利用RNAi研究鹿茸干細胞GAL-1基因的免疫調控作用
發(fā)布時間:2021-01-29 21:13
近年來,干細胞治療在相關疾病中已經進入臨床試驗階段,但免疫排斥現(xiàn)象如影隨從,是干細胞治療技術的絆腳石。半乳糖凝集素1(Galectin-1,GAL-1)在大多數(shù)間充質干細胞、多數(shù)腫瘤及鹿茸干細胞中被發(fā)現(xiàn)高表達,而相應的這些細胞中均出現(xiàn)免疫抑制現(xiàn)象。GAL-1作為免疫調控因子,推測其很可能參與了干細胞的免疫調控。鹿茸是唯一能夠在失去后還能完全再生的哺乳動物器官。研究表明,鹿茸再生是一個基于干細胞的過程,鹿茸干細胞中高表達GAL-1基因,推測其是鹿茸再生中的一個重要調控因子。為研究GAL-1在鹿茸干細胞中的表達及可能的生物學功能,本論文以東北梅花鹿鹿茸的干細胞組織,即生茸區(qū)骨膜和角柄骨膜(致敏角柄骨膜與休眠角柄骨膜)以及對照組織面部骨膜為研究材料,克隆了梅花鹿的GAL-1基因CDS區(qū)序列,利用軟件或網站,對GAL-1蛋白進行生物信息學分析;利于Western-blot及Q-PCR技術檢測了GAL-1在鹿茸干細胞中的相對表達量。結果顯示:梅花鹿GAL-1 ORF全長為408bp,編碼134個氨基酸;相對分子質量為14.69KDa,氨基酸序列與牛羊高度接近(95%>);主要定位于細胞外,...
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
GAL-1目的片段RT-PCR結果
圖2 GAL-1基因開放閱讀框及其核酸、氨基酸序列Fig 2 Open reading frame and the sequences of nucleotides and amino acids of GAL-12.2.2 梅花鹿 GAL-1 CDS 區(qū)相似度對比與發(fā)育樹分析將牛、人、綿羊、大鼠、小鼠、野豬、犬科、獼猴、大鯢、條石鯛、灰蓋鬼傘菌的GAL-1核苷酸與氨基酸序列導入DNAman,與梅花鹿GAL-1序列對比發(fā)現(xiàn)相似度分別為:34.58%~95.59%,17.88%~97.06%,。與同屬的反芻類動物相似度最高,與哺乳動物相似度接近,與大鯢、條石鯛、灰蓋鬼傘菌的相似度逐漸降低,這符合進化規(guī)律。表 2 梅花鹿GAL-1核苷酸與氨基酸序列與其他動物的一致性分析Table 2 Comparisons of nucleotides and amino acids of sika deer with those from other organisms物種Species核苷酸一致性/%Nucleotides identity氨基酸一致性/%Amino acid identity牛 Bos taurus綿羊 Ovis aries獼猴 Macaca mulatta95.5995.1388.7395.3097.0689.63
圖 3 GAL-1 基因編碼區(qū)的系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 3 Phylogenetic tree for GAL-1 gene coding region2.2.3 Gal 基因編碼的蛋白質結構分析2.2.3.1 理化性質GAL-1基因編碼蛋白是一個約為14Kda的小分子蛋白,在幾乎所有真核生物中均有表達,進化比較保守。ProtParam(http://web.expasy.org/protparam/)分析顯示:GAL-1分子量為14.69Kd等電點(PI)為5.10。GAL-1蛋白的組成包含20種氨基酸,丙氨酸(Ala)占比最高(11.1%),色氨酸(Trp)與蛋氨酸(Met)占比最低(均為0.7%)。Protscale(http://web.expasy.org/protscale分析蛋白親疏水性顯示GAL-1蛋白僅在1-20和80-100存在兩個疏水性較高的區(qū)域,其它區(qū)域趨向于親水;ProtParam中親水性的平均值(GRAVY)-0.145<0;利用TMHMM Server v.2.0網站對GAL蛋白進行跨膜分析(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/),顯示GAL-1蛋白沒有跨膜結構
【參考文獻】:
期刊論文
[1]臍帶間充質細胞在神經修復的作用[J]. 高文勇,陳琳,黃紅云. 解剖科學進展. 2017(05)
[2]間充質(干)細胞的定義變遷[J]. 陳津. 中華細胞與干細胞雜志(電子版). 2017(04)
[3]利用qRT-PCR技術篩選鹿茸生長中心細胞與鹿茸干細胞內參基因[J]. 張偉,劉佳,董振,李春義. 農業(yè)生物技術學報. 2017(05)
[4]半乳糖凝集素1在臍帶來源間充質干細胞調控類風濕關節(jié)炎患者T細胞功能中的作用[J]. 孫琳,安卓,李常虹,劉蕊,趙金霞,劉湘源. 北京大學學報(醫(yī)學版). 2016(06)
[5]鹿茸組織中內參基因的篩選和驗證[J]. 張然然,劉華淼,邢秀梅,胡大勇. 中國畜牧獸醫(yī). 2015(04)
[6]半乳糖凝集素1蛋白及其生物學功能[J]. 秦欣欣,孫紅梅,趙海平,褚文輝,王大濤,李春義. 中國畜牧獸醫(yī). 2012(06)
[7]白介素6對人Th17細胞的免疫調節(jié)作用[J]. 郭振興,鄭翠玲,陳振萍,董文川,楊仁池. 中國實驗血液學雜志. 2011(02)
[8]腫瘤血管生成促進因子和抑制因子[J]. 邱達泰,黃芝,歐陽高亮,鮑仕登. 中國藥物與臨床. 2005(07)
[9]c-myc ASODN對半乳糖誘導的晶狀體上皮細胞中cMyc蛋白表達及細胞周期的影響[J]. 范芳,葛正龍,李長福,曾小平,李海祥. 第四軍醫(yī)大學學報. 2004(11)
[10]免疫球蛋白超家族與動物病毒的蛋白結構[J]. 侯云德. 病毒學報. 1989(02)
碩士論文
[1]Galectin-1在滋養(yǎng)層干細胞增殖和分化中的表達與相關調控分子的研究[D]. 尤佳莉.浙江大學 2015
[2]梅花鹿生茸區(qū)骨膜干細胞Galectin-1基因RNAi重組慢病毒載體的構建[D]. 秦欣欣.江蘇科技大學 2013
[3]Galectin-1的表達純化及其抑瘤功能的初步研究[D]. 任聲權.中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院 2008
本文編號:3007620
【文章來源】:中國農業(yè)科學院北京市
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
GAL-1目的片段RT-PCR結果
圖2 GAL-1基因開放閱讀框及其核酸、氨基酸序列Fig 2 Open reading frame and the sequences of nucleotides and amino acids of GAL-12.2.2 梅花鹿 GAL-1 CDS 區(qū)相似度對比與發(fā)育樹分析將牛、人、綿羊、大鼠、小鼠、野豬、犬科、獼猴、大鯢、條石鯛、灰蓋鬼傘菌的GAL-1核苷酸與氨基酸序列導入DNAman,與梅花鹿GAL-1序列對比發(fā)現(xiàn)相似度分別為:34.58%~95.59%,17.88%~97.06%,。與同屬的反芻類動物相似度最高,與哺乳動物相似度接近,與大鯢、條石鯛、灰蓋鬼傘菌的相似度逐漸降低,這符合進化規(guī)律。表 2 梅花鹿GAL-1核苷酸與氨基酸序列與其他動物的一致性分析Table 2 Comparisons of nucleotides and amino acids of sika deer with those from other organisms物種Species核苷酸一致性/%Nucleotides identity氨基酸一致性/%Amino acid identity牛 Bos taurus綿羊 Ovis aries獼猴 Macaca mulatta95.5995.1388.7395.3097.0689.63
圖 3 GAL-1 基因編碼區(qū)的系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 3 Phylogenetic tree for GAL-1 gene coding region2.2.3 Gal 基因編碼的蛋白質結構分析2.2.3.1 理化性質GAL-1基因編碼蛋白是一個約為14Kda的小分子蛋白,在幾乎所有真核生物中均有表達,進化比較保守。ProtParam(http://web.expasy.org/protparam/)分析顯示:GAL-1分子量為14.69Kd等電點(PI)為5.10。GAL-1蛋白的組成包含20種氨基酸,丙氨酸(Ala)占比最高(11.1%),色氨酸(Trp)與蛋氨酸(Met)占比最低(均為0.7%)。Protscale(http://web.expasy.org/protscale分析蛋白親疏水性顯示GAL-1蛋白僅在1-20和80-100存在兩個疏水性較高的區(qū)域,其它區(qū)域趨向于親水;ProtParam中親水性的平均值(GRAVY)-0.145<0;利用TMHMM Server v.2.0網站對GAL蛋白進行跨膜分析(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/),顯示GAL-1蛋白沒有跨膜結構
【參考文獻】:
期刊論文
[1]臍帶間充質細胞在神經修復的作用[J]. 高文勇,陳琳,黃紅云. 解剖科學進展. 2017(05)
[2]間充質(干)細胞的定義變遷[J]. 陳津. 中華細胞與干細胞雜志(電子版). 2017(04)
[3]利用qRT-PCR技術篩選鹿茸生長中心細胞與鹿茸干細胞內參基因[J]. 張偉,劉佳,董振,李春義. 農業(yè)生物技術學報. 2017(05)
[4]半乳糖凝集素1在臍帶來源間充質干細胞調控類風濕關節(jié)炎患者T細胞功能中的作用[J]. 孫琳,安卓,李常虹,劉蕊,趙金霞,劉湘源. 北京大學學報(醫(yī)學版). 2016(06)
[5]鹿茸組織中內參基因的篩選和驗證[J]. 張然然,劉華淼,邢秀梅,胡大勇. 中國畜牧獸醫(yī). 2015(04)
[6]半乳糖凝集素1蛋白及其生物學功能[J]. 秦欣欣,孫紅梅,趙海平,褚文輝,王大濤,李春義. 中國畜牧獸醫(yī). 2012(06)
[7]白介素6對人Th17細胞的免疫調節(jié)作用[J]. 郭振興,鄭翠玲,陳振萍,董文川,楊仁池. 中國實驗血液學雜志. 2011(02)
[8]腫瘤血管生成促進因子和抑制因子[J]. 邱達泰,黃芝,歐陽高亮,鮑仕登. 中國藥物與臨床. 2005(07)
[9]c-myc ASODN對半乳糖誘導的晶狀體上皮細胞中cMyc蛋白表達及細胞周期的影響[J]. 范芳,葛正龍,李長福,曾小平,李海祥. 第四軍醫(yī)大學學報. 2004(11)
[10]免疫球蛋白超家族與動物病毒的蛋白結構[J]. 侯云德. 病毒學報. 1989(02)
碩士論文
[1]Galectin-1在滋養(yǎng)層干細胞增殖和分化中的表達與相關調控分子的研究[D]. 尤佳莉.浙江大學 2015
[2]梅花鹿生茸區(qū)骨膜干細胞Galectin-1基因RNAi重組慢病毒載體的構建[D]. 秦欣欣.江蘇科技大學 2013
[3]Galectin-1的表達純化及其抑瘤功能的初步研究[D]. 任聲權.中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院 2008
本文編號:3007620
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