雞肝臟和骨骼肌miRNA表達(dá)和功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-04 13:34
肝臟代謝和骨骼肌發(fā)育是雞十分重要的兩個(gè)生物過程,microRNA(miRNA)是一類小的非編碼的約22個(gè)核苷酸長度的單鏈RNA分子,是基因表達(dá)的重要調(diào)控因子,其對肝臟代謝和骨骼肌發(fā)育發(fā)揮了重要的作用。本研究以雞肝臟和骨骼肌miRNA為研究對象,對其進(jìn)行了一系列的表達(dá)和功能研究,主要研究結(jié)果如下:(1)運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測miR-122的組織表達(dá),發(fā)現(xiàn)其在肝臟中表達(dá)量最高。運(yùn)用靶基因預(yù)測軟件預(yù)測出364個(gè)miR-122的靶基因,挑選其中與肝臟代謝相關(guān)的預(yù)測靶基因P4HA1、PKM2、TGF-β3、FABP5和ARCN1。實(shí)時(shí)熒光定量PCR顯示miR-122在肝臟生長發(fā)育過程中上調(diào),在雞肝細(xì)胞離體培養(yǎng)過程中下調(diào),5個(gè)基因在肝臟生長發(fā)育過程中表達(dá)不受影響,P4HA1、TGF-β3和ARCN1在肝細(xì)胞離體過程中下調(diào),而FABP5在離體和培養(yǎng)過程中分別下調(diào)和上調(diào),PKM2不受影響。體外雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)和靶位點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn)證明5個(gè)基因及預(yù)測靶位點(diǎn)分別是miR-122的靶基因和靶位點(diǎn),通過雞細(xì)胞系過表達(dá)miR-122證明其對TGF-β3的調(diào)控在mRNA水平,而對P4HA1、PKM2和ARCN1的...
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:144 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 肝臟和肌肉中miRNA研究進(jìn)展
1.1.1 miRNA的生物合成、作用機(jī)制和靶基因鑒定
1.1.2 miR-122
1.1.3 miR-126
1.1.4 miR-1a
1.1.5 miR-133a
1.2 畜禽miRNA研究進(jìn)展
1.2.1 牛miRNA
1.2.2 雞miRNA
1.2.3 豬miRNA
1.2.4 羊miRNA
1.2.5 畜禽miRNA研究展望
1.3 miRNA相關(guān)研究技術(shù)
1.3.1 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.3.2 miRNA靶基因預(yù)測
1.3.3 miRNA靶基因驗(yàn)證
1.3.4 高通量測序
1.3.5 RNA干擾
1.4 本研究的目的及意義
2 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.4 實(shí)驗(yàn)引物及核酸
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 miRNA及基因表達(dá)分析
2.2.2 miRNA靶基因驗(yàn)證
2.2.3 抑制miR-122的原代雞肝細(xì)胞基因分析
2.2.4 TGF-β3 RNAi
2.2.5 GH處理的原代雞肝細(xì)胞miRNA測序
2.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 雞miR-122功能研究
3.1.0 miR-122組織表達(dá)特征
3.1.1 miR-122靶基因預(yù)測
3.1.2 miR-122及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞肝臟中表達(dá)特征
3.1.3 miR-122及靶基因在原代雞肝細(xì)胞中表達(dá)特征
3.1.4 miR-122靶基因驗(yàn)證
3.1.5 抑制miR-122的原代雞肝細(xì)胞基因表達(dá)研究
3.1.6 干擾TGF-β3的原代雞肝細(xì)胞基因表達(dá)研究
3.2 雞miR-126功能研究
3.2.1 miR-126組織表達(dá)特征
3.2.2 miR-126靶基因預(yù)測
3.2.3 miR-126及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞肝臟中表達(dá)特征
3.2.4 miR-126及靶基因在原代雞肝細(xì)胞中表達(dá)特征
3.2.5 miR-126靶基因驗(yàn)證
3.3 GH處理的原代雞肝細(xì)胞miRNA表達(dá)研究
3.3.1 GH處理原代雞肝細(xì)胞后IGF-I表達(dá)升高
3.3.2 GH處理的原代雞肝細(xì)胞miRNA測序研究
3.4 雞miR-1a功能研究
3.4.1 miR-1a組織表達(dá)特征
3.4.2 miR-1a靶基因預(yù)測
3.4.3 miR-1a及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞骨骼肌中表達(dá)特征
3.4.4 miR-1a靶基因驗(yàn)證
3.5 雞miR-133a功能研究
3.5.1 miR-133a組織表達(dá)特征
3.5.2 miR-133a靶基因預(yù)測
3.5.3 miR-133a及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞骨骼肌中表達(dá)特征
3.5.4 miR-133a靶基因驗(yàn)證
4 討論
4.1 雞miR-122功能研究
4.1.1 miR-122組織表達(dá)特征
4.1.2 miR-122靶基因預(yù)測
4.1.3 miR-122及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞肝臟中表達(dá)特征
4.1.4 miR-122及靶基因在原代雞肝細(xì)胞中表達(dá)特征
4.1.5 miR-122靶基因驗(yàn)證
4.1.6 抑制miR-122的原代雞肝細(xì)胞基因表達(dá)研究
4.1.7 干擾TGF-β3的原代雞肝細(xì)胞基因表達(dá)研究
4.2 雞miR-126功能研究
4.2.1 miR-126組織表達(dá)特征
4.2.2 miR-126靶基因預(yù)測
4.2.3 miR-126及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞肝臟中表達(dá)特征
4.2.4 miR-126及靶基因在原代雞肝細(xì)胞中表達(dá)特征
4.2.5 miR-126靶基因驗(yàn)證
4.3 GH處理的原代雞肝細(xì)胞miRNA表達(dá)研究
4.3.1 cGH處理原代雞肝細(xì)胞的效果
4.3.2 GH處理的原代雞肝細(xì)胞miRNA測序
4.4 雞miR-1a功能研究
4.4.1 miR-1a組織表達(dá)特征
4.4.2 miR-1a靶基因預(yù)測
4.4.3 miR-1a及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞骨骼肌中表達(dá)特征
4.4.4 miR-1a靶基因驗(yàn)證
4.5 雞miR-133a功能研究
4.5.1 miR-133a組織表達(dá)特征
4.5.2 miR-133a靶基因預(yù)測
4.5.3 miR-133a及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞骨骼肌中表達(dá)特征
4.5.4 miR-133a靶基因驗(yàn)證
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]miR-133a在結(jié)腸癌組織中的表達(dá)[J]. 謝海濤. 廣東醫(yī)學(xué). 2012(15)
[2]miR-133a在乳腺癌組織中的表達(dá)及其臨床意義[J]. 項(xiàng)茹,吳正升,張晴,徐曉春,吳強(qiáng). 安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(02)
[3]microRNA在肌肉發(fā)育中的功能研究進(jìn)展[J]. 王星果,郁建鋒,顧志良. 生命科學(xué). 2010(02)
[4]RNA干擾原理及其在腫瘤研究中的應(yīng)用[J]. 黃坤寨,蔡建春. 醫(yī)學(xué)綜述. 2010(01)
[5]成年雞肝細(xì)胞的分離與原代培養(yǎng)[J]. 陳黎龍,江青艷,朱曉彤,束剛,高淑靜,高萍,張永亮. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(03)
本文編號:3063304
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:144 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 肝臟和肌肉中miRNA研究進(jìn)展
1.1.1 miRNA的生物合成、作用機(jī)制和靶基因鑒定
1.1.2 miR-122
1.1.3 miR-126
1.1.4 miR-1a
1.1.5 miR-133a
1.2 畜禽miRNA研究進(jìn)展
1.2.1 牛miRNA
1.2.2 雞miRNA
1.2.3 豬miRNA
1.2.4 羊miRNA
1.2.5 畜禽miRNA研究展望
1.3 miRNA相關(guān)研究技術(shù)
1.3.1 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.3.2 miRNA靶基因預(yù)測
1.3.3 miRNA靶基因驗(yàn)證
1.3.4 高通量測序
1.3.5 RNA干擾
1.4 本研究的目的及意義
2 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.4 實(shí)驗(yàn)引物及核酸
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 miRNA及基因表達(dá)分析
2.2.2 miRNA靶基因驗(yàn)證
2.2.3 抑制miR-122的原代雞肝細(xì)胞基因分析
2.2.4 TGF-β3 RNAi
2.2.5 GH處理的原代雞肝細(xì)胞miRNA測序
2.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 雞miR-122功能研究
3.1.0 miR-122組織表達(dá)特征
3.1.1 miR-122靶基因預(yù)測
3.1.2 miR-122及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞肝臟中表達(dá)特征
3.1.3 miR-122及靶基因在原代雞肝細(xì)胞中表達(dá)特征
3.1.4 miR-122靶基因驗(yàn)證
3.1.5 抑制miR-122的原代雞肝細(xì)胞基因表達(dá)研究
3.1.6 干擾TGF-β3的原代雞肝細(xì)胞基因表達(dá)研究
3.2 雞miR-126功能研究
3.2.1 miR-126組織表達(dá)特征
3.2.2 miR-126靶基因預(yù)測
3.2.3 miR-126及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞肝臟中表達(dá)特征
3.2.4 miR-126及靶基因在原代雞肝細(xì)胞中表達(dá)特征
3.2.5 miR-126靶基因驗(yàn)證
3.3 GH處理的原代雞肝細(xì)胞miRNA表達(dá)研究
3.3.1 GH處理原代雞肝細(xì)胞后IGF-I表達(dá)升高
3.3.2 GH處理的原代雞肝細(xì)胞miRNA測序研究
3.4 雞miR-1a功能研究
3.4.1 miR-1a組織表達(dá)特征
3.4.2 miR-1a靶基因預(yù)測
3.4.3 miR-1a及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞骨骼肌中表達(dá)特征
3.4.4 miR-1a靶基因驗(yàn)證
3.5 雞miR-133a功能研究
3.5.1 miR-133a組織表達(dá)特征
3.5.2 miR-133a靶基因預(yù)測
3.5.3 miR-133a及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞骨骼肌中表達(dá)特征
3.5.4 miR-133a靶基因驗(yàn)證
4 討論
4.1 雞miR-122功能研究
4.1.1 miR-122組織表達(dá)特征
4.1.2 miR-122靶基因預(yù)測
4.1.3 miR-122及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞肝臟中表達(dá)特征
4.1.4 miR-122及靶基因在原代雞肝細(xì)胞中表達(dá)特征
4.1.5 miR-122靶基因驗(yàn)證
4.1.6 抑制miR-122的原代雞肝細(xì)胞基因表達(dá)研究
4.1.7 干擾TGF-β3的原代雞肝細(xì)胞基因表達(dá)研究
4.2 雞miR-126功能研究
4.2.1 miR-126組織表達(dá)特征
4.2.2 miR-126靶基因預(yù)測
4.2.3 miR-126及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞肝臟中表達(dá)特征
4.2.4 miR-126及靶基因在原代雞肝細(xì)胞中表達(dá)特征
4.2.5 miR-126靶基因驗(yàn)證
4.3 GH處理的原代雞肝細(xì)胞miRNA表達(dá)研究
4.3.1 cGH處理原代雞肝細(xì)胞的效果
4.3.2 GH處理的原代雞肝細(xì)胞miRNA測序
4.4 雞miR-1a功能研究
4.4.1 miR-1a組織表達(dá)特征
4.4.2 miR-1a靶基因預(yù)測
4.4.3 miR-1a及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞骨骼肌中表達(dá)特征
4.4.4 miR-1a靶基因驗(yàn)證
4.5 雞miR-133a功能研究
4.5.1 miR-133a組織表達(dá)特征
4.5.2 miR-133a靶基因預(yù)測
4.5.3 miR-133a及靶基因在不同生長發(fā)育時(shí)期雞骨骼肌中表達(dá)特征
4.5.4 miR-133a靶基因驗(yàn)證
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]miR-133a在結(jié)腸癌組織中的表達(dá)[J]. 謝海濤. 廣東醫(yī)學(xué). 2012(15)
[2]miR-133a在乳腺癌組織中的表達(dá)及其臨床意義[J]. 項(xiàng)茹,吳正升,張晴,徐曉春,吳強(qiáng). 安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(02)
[3]microRNA在肌肉發(fā)育中的功能研究進(jìn)展[J]. 王星果,郁建鋒,顧志良. 生命科學(xué). 2010(02)
[4]RNA干擾原理及其在腫瘤研究中的應(yīng)用[J]. 黃坤寨,蔡建春. 醫(yī)學(xué)綜述. 2010(01)
[5]成年雞肝細(xì)胞的分離與原代培養(yǎng)[J]. 陳黎龍,江青艷,朱曉彤,束剛,高淑靜,高萍,張永亮. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(03)
本文編號:3063304
本文鏈接:http://www.sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3063304.html
最近更新
教材專著