蒙古馬是我國五大固有類型馬品種之一,在長時間的自然選擇以及人工選育條件下,逐漸形成了適應極端惡劣氣候、耐粗飼、抗病和持久力強等特性。相比其他馬品種,耐力性能極為突出,適合長距離賽事。國外對速度型賽馬純血馬開展了大量運動學研究工作,而對蒙古馬的運動學生理機制尚不明確。本研究選取6匹蒙古馬為實驗對象,用Miseq高通量測序技術對短期高負荷運動前后蒙古馬的骨骼肌進行轉錄組測序和生物信息學分析。在專業(yè)騎手的騎乘下全速奔跑20 mins,分別在短期高負荷奔跑前與奔跑后活體采取骨骼肌組織,用Miseq高通量測序技術對樣本建立轉錄組文庫,并與純血馬基因組序列比對,進行差異表達基因分析及GO功能富集和KEGG pathway分析。結果顯示:從轉錄組數(shù)據(jù)庫中得到25367個SNP位點,其中1號和11號染色體SNP數(shù)目最多;另外還發(fā)現(xiàn)了4種可變剪接類型,其中外顯子跳躍類型最多。短期高負荷運動后比運功前可變剪接數(shù)量明顯提高。運動前后兩組中共檢測到205個顯著性差異表達基因（P<0.05）,120個基因上調,85個基因下調;GO功能富集分析結果顯示,77%的差異表達基因富集于生物學過程、7.7%富集于細... 

【文章來源】：內蒙古農(nóng)業(yè)大學內蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：53 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
縮略語表
1 引言
    1.1 馬屬動物簡介
    1.2 蒙古馬運動性能
    1.3 純血馬運動性能
    1.4 馬運動基因研究進展
    1.5 轉錄組測序及Miseq測序技術
        1.5.1 轉錄組
        1.5.2 轉錄組測序技術
        1.5.3 Miseq測序平臺
        1.5.4 轉錄組測序在馬運動學領域的應用
2 試驗主要內容、目的及意義
    2.1 試驗目的和意義
    2.2 試驗主要內容與技術路線
3 蒙古馬短期高負荷運動前后轉錄組文庫構建及測序分析
    3.1 試驗材料
        3.1.1 試驗樣本
        3.1.2 實驗試劑耗材
        3.1.3 實驗儀器設備
        3.1.4 試驗主要數(shù)據(jù)庫和分析軟件
    3.2 試驗方法
        3.2.1 肌肉總RNA的提取
        3.2.2 檢測總RNA的完整性
        3.2.3 骨骼肌總RNA反轉錄合成cDNA
        3.2.4 實時熒光定量PCR反應體系
        3.2.5 轉錄組高通量測序文庫制備
        3.2.6 測序數(shù)據(jù)質量控制及序列比對
        3.2.7 基因差異表達分析
        3.2.8 差異基因的功能分析
        3.2.9 SNP統(tǒng)計與可變剪切分析
    3.3 結果與分析
        3.3.1 RNA質量檢測與原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質量評估
        3.3.2 與參考基因組比對
        3.3.3 SNP與可變剪切分析
        3.3.4 差異表達序列的篩選
        3.3.5 相關性分析
        3.3.6 編碼蛋白的差異表達分析
        3.3.7 蒙古馬短期高負荷運動前后差異表達基因的實時定量檢測
        3.3.8 差異基因的GeneOntology功能富集分析
        3.3.9 差異基因KEGGPathway及KO富集分析
4 討論
5 結論
致謝
參考文獻
作者簡介


【參考文獻】：
期刊論文
[1]蒙古馬高負荷運動訓練前后轉錄組差異表達分析[J]. 趙啟南,芒來,白東義,趙一萍,李蓓,烏尼爾夫,烏英嘎,蘇日嘎,敖乳嘎.  畜牧獸醫(yī)學報. 2017(06)
[2]馬屬動物進化特征概述[J]. 任秀娟,趙一萍,薩如拉,鮑紅梅,王希生,道楞,阿娜爾,魏睿元,蘇日嘎,彩麗干,白東義,李蓓,楊麗華,烏尼爾夫,芒來.  畜牧獸醫(yī)學報. 2017(03)
[3]伊犁馬DMRT3基因多態(tài)性研究[J]. 何美升,于茜,高程程,曹行,馬海玉,劉玲玲,姜鑫,劉武軍.  新疆農(nóng)業(yè)科學. 2017(01)
[4]耐力訓練對糖尿病糖脂代謝相關因子基因表達的影響[J]. 邵月.  中國老年學雜志. 2014(11)
[5]轉錄組與RNA-Seq技術[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀志賓,王建民.  生物技術通報. 2012(12)
[6]PGC-1α在骨骼肌運動、代謝調節(jié)中的作用[J]. 烏日古木拉,楊麗華,高雅汗,芒來.  畜牧獸醫(yī)科技信息. 2011(12)
[7]蒙古馬肌酸激酶基因多態(tài)性和不同運動時期表達量的研究[J]. 楊麗華,白東義,烏日古木拉,高雅罕,黃金龍,趙啟楠,芒來.  畜牧與獸醫(yī). 2011(12)
[8]Cyr61基因的生物學功能及在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的作用[J]. 喬英,郭瑞芳,呂有勇.  內蒙古醫(yī)學雜志. 2011(02)
[9]肌球蛋白輕鏈的調節(jié)及其對腫瘤細胞增殖、轉移的影響[J]. 王叢陽,王輝,沈傳陸.  醫(yī)學綜述. 2010(21)
[10]不同品種豬背最長肌eIF4E、PPARGC-1、VEGFA和C-Jun mRNA豐度比較研究[J]. 楊舟,王修啟.  華北農(nóng)學報. 2010(S1)

博士論文
[1]蒙古馬高負荷運動訓練前后轉錄組與miRNA文庫特征及關聯(lián)分析[D]. 趙啟南.內蒙古農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]EGFR信號通路通過Egr2促進骨祖細胞增殖并抑制骨祖細胞凋亡的實驗性研究[D]. 蘭生輝.華中科技大學 2012
[3]蒙古馬MSTN基因克隆及序列分析和部分品種多態(tài)性研究[D]. 王全喜.內蒙古農(nóng)業(yè)大學 2005

碩士論文
[1]訓練對蒙古馬肌肉發(fā)育相關基因MyoG的表達量影響研究[D]. 敖乳嘎.內蒙古農(nóng)業(yè)大學 2016
[2]六個品種馬CKM基因遺傳多樣性研究[D]. 姚全福.內蒙古農(nóng)業(yè)大學 2010



本文編號：3170660