新疆地區(qū)牛PCV3的分子流行病學調(diào)查與基因特性分析
發(fā)布時間:2021-01-23 12:01
目的:豬圓環(huán)病毒3型(porcine circovirus type 3,PCV3)自2016年被美國研究者首次在患病家豬鑒定出以來,在我國多個省份也報道PCV3的感染情況。目前在除自然宿主豬以外的其他動物牛、狗、鼠和蜱等均檢出PCV3的存在,但有關PCV3對新疆地區(qū)牛群的感染尚未知曉,為摸清PCV3在新疆地區(qū)牛群感染情況及感染毒株的基因特征,因此本研究對新疆地區(qū)規(guī)模化牛場PCV3的感染情況進行調(diào)查。方法:本試驗應用巢氏PCR的檢測方法,對采集自新疆有代表性的13個地區(qū)共670份牛血和組織樣品進行PCV3基因檢測,并進行核苷酸序列分析;同時結合虎紅平板凝集試驗與常規(guī)PCR檢測方法,對PCV3陽性樣品樣品進行布魯氏菌病抗體檢測以及引起牛繁殖障礙相關疾病的基因檢測,并分析PCV3病毒與其他病原之間的關系。選取有代表性的PCV3陽性樣品進行全基因擴增、測序與拼接,并對全基因序列進行分析。應用實驗室提供的PCV3 Cap重組蛋白作為抗原,初步建立間接ELISA-PCV3抗體的檢測方法,檢測牛血清樣品PCV3感染的抗體水平,并對結果進行統(tǒng)計。結果:(1)選取的13個地區(qū)670份樣品共檢測出PCV...
【文章來源】:石河子大學新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
PCV3全基因結構
新疆地區(qū)牛PCV3的分子流行病學調(diào)查與基因特性分析11組織30份(30頭牛的心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟、淋巴結),見表1-1。在采集的670份樣品中,有120份牛全血樣品來源于牛群的不同生長階段,表1-2。將樣品于-80℃溫度下保存、備用。圖1-1新疆地區(qū)采樣分布圖注:表示已采樣地區(qū)Fig.1-1Samplingdistributionofxinjiangregion表1-1PCV3來源情況Tab1-1PCV3Samplesource地區(qū)樣本數(shù)量(份)樣本類型阿克蘇地區(qū)40全血巴州地區(qū)40全血喀什地區(qū)40全血伊犁地區(qū)40全血石河子地區(qū)160全血30組織昌吉地區(qū)40全血阿勒泰地區(qū)40全血博州地區(qū)40全血塔城地區(qū)40全血哈密地區(qū)40全血和田地區(qū)40全血奎屯地區(qū)40全血烏魯木齊地區(qū)40全血
PCV3PCR檢測結果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]云南省新發(fā)豬圓環(huán)病毒3型感染狀況調(diào)查與全基因進化分析[J]. 曾彩虹,藍睿,畢峻龍,陶鑫,孫顯國,趙謙,楊貴樹,尹革芬. 中國動物傳染病學報. 2020(02)
[2]吉林省豬圓環(huán)病毒3型的分子流行病學調(diào)查及遺傳演化分析[J]. 郭影成,付守鵬,高學勇,李旭東. 中國畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[3]豬圓環(huán)病毒3型全基因克隆及遺傳演化分析[J]. 金宏凱,馬宇馳,孫莉,樊瓊,董媛媛,馬鳴瀟. 畜牧與獸醫(yī). 2019(02)
[4]福建省新發(fā)豬圓環(huán)病毒3型分子流行病學調(diào)查及其Cap基因分子特征[J]. 黃翠琴,范克偉,余佳,宋洲洋,楊守深,戴愛玲,楊小燕,劉建奎,林青青,費世港,林宏彬,周存銳,陳冠果,張躍鴻. 中國獸醫(yī)學報. 2018(12)
[5]牛病毒性腹瀉病毒鑒定及分型RT-PCR檢測方法的建立[J]. 李新培,朱洪偉,周偉光,關平原,程世鵬,溫永俊. 動物醫(yī)學進展. 2018(10)
[6]豬圓環(huán)病毒3型的古老起源和全球分布分析[J]. 張愛瓊,梁海英,曾智勇,Saraiva G L,Vidigal PMP,Fietto J L R. 豬業(yè)科學. 2018(08)
[7]華南地區(qū)豬圓環(huán)病毒3型感染的分子流行病學調(diào)查與分析[J]. 劉相聰,申翰欽,張鵬飛,黎嘉豪,劉燕玲,張樂宜,宋長緒. 畜牧與獸醫(yī). 2018(06)
[8]陜甘地區(qū)豬PCV3流行毒株的檢測[J]. 朱小甫,吳旭錦. 西北農(nóng)林科技大學學報(自然科學版). 2018(11)
[9]新現(xiàn)豬圓環(huán)病毒3型及圓環(huán)病毒2型雙重PCR檢測方法的建立與應用[J]. 張帆帆,李龍顯,葉昱,李凱,郭楠楠,張敏,黃冬艷,吳瓊,何后軍,宋德平,唐玉新. 江西農(nóng)業(yè)大學學報. 2018(01)
[10]豬圓環(huán)病毒3型半巢式PCR方法的建立和應用[J]. 張志,郝占武,楊旭兵,張美晶,吳發(fā)興,李曉成. 中國動物檢疫. 2018(01)
碩士論文
[1]PCV3貴州流行株基因組分析及其Cap蛋白的原核表達研究[D]. 張愛瓊.貴州大學 2019
[2]我國14個省市豬圓環(huán)病毒3型PCR檢測及部分陽性樣品的全基因組序列測定與分析[D]. 邢廣源.河南農(nóng)業(yè)大學 2018
本文編號:2995174
【文章來源】:石河子大學新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
PCV3全基因結構
新疆地區(qū)牛PCV3的分子流行病學調(diào)查與基因特性分析11組織30份(30頭牛的心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟、淋巴結),見表1-1。在采集的670份樣品中,有120份牛全血樣品來源于牛群的不同生長階段,表1-2。將樣品于-80℃溫度下保存、備用。圖1-1新疆地區(qū)采樣分布圖注:表示已采樣地區(qū)Fig.1-1Samplingdistributionofxinjiangregion表1-1PCV3來源情況Tab1-1PCV3Samplesource地區(qū)樣本數(shù)量(份)樣本類型阿克蘇地區(qū)40全血巴州地區(qū)40全血喀什地區(qū)40全血伊犁地區(qū)40全血石河子地區(qū)160全血30組織昌吉地區(qū)40全血阿勒泰地區(qū)40全血博州地區(qū)40全血塔城地區(qū)40全血哈密地區(qū)40全血和田地區(qū)40全血奎屯地區(qū)40全血烏魯木齊地區(qū)40全血
PCV3PCR檢測結果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]云南省新發(fā)豬圓環(huán)病毒3型感染狀況調(diào)查與全基因進化分析[J]. 曾彩虹,藍睿,畢峻龍,陶鑫,孫顯國,趙謙,楊貴樹,尹革芬. 中國動物傳染病學報. 2020(02)
[2]吉林省豬圓環(huán)病毒3型的分子流行病學調(diào)查及遺傳演化分析[J]. 郭影成,付守鵬,高學勇,李旭東. 中國畜牧獸醫(yī). 2019(05)
[3]豬圓環(huán)病毒3型全基因克隆及遺傳演化分析[J]. 金宏凱,馬宇馳,孫莉,樊瓊,董媛媛,馬鳴瀟. 畜牧與獸醫(yī). 2019(02)
[4]福建省新發(fā)豬圓環(huán)病毒3型分子流行病學調(diào)查及其Cap基因分子特征[J]. 黃翠琴,范克偉,余佳,宋洲洋,楊守深,戴愛玲,楊小燕,劉建奎,林青青,費世港,林宏彬,周存銳,陳冠果,張躍鴻. 中國獸醫(yī)學報. 2018(12)
[5]牛病毒性腹瀉病毒鑒定及分型RT-PCR檢測方法的建立[J]. 李新培,朱洪偉,周偉光,關平原,程世鵬,溫永俊. 動物醫(yī)學進展. 2018(10)
[6]豬圓環(huán)病毒3型的古老起源和全球分布分析[J]. 張愛瓊,梁海英,曾智勇,Saraiva G L,Vidigal PMP,Fietto J L R. 豬業(yè)科學. 2018(08)
[7]華南地區(qū)豬圓環(huán)病毒3型感染的分子流行病學調(diào)查與分析[J]. 劉相聰,申翰欽,張鵬飛,黎嘉豪,劉燕玲,張樂宜,宋長緒. 畜牧與獸醫(yī). 2018(06)
[8]陜甘地區(qū)豬PCV3流行毒株的檢測[J]. 朱小甫,吳旭錦. 西北農(nóng)林科技大學學報(自然科學版). 2018(11)
[9]新現(xiàn)豬圓環(huán)病毒3型及圓環(huán)病毒2型雙重PCR檢測方法的建立與應用[J]. 張帆帆,李龍顯,葉昱,李凱,郭楠楠,張敏,黃冬艷,吳瓊,何后軍,宋德平,唐玉新. 江西農(nóng)業(yè)大學學報. 2018(01)
[10]豬圓環(huán)病毒3型半巢式PCR方法的建立和應用[J]. 張志,郝占武,楊旭兵,張美晶,吳發(fā)興,李曉成. 中國動物檢疫. 2018(01)
碩士論文
[1]PCV3貴州流行株基因組分析及其Cap蛋白的原核表達研究[D]. 張愛瓊.貴州大學 2019
[2]我國14個省市豬圓環(huán)病毒3型PCR檢測及部分陽性樣品的全基因組序列測定與分析[D]. 邢廣源.河南農(nóng)業(yè)大學 2018
本文編號:2995174
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