高致病性藍耳。≒RRS)抗性基因標記的篩選及其分子標記檢測試劑盒的研制
發(fā)布時間:2021-05-10 13:53
豬繁殖與呼吸綜合征(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome, PRRS)是目前養(yǎng)豬業(yè)危害最大、控制最難的傳染病之一。疫苗免疫、藥物治療以及營養(yǎng)保健等措施雖然在一定程度上控制了該病的蔓延,但是因為其病原(藍耳病病毒,PRRSV)存在較強的遺傳變異性、且能逃脫宿主免疫機制等特點,難以有效地控制該病的發(fā)生。因此,近年來有關抗病育種研究和提高豬自身抗病力也成為藍耳病防治的一個新發(fā)展方向。本研究主要研究內容包括,(1)分析五個基因(MBL2、DUSP1、GBP2、Mx1、 NID2)的不同基因型分別在不同豬群中的頻率及其藍耳病發(fā)病相對風險率、不同基因型母豬在藍耳病爆發(fā)期間的產死仔率(含死胎、木乃伊);(2)以本小組前期篩選獲得的與藍耳病發(fā)病相對風險率相關的CD169基因C1654A變異位點為對象,初步研制了一個針對該位點的檢測試劑盒。本研究的目的在于:(1)篩選與藍耳病抗性相關的分子標記;(2)研制出相應的分子標記檢測試劑盒,為將來分子輔助選擇育種打下基礎。本研究的主要研究結果如下:1、建立了MBL2基因外顯子6中A295G突變位點的AS-PC...
【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表(Abbreviation words)
第一章 文獻綜述
1 前言
2 PRRS流行動態(tài)
2.1 國內外流行特點
2.2 PRRSV傳播方式
2.3 PRRS的防治措施
3 抗病育種的研究進展
3.1 抗病育種的意義
3.2 抗病機理
3.3 抗病育種的遺傳基礎
3.4 抗病育種的措施
3.5 抗病候選基因的研究進展
4 基因多態(tài)性分析的方法
4.1 SNP
4.2 PCR-RFLP
4.3 AS-PCR
第二章 研究目的與意義
第三章 材料與方法
1 試驗材料
1.1 實驗豬群及樣本采集
1.2 性狀記錄
2 主要儀器及設備
3 主要試劑及配制
3.1 常用試劑
3.2 主要試劑的配制
3.3 Taq酶、回收試劑盒、測序和限制性內切酶
4 試驗方法
4.1 豬基因組中提取DNA
4.2 基因組DNA質量和濃度的檢測
4.3 主要分子生物學軟件和數(shù)據統(tǒng)計分析軟件
4.4 PCR引物的稀釋
4.5 AS-PCR反應體系及反應程序
4.6 PCR-RFLP分析
4.7 PCR產物的回收測序
5 分子標記的統(tǒng)計分析方法
5.1 等位基因頻率和基因型頻率
5.2 各基因型發(fā)病風險度分析
6 五個候選基因SNP篩選及其檢測
6.1 豬MBL2基因SNP位點檢測
6.2 豬DUSP1基因SNP位點檢測
6.3 豬GBP2基因SNP位點檢測
6.4 豬Mx1基因SNP位點檢測
6.5 豬NID2基因SNP位點檢測
7 藍耳病抗性分子標記(SNP)檢測試劑盒的研制
7.1 試劑組分的探討
7.2 試劑保質期的探討
7.3 試劑盒特異性的分析
7.4 試劑盒靈敏度的分析
7.5 試劑盒的外包裝和內容
7.6 試劑盒的操作使用說明
第四章 結果與分析
1 豬五個候選基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
1.1 豬MBL2基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
1.2 豬DUSP1基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
1.3 豬GBP2基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
1.4 豬Mx1基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
1.5 豬NID2基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
2 藍耳病抗性分子標記(SNP)檢測試劑盒的研制
2.1 試劑盒組分探索試驗及保質期的探討
2.2 試劑盒特異性的分析
2.3 試劑盒靈敏度檢測的探討
2.4 試劑盒的外包裝和內容
2.5 試劑盒操作說明書的擬定
第五章 討論
1 關于藍耳病抗性SNPs的篩選
1.1 實驗材料以及方法的分析
1.2 候選基因多態(tài)性與豬藍耳病抗性的關聯(lián)分析
2 關于藍耳病抗性分子標記檢測試劑盒的分析
2.1 藍耳病抗性分子標記檢測試劑盒研制的前景
2.2 關于試劑盒的性能
3 小結
3.1 本研究的主要結果結論
3.2 本研究的創(chuàng)新點
3.3 本研究的不足之處與下一步計劃
參考文獻
在校期間發(fā)表文章
附錄
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]唾液酸黏附素SN及其介導PRRSV感染豬肺泡巨噬細胞的研究進展[J]. 任鈺為,江一波,張淑君. 湖北農業(yè)科學. 2011(11)
[2]ESR和RYR1基因的多態(tài)性在監(jiān)利豬、大白豬及雜交大監(jiān)豬群中分布特征的探討[J]. 劉文舉,左本武,何年華,劉俊,劉洪彬,陳勝波,龔曉玲,余思義,童勤,余勇,王成,張淑君. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2009(01)
[3]野豬和16個國內外豬種Mx1基因第14外顯子多態(tài)性分析[J]. 吳圣龍,包文斌,鞠慧萍,丁浩,李碧春,朱國強,陳國宏. 畜牧獸醫(yī)學報. 2008(03)
[4]雞MHC基因多態(tài)性與抗病性狀的相關性研究進展[J]. 李國勤,盧立志,王得前,沈軍達,陶爭榮,趙愛珍,原愛平. 農業(yè)生物技術學報. 2006(01)
[5]片段長度差異等位基因特異性PCR—一種改良的SNP分型新方法[J]. 黃代新,楊慶恩,趙貴森. 法醫(yī)學雜志. 2005(01)
[6]等位基因特異性引物PCR技術及其應用研究[J]. 馬厚勛,牛永紅,李章勇,謝正祥. 生物技術. 2005(01)
[7]PRRS病毒傳播方式的新研究結果[J]. 李希林,Scott Dee. 國外畜牧學(豬與禽). 2004(02)
[8]畜禽某些疾病的遺傳控制與抗病育種[J]. 施啟順. 中國畜牧雜志. 2004(02)
[9]奶牛MHC基因多態(tài)性及其與經濟性狀關系的研究進展[J]. 葉素成,儲明星,陳國宏. 遺傳. 2003(01)
[10]第22種氨基酸和無義密碼子的重新詮釋[J]. 明鎮(zhèn)寰,鐘立人. 生物化學與生物物理進展. 2002(06)
碩士論文
[1]荷斯坦奶牛隱性遺傳疾病檢測技術的建立及產奶性狀相關分子標記的篩選[D]. 王成.華中農業(yè)大學 2010
[2]豬五個功能基因變異及其抗病遺傳效應的研究[D]. 劉文舉.華中農業(yè)大學 2009
[3]細菌對磺胺類藥物耐藥基因三重PCR檢測試劑盒研制與應用[D]. 周萬蓉.四川農業(yè)大學 2007
[4]綿羊MHC基因微衛(wèi)星多態(tài)性及其與生產性狀關系的研究[D]. 李建平.山東農業(yè)大學 2006
本文編號:3179478
【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表(Abbreviation words)
第一章 文獻綜述
1 前言
2 PRRS流行動態(tài)
2.1 國內外流行特點
2.2 PRRSV傳播方式
2.3 PRRS的防治措施
3 抗病育種的研究進展
3.1 抗病育種的意義
3.2 抗病機理
3.3 抗病育種的遺傳基礎
3.4 抗病育種的措施
3.5 抗病候選基因的研究進展
4 基因多態(tài)性分析的方法
4.1 SNP
4.2 PCR-RFLP
4.3 AS-PCR
第二章 研究目的與意義
第三章 材料與方法
1 試驗材料
1.1 實驗豬群及樣本采集
1.2 性狀記錄
2 主要儀器及設備
3 主要試劑及配制
3.1 常用試劑
3.2 主要試劑的配制
3.3 Taq酶、回收試劑盒、測序和限制性內切酶
4 試驗方法
4.1 豬基因組中提取DNA
4.2 基因組DNA質量和濃度的檢測
4.3 主要分子生物學軟件和數(shù)據統(tǒng)計分析軟件
4.4 PCR引物的稀釋
4.5 AS-PCR反應體系及反應程序
4.6 PCR-RFLP分析
4.7 PCR產物的回收測序
5 分子標記的統(tǒng)計分析方法
5.1 等位基因頻率和基因型頻率
5.2 各基因型發(fā)病風險度分析
6 五個候選基因SNP篩選及其檢測
6.1 豬MBL2基因SNP位點檢測
6.2 豬DUSP1基因SNP位點檢測
6.3 豬GBP2基因SNP位點檢測
6.4 豬Mx1基因SNP位點檢測
6.5 豬NID2基因SNP位點檢測
7 藍耳病抗性分子標記(SNP)檢測試劑盒的研制
7.1 試劑組分的探討
7.2 試劑保質期的探討
7.3 試劑盒特異性的分析
7.4 試劑盒靈敏度的分析
7.5 試劑盒的外包裝和內容
7.6 試劑盒的操作使用說明
第四章 結果與分析
1 豬五個候選基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
1.1 豬MBL2基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
1.2 豬DUSP1基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
1.3 豬GBP2基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
1.4 豬Mx1基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
1.5 豬NID2基因SNP及其藍耳病抗性遺傳效應的分析
2 藍耳病抗性分子標記(SNP)檢測試劑盒的研制
2.1 試劑盒組分探索試驗及保質期的探討
2.2 試劑盒特異性的分析
2.3 試劑盒靈敏度檢測的探討
2.4 試劑盒的外包裝和內容
2.5 試劑盒操作說明書的擬定
第五章 討論
1 關于藍耳病抗性SNPs的篩選
1.1 實驗材料以及方法的分析
1.2 候選基因多態(tài)性與豬藍耳病抗性的關聯(lián)分析
2 關于藍耳病抗性分子標記檢測試劑盒的分析
2.1 藍耳病抗性分子標記檢測試劑盒研制的前景
2.2 關于試劑盒的性能
3 小結
3.1 本研究的主要結果結論
3.2 本研究的創(chuàng)新點
3.3 本研究的不足之處與下一步計劃
參考文獻
在校期間發(fā)表文章
附錄
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]唾液酸黏附素SN及其介導PRRSV感染豬肺泡巨噬細胞的研究進展[J]. 任鈺為,江一波,張淑君. 湖北農業(yè)科學. 2011(11)
[2]ESR和RYR1基因的多態(tài)性在監(jiān)利豬、大白豬及雜交大監(jiān)豬群中分布特征的探討[J]. 劉文舉,左本武,何年華,劉俊,劉洪彬,陳勝波,龔曉玲,余思義,童勤,余勇,王成,張淑君. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2009(01)
[3]野豬和16個國內外豬種Mx1基因第14外顯子多態(tài)性分析[J]. 吳圣龍,包文斌,鞠慧萍,丁浩,李碧春,朱國強,陳國宏. 畜牧獸醫(yī)學報. 2008(03)
[4]雞MHC基因多態(tài)性與抗病性狀的相關性研究進展[J]. 李國勤,盧立志,王得前,沈軍達,陶爭榮,趙愛珍,原愛平. 農業(yè)生物技術學報. 2006(01)
[5]片段長度差異等位基因特異性PCR—一種改良的SNP分型新方法[J]. 黃代新,楊慶恩,趙貴森. 法醫(yī)學雜志. 2005(01)
[6]等位基因特異性引物PCR技術及其應用研究[J]. 馬厚勛,牛永紅,李章勇,謝正祥. 生物技術. 2005(01)
[7]PRRS病毒傳播方式的新研究結果[J]. 李希林,Scott Dee. 國外畜牧學(豬與禽). 2004(02)
[8]畜禽某些疾病的遺傳控制與抗病育種[J]. 施啟順. 中國畜牧雜志. 2004(02)
[9]奶牛MHC基因多態(tài)性及其與經濟性狀關系的研究進展[J]. 葉素成,儲明星,陳國宏. 遺傳. 2003(01)
[10]第22種氨基酸和無義密碼子的重新詮釋[J]. 明鎮(zhèn)寰,鐘立人. 生物化學與生物物理進展. 2002(06)
碩士論文
[1]荷斯坦奶牛隱性遺傳疾病檢測技術的建立及產奶性狀相關分子標記的篩選[D]. 王成.華中農業(yè)大學 2010
[2]豬五個功能基因變異及其抗病遺傳效應的研究[D]. 劉文舉.華中農業(yè)大學 2009
[3]細菌對磺胺類藥物耐藥基因三重PCR檢測試劑盒研制與應用[D]. 周萬蓉.四川農業(yè)大學 2007
[4]綿羊MHC基因微衛(wèi)星多態(tài)性及其與生產性狀關系的研究[D]. 李建平.山東農業(yè)大學 2006
本文編號:3179478
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