肌內(nèi)脂肪含量（IMF）是影響豬肉品質(zhì)最關(guān)鍵的因之一。一般認(rèn)為,IMF越低,肌肉的多汁性、嫩度、風(fēng)味及總體可接受度越低。IMF的提高能夠很好的改善豬肉的感觀品質(zhì)和食用品質(zhì),因此,提高IMF已成為當(dāng)今畜牧業(yè)、尤其是遺傳育種領(lǐng)域的研究熱點。本研究在前期SNP芯片分析的基礎(chǔ)上,選擇BMPER和FABP2基因作為候選基因,研究其啟動子區(qū)變異與豬肌內(nèi)脂肪含量的相關(guān)性,并對突變位點的功能進(jìn)行驗證和分析。實驗一驗證了BMPER基因啟動子區(qū)兩個SNP位點與IMF的相關(guān)性。首先通過構(gòu)建DNA池及BMPER啟動子區(qū)序列的PCR擴(kuò)增結(jié)合測序分析發(fā)現(xiàn)c.-1344 A>C與α-1423 A>G兩個SNP位點；采用PCR-SSCP技術(shù)對這兩個位點進(jìn)行基因分型,結(jié)果顯示這兩個位點為連鎖的單倍型,且在三元雜交外種豬群體中只有AA/AA和GC/GC兩種基因型。其次通過對不同基因型個體的BMPER表達(dá)水平的分析、與IMF含量的關(guān)聯(lián)分析以及兩種單倍型的熒光活性分析結(jié)果顯示,AAA/AA基因型表達(dá)水平和IMF含量都顯著高于GC/GC基因型（p<0.05）,且AA單倍型啟動子活性也顯著高于GC單倍型（p<... 

【文章來源】：南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：63 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
縮略詞
引言
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 SNP研究概況
        1.1 SNP特點
        1.2 SNP檢測方法
    2 肌內(nèi)脂肪研究概況
    3 肌內(nèi)脂肪沉積相關(guān)基因
        3.1 PPARγ基因簡介
        3.2 ADD1基因簡介
        3.3 HSL基因簡介
        3.4 Leptin基因簡介
        3.5 LPL基因簡介
    4 BMPER研究概況
    5 FABP2研究概況
第二章 BMPER基因啟動子區(qū)變異與豬肌內(nèi)脂肪含量相關(guān)性研究
    1. 實驗材料
        1.1 實驗動物
        1.2 實驗試劑
        1.3 儀器設(shè)備
        1.4 網(wǎng)絡(luò)資源及軟件
    2 實驗方法
        2.1 BMPER基因啟動子區(qū)SNP位點的篩選
        2.2 BMPER基因啟動子表達(dá)載體構(gòu)建
        2.3 細(xì)胞實驗
    3 實驗結(jié)果
        3.1 BMPER基因調(diào)控區(qū)SNP位點的篩選
        3.2 PCR-SSCP進(jìn)行基因分型
        3.3 突變位點與肌內(nèi)脂肪含量的相關(guān)性
        3.4 BMPER基因不同單倍型啟動子表達(dá)載體構(gòu)建
        3.5 兩種單倍型載體活性分析
        3.6 轉(zhuǎn)錄結(jié)合因子的預(yù)測
    4 討論
第三章 FABP2基因啟動子區(qū)變異與豬肌內(nèi)脂肪含量相關(guān)性研究
    1. 實驗材料
        1.1 實驗動物
        1.2 試劑
        1.3 儀器設(shè)備
        1.4 網(wǎng)絡(luò)資源及軟件
    2 實驗方法
        2.1 FABP2調(diào)控區(qū)SNP位點的篩選
        2.2 FABP2基因啟動子表達(dá)載體構(gòu)建
        2.3 細(xì)胞實驗
    3 實驗結(jié)果
        3.1 FABP2基因調(diào)控區(qū)SNP位點的篩選
        3.2 FABP2基因不同單倍型啟動子表達(dá)載體構(gòu)建
        3.3 FABP2基因不同單倍型啟動子表達(dá)載體活性分析
        3.4 轉(zhuǎn)錄結(jié)合因子的預(yù)測
    4 討論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
碩士期間發(fā)表論文


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]單核苷酸多態(tài)性的研究情況及應(yīng)用[J]. 鄭磊,霍金龍,馬芳菲,曾養(yǎng)志.  上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2009(01)
[2]單核苷酸多態(tài)性檢測方法的研究進(jìn)展[J]. 汪維鵬,倪坤儀,周國華.  遺傳. 2006(01)
[3]單核苷酸多態(tài)性檢測方法的評價[J]. 周晨慧,彭惠民.  現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2005(02)
[4]基于生物信息學(xué)的SNP候選位點搜尋方法[J]. 陳煒,張戈,張思仲.  遺傳. 2001(02)



本文編號：3050263