2018年四川地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒ORF5基因的分子流行病學(xué)調(diào)查研究
發(fā)布時(shí)間:2021-05-08 08:51
為研究四川地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)的流行及進(jìn)化趨勢(shì),本研究以GP5蛋白為研究對(duì)象,對(duì)2018年間收集的378份四川省不同區(qū)市縣PRRSV疑似病料進(jìn)行了實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè),并對(duì)部分毒株ORF5基因的核苷酸序列和推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行進(jìn)化分析和N-糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)。通過疑似病料實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè),共檢出陽性樣品69份,陽性率為18.25%。對(duì)其中23株P(guān)RRSV的ORF5基因序列分析結(jié)果顯示,ORF5基因之間核苷酸同源性為81.6%~100%,推導(dǎo)的氨基酸同源性為81.4%~100%,均屬于美洲型毒株。其中,1株屬于以經(jīng)典毒株VR2332為代表的亞型Ⅰ,17株屬于以高致病毒株JXA1為代表的亞型Ⅱ,5株屬于重組毒株NADC30為代表的亞型Ⅲ,說明2018年間四川省PRRSV流行毒株存在基因多樣性,HP-PRRSV依然是主要流行毒株,但仍存在不斷進(jìn)化的經(jīng)典毒株,同時(shí),類似NADC30和QYYZ的重組毒株也開始出現(xiàn)。通過氨基酸突變位點(diǎn)和N-糖基化位點(diǎn)分析發(fā)現(xiàn),23株P(guān)RRSV在GP5兩個(gè)重要抗原表位相關(guān)區(qū)域和毒力相關(guān)位點(diǎn)均發(fā)生了一定程度的突變,推測(cè)這些突變可能影響了病毒逃避...
【文章來源】:中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2020,47(04)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 病料采集
1.1.2 主要試劑及儀器
1.2 RNA提取與反轉(zhuǎn)錄
1.3 PRRSV熒光定量PCR檢測(cè)
1.4 ORF5基因的擴(kuò)增
1.5 ORF5基因遺傳進(jìn)化分析
1.6 GP5蛋白糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
2 結(jié) 果
2.1 PRRSV的實(shí)時(shí)熒光定量PCR鑒定
2.2 陽性樣品ORF5基因測(cè)序結(jié)果
2.3 ORF5基因的核苷酸序列同源性分析
2.4 基于ORF5基因推導(dǎo)的氨基酸序列同源性分析
2.5 基于ORF5基因核苷酸序列的PRRSV遺傳進(jìn)化分析
2.6 氨基酸突變位點(diǎn)分析
2.7 GP5蛋白潛在N-糖基化位點(diǎn)變化分析
3 討 論
4 結(jié) 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬系統(tǒng)性疾病的流行現(xiàn)狀與防控措施[J]. 陳煥春. 北方牧業(yè). 2017(11)
[2]PRRSV野毒感染豬群免疫接種弱毒活疫苗的效果分析[J]. 許心婷,施開創(chuàng),李常挺,龍飛翔,莫?jiǎng)偬m,陳漢忠. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2016(09)
[3]豬繁殖與呼吸綜合征病毒及疫苗的研究進(jìn)展[J]. 譚偉,鄧顯文,謝芝勛. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2014(06)
[4]豬繁殖與呼吸綜合征病毒GP5蛋白糖基化位點(diǎn)缺失突變株的構(gòu)建[J]. 張輝,王光利,徐大勇,李峰,徐爭(zhēng)輝. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2012(05)
[5]4種豬繁殖障礙性疫病流行病學(xué)調(diào)研與分析[J]. 韓一超,吳忻,姚敬明,王娟萍,武守艷,孟帆,雷宇平,陳劍波,劉文俊,焦福林,樊振華,米瑞娟. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2011(11)
本文編號(hào):3175041
【文章來源】:中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2020,47(04)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 病料采集
1.1.2 主要試劑及儀器
1.2 RNA提取與反轉(zhuǎn)錄
1.3 PRRSV熒光定量PCR檢測(cè)
1.4 ORF5基因的擴(kuò)增
1.5 ORF5基因遺傳進(jìn)化分析
1.6 GP5蛋白糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
2 結(jié) 果
2.1 PRRSV的實(shí)時(shí)熒光定量PCR鑒定
2.2 陽性樣品ORF5基因測(cè)序結(jié)果
2.3 ORF5基因的核苷酸序列同源性分析
2.4 基于ORF5基因推導(dǎo)的氨基酸序列同源性分析
2.5 基于ORF5基因核苷酸序列的PRRSV遺傳進(jìn)化分析
2.6 氨基酸突變位點(diǎn)分析
2.7 GP5蛋白潛在N-糖基化位點(diǎn)變化分析
3 討 論
4 結(jié) 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬系統(tǒng)性疾病的流行現(xiàn)狀與防控措施[J]. 陳煥春. 北方牧業(yè). 2017(11)
[2]PRRSV野毒感染豬群免疫接種弱毒活疫苗的效果分析[J]. 許心婷,施開創(chuàng),李常挺,龍飛翔,莫?jiǎng)偬m,陳漢忠. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2016(09)
[3]豬繁殖與呼吸綜合征病毒及疫苗的研究進(jìn)展[J]. 譚偉,鄧顯文,謝芝勛. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2014(06)
[4]豬繁殖與呼吸綜合征病毒GP5蛋白糖基化位點(diǎn)缺失突變株的構(gòu)建[J]. 張輝,王光利,徐大勇,李峰,徐爭(zhēng)輝. 中國(guó)獸醫(yī)科學(xué). 2012(05)
[5]4種豬繁殖障礙性疫病流行病學(xué)調(diào)研與分析[J]. 韓一超,吳忻,姚敬明,王娟萍,武守艷,孟帆,雷宇平,陳劍波,劉文俊,焦福林,樊振華,米瑞娟. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2011(11)
本文編號(hào):3175041
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