為鑒定伯恩山犬感染的眼線蟲種屬關(guān)系,采用PCR擴(kuò)增蟲體線粒體細(xì)胞色素C氧化酶第1亞基（cox1）基因。將有效序列進(jìn)行NCBI-BLAST在線比對(duì),利用MEGA6.0構(gòu)建遺傳系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果顯示,伯恩山犬眼線蟲cox1序列長度為446 bp,與結(jié)膜吸吮線蟲同源性達(dá)99%,系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示二者位于同一分支,由此確定,伯恩山犬感染的線蟲為結(jié)膜吸吮線蟲。 

【文章來源】：動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2020,41(10)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

結(jié)膜吸吮線蟲蟲體

利用MEGA6.0軟件,用相鄰法(Neighbor joining method)構(gòu)建進(jìn)化樹。比較結(jié)果表明,昆明伯恩山犬眼線蟲與基因庫中的結(jié)膜吸吮線蟲(Thelazia callipaeda)位于同一大分支,表明昆明伯恩山犬眼線蟲為結(jié)膜吸吮線蟲。6個(gè)昆明犬源分離株與AP017700均相聚在一個(gè)小分支內(nèi),再與廣東犬源(KY908320.1)、日本犬源(AB538283.1)、鄭州人源(JX069968.1)等分離株相聚,顯示出地區(qū)差異性,所有結(jié)膜吸吮線蟲分離株以100.0%的置信度聚成一支。昆明犬源結(jié)膜吸吮線蟲cox1基因序列與進(jìn)化樹中其余6株結(jié)膜吸吮線蟲cox1基因序列進(jìn)行比較,6例昆明犬源結(jié)膜吸吮線蟲cox1基因序列在426 bp處(C)不同于其余6株(T),在429 bp處(A)與其余6株堿基(T)不一致,在435 bp處(C)不同于其余6株(A)。圖3 cox1基因片段進(jìn)化樹分析

cox1基因片段進(jìn)化樹分析

【參考文獻(xiàn)】：
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