本研究旨在探討西藏高原放牧藏豬、舍飼藏豬與瘦肉型豬（杜×長×大,DLY豬）盲腸微生物的群落組成及多樣性,從而部分揭示西藏高原藏豬腸道微生物的特異性。選用日齡相近的放牧藏豬、舍飼藏豬及DLY豬各5頭,放牧藏豬由林芝本地農(nóng)牧民采用傳統(tǒng)方式放牧養(yǎng)殖,舍飼藏豬及DLY豬圈養(yǎng)并飼喂相同飼糧,160日齡時前腔靜脈放血屠宰,采集盲腸食糜于液氮速凍待測。采用高通量測序技術(shù)測定樣品16S rRNA V3-V4區(qū)域的基因序列。結(jié)果表明,在15個樣本的16S rRNA基因V3-V4區(qū)測序共獲得了659 904條有效序列,其中放牧藏豬213 031條、舍飼藏豬219 417條、DLY豬227 456條。放牧藏豬盲腸微生物OTU總數(shù)、Chao1指數(shù)、ACE指數(shù)及香農(nóng)（Shannon）指數(shù)均顯著高于舍飼藏豬與DLY豬（P<0.05）,而舍飼藏豬與DLY豬無顯著差異（P>0.05）。3個類型豬盲腸微生物共劃分為13個門,56個屬。厚壁菌門（Firmicutes）是3個類型豬相對豐度共同最高的門。放線菌門（Actinobacteria）與疣微菌門（Verrucomicrobia）在放牧藏豬中相對豐度顯著高... 

【文章來源】：畜牧獸醫(yī)學報. 2020,51(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗動物
    1.2 屠宰采樣
    1.3 總DNA提取
    1.4 PCR擴增
    1.5 文庫制備及測序
    1.6 測序信息分析
2 結(jié) 果
    2.1 盲腸微生物群落的豐富度及多樣性分析
    2.2 盲腸微生物群落分類學組成分析
    2.3 盲腸微生物群落組成聚類分析
3 討 論
4 結(jié) 論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]利用宏基因組學鑒定藏豬腹瀉糞便病毒種群[J]. 胡承哲,周群,李玉,張敏,湯承,張斌.  畜牧獸醫(yī)學報. 2019(12)
[2]飼糧能量水平對斷奶藏仔豬生產(chǎn)性能、養(yǎng)分消化率和血液生化指標的影響[J]. 譚占坤,張定華,商鵬,劉鎖珠,強巴央宗,張健,董亞南.  西南農(nóng)業(yè)學報. 2017(07)
[3]藏豬糞樣微生物對不同纖維底物的體外發(fā)酵[J]. 劉鎖珠,李龍,付冠華,王利紅,強巴央宗,李家奎.  中國獸醫(yī)學報. 2017(07)
[4]藏豬耐粗飼特性及其生化機理研究[J]. 李江凌,陳曉暉,劉銳,王秋實,曾凱,廖黨金,高榮,呂學斌.  中國豬業(yè). 2015(02)
[5]藏豬食草機理的研究——藏豬腸道微生物的多樣性分析[J]. 肖文萍,劉海艷,趙海波,白龍,彭甲銀,劉雪青,王建剛,宋宇軒,曹斌云.  中國獸醫(yī)學報. 2013(03)

博士論文
[1]藏豬腸道細菌群落組成與纖維素分解菌的研究[D]. 楊偉平.西北農(nóng)林科技大學 2015



本文編號：3157358