在舍飼養(yǎng)羊生產(chǎn)中,飼草料成本占總成本比例最高,約占65%⁷0%,而且隨著飼料原料價(jià)格的不斷上漲,飼草料成本也將日益增加。因此,提高綿羊飼料效率,不僅能充分利用飼草料資源,降低舍飼養(yǎng)羊的飼料成本,提高舍飼養(yǎng)羊經(jīng)濟(jì)效益,而且對(duì)于保護(hù)生態(tài)環(huán)境、實(shí)現(xiàn)可持續(xù)性發(fā)展等具有極其重要的戰(zhàn)略意義。剩余采食量（Residual feed intake,RFI）是衡量綿羊飼料利用效率的理想育種指標(biāo)。本研究在系統(tǒng)地性能測(cè)定基礎(chǔ)上,開展飼料效率相關(guān)性狀的特征和遺傳參數(shù)估計(jì)的研究,結(jié)合16S rDNA測(cè)序和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),探討綿羊RFI與瘤胃微生物區(qū)系及肝臟組織基因表達(dá)的關(guān)系。1試驗(yàn)群體構(gòu)建及飼料效率相關(guān)性狀特征分析與遺傳力估計(jì)本研究采用單欄飼養(yǎng),系統(tǒng)地測(cè)定了來自41個(gè)父系半同胞家系的207只80-180d湖羊公羔的RFI、生長性狀、胴體性狀、體組成和肌肉品質(zhì)等59個(gè)性狀（199個(gè)指標(biāo)）。結(jié)果表明:湖羊公羔在80-180d期間飼料轉(zhuǎn)化率（Feed conversion ratio,FCR）隨日齡的增長而升高,全期平均值為5.77,變異系數(shù)為10.02%,具有較高的選擇潛力。FCR、RFI、日... 

【文章來源】：蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：132 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
主要縮略詞與符號(hào)一覽表
第一章 研究背景
    1.1 引言
    1.2 飼料利用效率是綿羊的重要經(jīng)濟(jì)性狀
    1.3 RFI的測(cè)定
    1.4 RFI的影響因素
        1.4.1 采食量
        1.4.2 消化吸收
        1.4.3 體組成與新陳代謝
        1.4.4 活動(dòng)量
        1.4.5 體溫調(diào)節(jié)
    1.5 RFI的研究進(jìn)展
        1.5.1 RFI候選基因的研究
        1.5.2 RFI性狀的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究
        1.5.3 RFI的微生物菌群結(jié)構(gòu)研究
    1.6 本研究的目的與意義
第二章 育肥期湖羊公羔飼料效率相關(guān)性狀特征及遺傳參數(shù)分析
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 試驗(yàn)羊群
        2.2.2 性狀測(cè)定
        2.2.3 試驗(yàn)分組與統(tǒng)計(jì)分析
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 飼料效率相關(guān)性狀描述性統(tǒng)計(jì)量
        2.3.2 性狀間的相關(guān)性分析
        2.3.3 不同RFI湖羊公羔生長性狀的比較分析
        2.3.4 不同RFI湖羊公羔胴體性狀、體組成和肌肉品質(zhì)的比較分析
        2.3.5 育肥期湖羊公羔重要經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳力估計(jì)
    2.4 討論
    2.5 小結(jié)
第三章 不同RFI羔羊瘤胃微生物多樣性的研究
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 試驗(yàn)群體與飼養(yǎng)管理
        3.2.2 剩余采食量（Residual feed intake，RFI）和飼料轉(zhuǎn)化率（Feed conversion rate，F(xiàn)CR）的計(jì)算
        3.2.3 樣品采集
        3.2.4 試劑耗材
        3.2.5 儀器設(shè)備
        3.2.6 瘤胃內(nèi)容物DNA提取與質(zhì)量檢測(cè)
        3.2.7 16 SrDNA V3-V4區(qū)PCR擴(kuò)增子測(cè)序
        3.2.8 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 DNA樣品及16S V3-V4區(qū)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物質(zhì)量
        3.3.2 16 SrDNA V3-V4 測(cè)序數(shù)據(jù)量與質(zhì)量
        3.3.3 Alpha多樣性分析
        3.3.4 Beta多樣性分析
        3.3.5 羔羊瘤胃微生物組成及功能富集分析
        3.3.6 不同RFI羔羊瘤胃微生物區(qū)系差異分析
        3.3.7 差異微生物的LEfSe及功能富集分析
    3.4 討論
    3.5 小結(jié)
第四章 極端RFI羔羊肝臟組織轉(zhuǎn)錄組分析
    4.1 前言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 組織樣品
        4.2.2 試劑耗材
        4.2.3 儀器設(shè)備
        4.2.4 肝臟組織總RNA的提取與檢測(cè)
        4.2.5 mRNA測(cè)序
    4.3 結(jié)果與分析
        4.3.1 總RNA的提取與質(zhì)量檢測(cè)
        4.3.2 原始數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制
        4.3.3 Clean reads與參考基因組的比對(duì)
        4.3.4 Reads在各個(gè)染色體上的密度分布情況
        4.3.5 樣品間表達(dá)相關(guān)性檢查
        4.3.6 差異表達(dá)mRNA轉(zhuǎn)錄本分析
        4.3.7 差異表達(dá)基因的KEGG富集分析
        4.3.8 差異表達(dá)基因的Q-PCR驗(yàn)證
    4.4 討論
    4.5 小結(jié)
第五章 差異表達(dá)基因的SNPs掃描及其與飼料效率性狀的關(guān)聯(lián)分析
    5.1 前言
    5.2 材料與方法
        5.2.1 試驗(yàn)群體
        5.2.2 性狀測(cè)定
        5.2.3 樣品采集與DNA提取
        5.2.4 SNPs掃描與基因型檢測(cè)
        5.2.5 基因型與飼料轉(zhuǎn)化率的關(guān)聯(lián)分析
    5.3 結(jié)果與分析
        5.3.1 試驗(yàn)群體DNA質(zhì)量與濃度
        5.3.2 綿羊ADRA2A和 RYR2 基因目的片段的PCR擴(kuò)增
        5.3.3 綿羊ADRA2A和 RYR2 基因SNPs掃描
        5.3.4 綿羊ADRA2A和 RYR2 基因SNPs檢測(cè)及其與飼料轉(zhuǎn)化率的關(guān)聯(lián)分析
    5.4 討論
        5.4.1 KASPar SNP分型技術(shù)
        5.4.2 綿羊ADRA2A和 RYR2 基因與飼料轉(zhuǎn)化率
    5.5 小結(jié)
第六章 全文小結(jié)
    6.1 主要結(jié)論
    6.2 創(chuàng)新點(diǎn)
    6.3 研究展望
參考文獻(xiàn)
在學(xué)期間的研究成果
致謝
附錄


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]北京鴨RFI性狀遺傳參數(shù)分析及應(yīng)用研究[D]. 張?jiān)粕?西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]組學(xué)技術(shù)研究亞急性瘤胃酸中毒對(duì)奶牛瘤胃微生物、代謝和上皮功能的影響[D]. 張瑞陽.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015

碩士論文
[1]豬PPARGC1A基因在不同組織和生長發(fā)育階段中的差異表達(dá)[D]. 閔小紅.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008



本文編號(hào)：3180611