蛋殼基質(zhì)蛋白卵黃蛋白原-32基因（ovocalyxin-32, OCX-32）是影響蛋殼礦化的一種特異性基質(zhì)蛋白。為了探討蛋殼基質(zhì)蛋白OCX-32基因變異對(duì)雞蛋殼品質(zhì)的遺傳效應(yīng),本研究以長(zhǎng)順綠殼蛋雞（Gallus gallus）為素材,測(cè)定其蛋殼品質(zhì),采用PCR產(chǎn)物純化直接測(cè)序法對(duì)OCX-32基因進(jìn)行SNPs篩查,分析其對(duì)蛋殼品質(zhì)的影響。結(jié)果表明,在長(zhǎng)順綠殼蛋雞OCX-32基因中檢測(cè)到3個(gè)中度多態(tài)的SNPs位點(diǎn),分別位于內(nèi)含子1的g.22592362 C>T突變、外顯子6的g.22599114 C>T錯(cuò)義突變（蘇氨酸變?yōu)榧琢虬彼幔┖蚲.22599127 G>A同義突變,均產(chǎn)生3種基因型;g.22599114 C>T和g.22599127 G>A突變位點(diǎn)的基因型分布均偏離了Hardy-Weinberg平衡（P<0.05）。3個(gè)SNPs突變位點(diǎn)不存在強(qiáng)連鎖不平衡,共發(fā)現(xiàn)4種單倍型和10種雙倍型。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),g.22599114 C>T和g.22599127 G>A突變可引起mRNA自由能和蛋白結(jié)構(gòu)的變化,CG組合的自由能為-338.9... 

【文章來(lái)源】：農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2020,28(03)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物與器材
    1.2 引物設(shè)計(jì)
    1.3 PCR擴(kuò)增
    1.4 OCX-32基因mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
    1.5 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 OCX-32基因PCR擴(kuò)增
    2.2 OCX-32基因SNPs鑒定
    2.3 OCX-32基因SNPs位點(diǎn)部分遺傳特性分析
    2.4 OCX-32基因SNPs位點(diǎn)的連鎖不平衡、單倍型及雙倍型分析
T和g.22599127G>A位點(diǎn)對(duì)mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的影響">    2.5 OCX-32基因g.22599114 C>T和g.22599127G>A位點(diǎn)對(duì)mRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的影響
    2.6 OCX-32基因蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
    2.7 OCX-32基因SNPs位點(diǎn)與長(zhǎng)順綠殼蛋雞蛋殼品質(zhì)的關(guān)聯(lián)性分析
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]海南五指山豬TLR4基因克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 黃麗麗,張艷,劉海隆,林哲敏,譚樹(shù)義.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(08)
[2]SFRP5基因遺傳變異對(duì)長(zhǎng)順綠殼蛋雞胸肌肌肉品質(zhì)的影響[J]. 覃媛鈺,張依裕,羅華倫,吳磊.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2019(04)
[3]杜洛克豬HLCS基因組織表達(dá)分析及其編碼區(qū)多態(tài)性與剩余采食量的關(guān)聯(lián)[J]. 張躍博,蒲蕾,張金山,顏華,王立剛,侯欣華,劉欣,高紅梅,王立賢,張龍超.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(06)
[4]壽光雞GPR147基因5′調(diào)控區(qū)多態(tài)性與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 賈美婷,李顯耀,康麗,姜運(yùn)良,樊新忠,唐輝.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(01)
[5]靈昆雞視黃醇結(jié)合蛋白（CRBP4）和蛋殼基質(zhì)蛋白（OCX-32）基因多態(tài)性與產(chǎn)蛋性狀的相關(guān)性研究[J]. 張麗萍,曾濤,盧立志,劉均,周樹(shù)和,林興欽,田勇.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(10)
[6]防護(hù)林散養(yǎng)草雞不同產(chǎn)蛋期蛋形、蛋殼指數(shù)比較[J]. 楊智青,陳應(yīng)江,金崇富,丁海榮,時(shí)凱,陳長(zhǎng)寬.  畜牧獸醫(yī)雜志. 2013(06)
[7]蛋殼的形成機(jī)理及其質(zhì)量控制[J]. 袁旭紅,張玲.  畜禽業(yè). 2008(10)

博士論文
[1]雞蛋殼超微結(jié)構(gòu)與晶體結(jié)構(gòu)的測(cè)定及全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 段忠意.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017

碩士論文
[1]汶上蘆花雞蛋品質(zhì)及其候選基因遺傳效應(yīng)分析[D]. 夏佳豪.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]鴨 MyoD1、SCD1、DRD1 基因變異對(duì)肉質(zhì)和血清生化指標(biāo)的遺傳效應(yīng)研究[D]. 潘蘭兵.貴州大學(xué) 2014



本文編號(hào)：3201250