基于IGPD靶標(biāo)研究蘆丁對木糖葡萄球菌生物被膜的干預(yù)作用
發(fā)布時間:2021-06-10 16:40
木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylosus,S.xylosus)是凝固酶陰性葡萄球菌奶牛乳房炎的主要分離菌,其分離率不僅呈上升趨勢,且具有較強(qiáng)的生物被膜形成能力。生物被膜的存在能夠增強(qiáng)細(xì)菌應(yīng)對外界環(huán)境改變帶來的生存壓力,增強(qiáng)細(xì)菌耐藥性以及造成宿主的持續(xù)性感染。因此,如何干預(yù)或消除細(xì)菌生物被膜的形成成為了科研工作者關(guān)注的熱點。咪唑甘油磷酸酯脫水酶(Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase,IGPD)在木糖葡萄球菌生物被膜的形成中發(fā)揮重要作用。IGPD是L-組氨酸合成通路中重要的金屬酶之一,其廣泛存在于低等植物和微生物的細(xì)胞內(nèi),被認(rèn)為是潛在的藥物靶點。蘆丁是黃酮類藥物,具有多種藥理活性,但其能否干預(yù)木糖葡萄球菌生物被膜的形成以及干預(yù)機(jī)制尚未見報道。在本研究中,探究在木糖葡萄球菌生物被膜形成過程中,蘆丁對木糖葡萄球菌生物被膜的干預(yù)作用;基于分子對接、表面等離子共振技術(shù)和氨基酸定點突變技術(shù),闡明蘆丁是否與IGPD的某些位點結(jié)合,確定其作用靶位;探究蘆丁對hisB基因表達(dá)、IGPD蛋白表達(dá)、L-組氨酸含量、酶活性變化的影響;具體的研究結(jié)果如下...
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
細(xì)菌生物被膜的形成過程
東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)碩士學(xué)位論文咪唑甘油磷酸酯脫水酶及 L-組氨酸的研究進(jìn)展 咪唑甘油磷酸酯脫水酶的研究進(jìn)展唑甘油磷酸酯脫水酶(imidazoleglycerol phosphate dehydratase, IGPD)是一種等植物和微生物機(jī)體內(nèi)的金屬酶[34],IGPD 在細(xì)菌、低等真核生物中保守,然的機(jī)體內(nèi)卻不存在[35]。目前其具體的催化機(jī)理仍不清楚,據(jù)報道其可能的催化 所示[36]。外,IGPD 是植物以及微生物體內(nèi) L-組氨酸生物合成途徑的關(guān)鍵酶之一,在 L合成中發(fā)揮重要作用,因此通過抑制 IGPD 的活性從而阻斷 L-組氨酸的生物合使細(xì)菌死亡而不會影響到人和動物的生命安全,另外,Sinhan[37]等報道 IGPD三聚體 X 射線晶體衍射結(jié)構(gòu),為 IGPD 抑制劑的研究提供了更加有利的思路與D 成為了新的除草劑的潛在靶標(biāo)酶。
引 言黃色葡萄球菌的 IGPD 的晶體結(jié)構(gòu)為 CNS 菌屬 IGPD 的研究提供有利的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),研究中,以金黃色葡萄球菌 IGPD 為模板,通過同源模建的方法,獲得了可信度在 9糖葡萄球菌 IGPD 的三維結(jié)構(gòu)[40],木糖葡萄球菌的三維結(jié)構(gòu)如圖 1-3 所示,這對于球菌 IGPD 的抑制劑的篩選有較大的幫助。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]反枝莧乙酰乳酸合成酶與煙嘧磺隆分子結(jié)合模式分析及抗性位點預(yù)測[J]. 楊冬臣,霍靜倩,張哲,齊萌,張金林. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2019(01)
[2]基于定點突變的植物Ⅲ型聚酮合酶結(jié)構(gòu)與功能研究進(jìn)展[J]. 李星,陳默,柴團(tuán)耀,王紅. 生物工程學(xué)報. 2018(04)
[3]大環(huán)內(nèi)酯類抗生素對細(xì)菌生物被膜作用的研究進(jìn)展[J]. 丁雙元,官麗莉,馬紅霞,劉樹明. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(03)
[4]牛乳源金黃色葡萄球菌生物被膜形成與耐藥性的研究[J]. 陳程,張銳,姜興佳,吳帆,常佳偉,吉星,王曈,萬佳宏,王桂琴. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2018(06)
[5]Strategies for combating bacterial biofilm infections[J]. Hong Wu,Claus Moser,Heng-Zhuang Wang,Niels Hφiby,Zhi-Jun Song. International Journal of Oral Science. 2015(01)
[6]CMP羥甲基化酶MilA中與甲基羥化過程相關(guān)的關(guān)鍵氨基酸定點突變分析[J]. 高土玲,陳誠,趙功,鄧子新,胡申才,賀新義. 微生物學(xué)通報. 2014(01)
[7]咪唑甘油磷酸酯脫水酶與含氮雜環(huán)磷酸酯類抑制劑作用方式的分子模擬[J]. 申濤,杜鳳沛,劉婷,姚廣偉,吳崢,方萌萌,徐筱杰,路慧哲. 物理化學(xué)學(xué)報. 2011(08)
[8]分子對接方法的應(yīng)用與發(fā)展[J]. 段愛霞,陳晶,劉宏德,劉秀輝,盧小泉. 分析科學(xué)學(xué)報. 2009(04)
[9]細(xì)菌生物被膜的耐藥機(jī)制及控制策略[J]. 賈鳴,胡曉梅,胡福泉. 生命的化學(xué). 2008(03)
[10]基于氨基酸序列預(yù)測蛋白質(zhì)功能性點突變位點[J]. 宋卓,張寧,阮吉壽,楊卓,張濤. 生物物理學(xué)報. 2007(02)
博士論文
[1]碳基納米材料與生物分子相互作用的分子動力學(xué)研究[D]. 于怡.蘇州大學(xué) 2018
[2]基于IGPD靶標(biāo)探討頭孢喹肟干預(yù)木糖葡萄球菌生物被膜形成的機(jī)制[D]. 周永輝.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]基于谷氨酰胺合成酶靶標(biāo)探討紅霉素干預(yù)木糖葡萄球菌生物被膜形成的機(jī)制[D]. 楊艷北.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
碩士論文
[1]蘆丁干預(yù)S.suis生物被膜的形成及其對cps基因簇和毒力基因表達(dá)的影響[D]. 王帥.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]ALA-PDT對銅綠假單胞菌生物膜及其QS系統(tǒng)的影響的實驗研究[D]. 譚楊.第三軍醫(yī)大學(xué) 2017
[3]基于核受體靶點的小分子設(shè)計及化學(xué)生物學(xué)研究[D]. 張歡.華僑大學(xué) 2015
[4]定向進(jìn)化技術(shù)提高枯草芽孢桿菌角蛋白酶活性研究[D]. 高靜雷.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號:3222743
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
細(xì)菌生物被膜的形成過程
東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)碩士學(xué)位論文咪唑甘油磷酸酯脫水酶及 L-組氨酸的研究進(jìn)展 咪唑甘油磷酸酯脫水酶的研究進(jìn)展唑甘油磷酸酯脫水酶(imidazoleglycerol phosphate dehydratase, IGPD)是一種等植物和微生物機(jī)體內(nèi)的金屬酶[34],IGPD 在細(xì)菌、低等真核生物中保守,然的機(jī)體內(nèi)卻不存在[35]。目前其具體的催化機(jī)理仍不清楚,據(jù)報道其可能的催化 所示[36]。外,IGPD 是植物以及微生物體內(nèi) L-組氨酸生物合成途徑的關(guān)鍵酶之一,在 L合成中發(fā)揮重要作用,因此通過抑制 IGPD 的活性從而阻斷 L-組氨酸的生物合使細(xì)菌死亡而不會影響到人和動物的生命安全,另外,Sinhan[37]等報道 IGPD三聚體 X 射線晶體衍射結(jié)構(gòu),為 IGPD 抑制劑的研究提供了更加有利的思路與D 成為了新的除草劑的潛在靶標(biāo)酶。
引 言黃色葡萄球菌的 IGPD 的晶體結(jié)構(gòu)為 CNS 菌屬 IGPD 的研究提供有利的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),研究中,以金黃色葡萄球菌 IGPD 為模板,通過同源模建的方法,獲得了可信度在 9糖葡萄球菌 IGPD 的三維結(jié)構(gòu)[40],木糖葡萄球菌的三維結(jié)構(gòu)如圖 1-3 所示,這對于球菌 IGPD 的抑制劑的篩選有較大的幫助。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]反枝莧乙酰乳酸合成酶與煙嘧磺隆分子結(jié)合模式分析及抗性位點預(yù)測[J]. 楊冬臣,霍靜倩,張哲,齊萌,張金林. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報. 2019(01)
[2]基于定點突變的植物Ⅲ型聚酮合酶結(jié)構(gòu)與功能研究進(jìn)展[J]. 李星,陳默,柴團(tuán)耀,王紅. 生物工程學(xué)報. 2018(04)
[3]大環(huán)內(nèi)酯類抗生素對細(xì)菌生物被膜作用的研究進(jìn)展[J]. 丁雙元,官麗莉,馬紅霞,劉樹明. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(03)
[4]牛乳源金黃色葡萄球菌生物被膜形成與耐藥性的研究[J]. 陳程,張銳,姜興佳,吳帆,常佳偉,吉星,王曈,萬佳宏,王桂琴. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2018(06)
[5]Strategies for combating bacterial biofilm infections[J]. Hong Wu,Claus Moser,Heng-Zhuang Wang,Niels Hφiby,Zhi-Jun Song. International Journal of Oral Science. 2015(01)
[6]CMP羥甲基化酶MilA中與甲基羥化過程相關(guān)的關(guān)鍵氨基酸定點突變分析[J]. 高土玲,陳誠,趙功,鄧子新,胡申才,賀新義. 微生物學(xué)通報. 2014(01)
[7]咪唑甘油磷酸酯脫水酶與含氮雜環(huán)磷酸酯類抑制劑作用方式的分子模擬[J]. 申濤,杜鳳沛,劉婷,姚廣偉,吳崢,方萌萌,徐筱杰,路慧哲. 物理化學(xué)學(xué)報. 2011(08)
[8]分子對接方法的應(yīng)用與發(fā)展[J]. 段愛霞,陳晶,劉宏德,劉秀輝,盧小泉. 分析科學(xué)學(xué)報. 2009(04)
[9]細(xì)菌生物被膜的耐藥機(jī)制及控制策略[J]. 賈鳴,胡曉梅,胡福泉. 生命的化學(xué). 2008(03)
[10]基于氨基酸序列預(yù)測蛋白質(zhì)功能性點突變位點[J]. 宋卓,張寧,阮吉壽,楊卓,張濤. 生物物理學(xué)報. 2007(02)
博士論文
[1]碳基納米材料與生物分子相互作用的分子動力學(xué)研究[D]. 于怡.蘇州大學(xué) 2018
[2]基于IGPD靶標(biāo)探討頭孢喹肟干預(yù)木糖葡萄球菌生物被膜形成的機(jī)制[D]. 周永輝.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]基于谷氨酰胺合成酶靶標(biāo)探討紅霉素干預(yù)木糖葡萄球菌生物被膜形成的機(jī)制[D]. 楊艷北.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
碩士論文
[1]蘆丁干預(yù)S.suis生物被膜的形成及其對cps基因簇和毒力基因表達(dá)的影響[D]. 王帥.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]ALA-PDT對銅綠假單胞菌生物膜及其QS系統(tǒng)的影響的實驗研究[D]. 譚楊.第三軍醫(yī)大學(xué) 2017
[3]基于核受體靶點的小分子設(shè)計及化學(xué)生物學(xué)研究[D]. 張歡.華僑大學(xué) 2015
[4]定向進(jìn)化技術(shù)提高枯草芽孢桿菌角蛋白酶活性研究[D]. 高靜雷.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號:3222743
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