zhi-ying TIAN,Zhi-bang YANG. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2014(09)
[3]假單胞菌碳代謝抑制調控系統(tǒng)各組分的功能及作用機制[J]. 弓湃,尚立國,戰(zhàn)崳華,燕永亮,林敏. 中國農業(yè)科技導報. 2014(02)
[4]鴨疫里默氏桿菌強、弱菌株外膜蛋白的比較蛋白質組學研究[J]. 劉燕,韋強,鮑國連,季權安. 生物化學與生物物理進展. 2008(06)
[5]鴨疫里默氏桿菌外膜蛋白生物學特性研究[J]. 劉燕,韋強,鮑國連,季權安. 生物工程學報. 2008(04)
[6]鴨疫里默氏菌的gyrA基因的檢測與變異位點的分析[J]. 劉穎,蘇敬良,劉文華. 中國獸醫(yī)雜志. 2007(01)
[7]鴨疫里默氏菌一個可能新型的鑒定[J]. 張大丙,鄭獻進,曲豐發(fā). 中國預防獸醫(yī)學報. 2006(01)
[8]鴨疫里默氏菌16SrDNA基因的PCR-RFLP分析[J]. 曲豐發(fā),張大丙,鄭獻進,郭玉璞. 中國獸醫(yī)雜志. 2005(10)
[9]間接免疫組化法檢測鴨疫里默氏桿菌感染和抗原定位[J]. 劉維平,程安春,汪銘書,陳孝躍,周毅,朱德康,劉菲,孟瓊華,黃誠,宋涌. 中國獸醫(yī)學報. 2005(04)
[10]PCR法快速檢測鴨疫里氏桿菌的研究[J]. 楊建遠,鄧舜洲,何后軍. 江西農業(yè)大學學報. 2005(03)
博士論文
[1]A群鏈球菌CovRS雙組份系統(tǒng)致病機制研究[D]. 李錦銓.華中農業(yè)大學 2013
[2]雙組分調控系統(tǒng)1910HK/RR調控豬鏈球菌2型致病性研究[D]. 袁芳艷.華中農業(yè)大學 2010
[3]谷氨酰胺合成酶GlnA及其轉錄調節(jié)因子GlnR對2型豬鏈球菌致病力影響的研究[D]. 司有輝.華中農業(yè)大學 2009
[4]鴨疫里氏桿菌免疫診斷方法及在感染鴨肝臟差異表達基因的研究[D]. 周祖濤.華中農業(yè)大學 2009
[5]鴨疫里默氏桿菌致病相關因子研究[D]. 李繼祥.西南大學 2009
[6]二元信號轉導系統(tǒng)SalK/SalR調控高致病性2型豬鏈球菌毒力的實驗研究[D]. 李明.第三軍醫(yī)大學 2008
碩士論文
[1]豬鏈球菌2型雙組分信號轉導系統(tǒng)NisKR和BceRS對毒力調控的研究[D]. 徐娟.華中農業(yè)大學 2014
[2]豬鏈球菌2型雙組份調控系統(tǒng)CiaRH調控基因SSU052036和SSU052039的功能研究[D]. 賈志平.華中農業(yè)大學 2014
[3]胸膜肺炎放線桿菌CpxA/R雙組份調控系統(tǒng)基因缺失突變株構建及生物學特性研究[D]. 承慧.華中農業(yè)大學 2013
[4]胸膜肺炎放線桿菌雙組份調控系統(tǒng)QseB/QseC突變株構建功能研究[D]. 胡琳琳.華中農業(yè)大學 2011
[5]鴨疫里氏桿菌野生型質粒的分離、序列分析和DPP Ⅳ缺失株的構建[D]. 彭曉婭.華中農業(yè)大學 2011
[6]鴨疫里默氏桿菌特異性單克隆抗體的研制以及生物被膜和OmpA缺失株的研究[D]. 周小進.揚州大學 2010
[7]鴨疫里默氏桿菌1型磷酸二酯酶基因的發(fā)現(xiàn)及其克隆表達和應用研究[D]. 陳虹.四川農業(yè)大學 2008
[8]鴨疫里氏桿菌體內誘導抗原基因的篩選與應用研究[D]. 陳芬芬.華中農業(yè)大學 2008
[9]利用SCOTS技術篩選鴨疫里氏桿菌體內外差異表達的基因[D]. 鄭娟.華中農業(yè)大學 2008
本文編號:3239925
【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
pMD18-T質粒圖譜
cript II SK(+),自殺性質粒 pRE112(圖 3-2)及宿主菌 保存。觀霉素抗性(SpcR)基因 pIC333 質粒由本實驗室保存。體的結構示意圖如下:圖 3-1:pMD18-T 質粒圖譜Fig.3-1:Restriction map of pMD18-T
結構 RNA 聚合酶發(fā)生相互作用。而在 373bp-462bp 的位置上還有蛋白甘露糖基轉移酶結構域。從中可以看出,06542 基因符合反應調控因子 RR 一般結構特點。通過生物信息學分析,發(fā)現(xiàn) 06537/06542 是一對分別具有 BaeS 和 OmpR 保守性區(qū)域的雙組份調控系統(tǒng)。已有的研究報道發(fā)現(xiàn) BaeS 通常與 BaeR 組成一對雙組份調控系統(tǒng),而 OmpR 則通常與 EnvZ 組成一對雙組份調控系統(tǒng),BaeS 和 OmpR 這種組合的雙組份系統(tǒng)當前尚無研究報道。而且,06537 基因的 BaeS 保守性區(qū)域前還具有一個與細菌 SNF2 解旋酶相關的結構域,這種 SNF2_assoc-HisKA-HATPase_c 的HK 結構域組合當前也未被報道過(附錄圖 3)。因此,這種新的 HK 結構域組合和新的 TCS 組合對鴨疫里氏桿菌生物學特性和致病性的影響也是后續(xù)研究的重點。運用TMHMM 軟件對RAYM_06537和RAYM_06542的跨膜螺旋區(qū)域進行分析(圖 4-1A,圖 4-1B),結果發(fā)現(xiàn) RAYM_06537 有兩個跨膜區(qū),其中第 1-4 氨基酸位于細胞膜內,第 5-27 氨基酸為跨膜螺旋區(qū),第 28-258 氨基酸在細胞膜外,第259-281 氨基酸為第二個跨膜螺旋區(qū),第 282-514 氨基酸在細胞膜內;RAYM_06542上無跨膜區(qū)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鴨傳染性漿膜炎的診治[J]. 朱二勇,殷麗霞,王曉春,趙慶遠,鄭楊,劉翠娥,王本玲. 當代畜禽養(yǎng)殖業(yè). 2015(02)
[2]鴨疫里默氏桿菌的GAPDH同源體:一種有生物活性的胞外蛋白(英文)[J]. Ji-ye GAO,Cui-lian YE,Li-li ZHU,Zhi-ying TIAN,Zhi-bang YANG. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2014(09)
[3]假單胞菌碳代謝抑制調控系統(tǒng)各組分的功能及作用機制[J]. 弓湃,尚立國,戰(zhàn)崳華,燕永亮,林敏. 中國農業(yè)科技導報. 2014(02)
[4]鴨疫里默氏桿菌強、弱菌株外膜蛋白的比較蛋白質組學研究[J]. 劉燕,韋強,鮑國連,季權安. 生物化學與生物物理進展. 2008(06)
[5]鴨疫里默氏桿菌外膜蛋白生物學特性研究[J]. 劉燕,韋強,鮑國連,季權安. 生物工程學報. 2008(04)
[6]鴨疫里默氏菌的gyrA基因的檢測與變異位點的分析[J]. 劉穎,蘇敬良,劉文華. 中國獸醫(yī)雜志. 2007(01)
[7]鴨疫里默氏菌一個可能新型的鑒定[J]. 張大丙,鄭獻進,曲豐發(fā). 中國預防獸醫(yī)學報. 2006(01)
[8]鴨疫里默氏菌16SrDNA基因的PCR-RFLP分析[J]. 曲豐發(fā),張大丙,鄭獻進,郭玉璞. 中國獸醫(yī)雜志. 2005(10)
[9]間接免疫組化法檢測鴨疫里默氏桿菌感染和抗原定位[J]. 劉維平,程安春,汪銘書,陳孝躍,周毅,朱德康,劉菲,孟瓊華,黃誠,宋涌. 中國獸醫(yī)學報. 2005(04)
[10]PCR法快速檢測鴨疫里氏桿菌的研究[J]. 楊建遠,鄧舜洲,何后軍. 江西農業(yè)大學學報. 2005(03)
博士論文
[1]A群鏈球菌CovRS雙組份系統(tǒng)致病機制研究[D]. 李錦銓.華中農業(yè)大學 2013
[2]雙組分調控系統(tǒng)1910HK/RR調控豬鏈球菌2型致病性研究[D]. 袁芳艷.華中農業(yè)大學 2010
[3]谷氨酰胺合成酶GlnA及其轉錄調節(jié)因子GlnR對2型豬鏈球菌致病力影響的研究[D]. 司有輝.華中農業(yè)大學 2009
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[5]鴨疫里默氏桿菌致病相關因子研究[D]. 李繼祥.西南大學 2009
[6]二元信號轉導系統(tǒng)SalK/SalR調控高致病性2型豬鏈球菌毒力的實驗研究[D]. 李明.第三軍醫(yī)大學 2008
碩士論文
[1]豬鏈球菌2型雙組分信號轉導系統(tǒng)NisKR和BceRS對毒力調控的研究[D]. 徐娟.華中農業(yè)大學 2014
[2]豬鏈球菌2型雙組份調控系統(tǒng)CiaRH調控基因SSU052036和SSU052039的功能研究[D]. 賈志平.華中農業(yè)大學 2014
[3]胸膜肺炎放線桿菌CpxA/R雙組份調控系統(tǒng)基因缺失突變株構建及生物學特性研究[D]. 承慧.華中農業(yè)大學 2013
[4]胸膜肺炎放線桿菌雙組份調控系統(tǒng)QseB/QseC突變株構建功能研究[D]. 胡琳琳.華中農業(yè)大學 2011
[5]鴨疫里氏桿菌野生型質粒的分離、序列分析和DPP Ⅳ缺失株的構建[D]. 彭曉婭.華中農業(yè)大學 2011
[6]鴨疫里默氏桿菌特異性單克隆抗體的研制以及生物被膜和OmpA缺失株的研究[D]. 周小進.揚州大學 2010
[7]鴨疫里默氏桿菌1型磷酸二酯酶基因的發(fā)現(xiàn)及其克隆表達和應用研究[D]. 陳虹.四川農業(yè)大學 2008
[8]鴨疫里氏桿菌體內誘導抗原基因的篩選與應用研究[D]. 陳芬芬.華中農業(yè)大學 2008
[9]利用SCOTS技術篩選鴨疫里氏桿菌體內外差異表達的基因[D]. 鄭娟.華中農業(yè)大學 2008
本文編號:3239925
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