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雞不同F(xiàn)SHR表達(dá)水平的小黃卵泡全轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時(shí)間:2021-01-23 02:54
  卵泡選擇是當(dāng)前家禽繁殖生物學(xué)的熱點(diǎn),研究卵泡選擇的分子機(jī)制有助于充分開(kāi)發(fā)母雞卵巢內(nèi)豐富的卵泡資源,提高母雞的產(chǎn)蛋和繁殖性能。卵泡的選擇主要依賴(lài)垂體分泌的FSH調(diào)控以及受體FSHR的表達(dá),FSHR表達(dá)量高的卵泡響應(yīng)FSH的刺激。近幾年研究發(fā)現(xiàn),lncRNA、miRNA等非編碼RNA在調(diào)控細(xì)胞分化,轉(zhuǎn)錄激活與轉(zhuǎn)錄干擾等生物學(xué)過(guò)程中起到了不可忽視的作用,但對(duì)于其如何影響動(dòng)物卵巢卵泡的發(fā)育還知之甚少,特別是對(duì)禽類(lèi)卵巢卵泡發(fā)育和選擇的影響鮮有報(bào)道。本研究對(duì)產(chǎn)蛋高峰期濟(jì)寧百日雞不同F(xiàn)SHR表達(dá)量的小黃卵泡進(jìn)行了全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,對(duì)隨機(jī)選擇的30個(gè)mRNA、lncRNA和miRNA進(jìn)行了定量驗(yàn)證,對(duì)篩選出的mRNA,lncRNA和miRNA以及它們的靶基因進(jìn)行了初步研究和生物信息學(xué)分析。結(jié)果如下:1.雞小黃卵泡的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的基本統(tǒng)計(jì)。樣本SY1獲得99105865個(gè)高質(zhì)量讀數(shù),占原始數(shù)據(jù)的98.87%,檢測(cè)到42794個(gè)mRNA、8011個(gè)ncRNA和200個(gè)miRNA。樣本SY2獲得10605080個(gè)高質(zhì)量讀數(shù),占原始數(shù)據(jù)的98.83%,檢測(cè)到42850個(gè)mRNA、8138個(gè)ncRNA和229個(gè)... 

【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】:74 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

雞不同F(xiàn)SHR表達(dá)水平的小黃卵泡全轉(zhuǎn)錄組分析


雞不同發(fā)育時(shí)期的各級(jí)卵泡(Johnson,2014)

卵泡,家雞,原始卵泡


長(zhǎng)的原始卵泡中,一部分卵泡受到未知信號(hào)刺激后開(kāi)始緩慢生長(zhǎng);第卵泡被優(yōu)勢(shì)化選擇發(fā)育為等級(jí)卵泡時(shí)。一旦卵泡生長(zhǎng)至等級(jí)卵泡時(shí),率則非常低(Gilbert et al., 1983)。最大的等級(jí)卵泡 F1 排卵后,F(xiàn)2在發(fā)育 24-26 小時(shí)后發(fā)生排卵。膜細(xì)胞和顆粒細(xì)胞育的初期階段,卵母細(xì)胞周?chē)捏w細(xì)胞分化并緊密結(jié)合在一起,發(fā)育由此原始卵泡開(kāi)始形成。當(dāng)原始卵泡被選擇發(fā)育為初級(jí)卵泡后,間質(zhì)層。顆粒細(xì)胞和膜細(xì)胞被非細(xì)胞成分組成的基膜隔開(kāi),有效阻止了血接接觸。白卵泡初期只有一層顆粒細(xì)胞,發(fā)育到后期分為兩層,到黃變?yōu)槎鄬樱l(fā)育為等級(jí)卵泡時(shí)又逐漸變?yōu)橐粚蛹?xì)胞。而單層膜細(xì)胞功能具有明顯差別的各具多層細(xì)胞的內(nèi)外兩層膜(袁振杰,2016)。

序列,家族


者們已經(jīng)不滿足于單個(gè)基因研究,而將眼光聚焦于能的信使 RNA 和非編碼 RNA 的表達(dá)水平。飛速發(fā)展和大數(shù)據(jù)時(shí)代的來(lái)臨和,研究者的這種需通量測(cè)序技術(shù),具有數(shù)據(jù)量大,測(cè)序深度廣,靈敏進(jìn)行分析等優(yōu)點(diǎn)(祁云霞 等, 2011)。第三代測(cè)序錄本拼接短、信息不完整的問(wèn)題。能夠超長(zhǎng)讀長(zhǎng),信息,并能夠發(fā)現(xiàn)未被注釋的序列,并能夠精確地lm et al., 2008)。Diaz 等人對(duì)于母雞小卵泡轉(zhuǎn)錄組研基因 StAR、CYP11A1 和 HSD3B 在 1mm 卵泡中的m 卵泡中進(jìn)一步增加(Diaz et al., 2011)。2019 年黎非編碼 RNAlncIRS1 調(diào)控肌肉生長(zhǎng)發(fā)育的分子機(jī)理iR-15 家族,促進(jìn) IRS1 基因表達(dá),激活 IGF1-PI3K胞的增殖和分化(Li et al.,2019)。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒.  遺傳. 2011(11)
[2]禽類(lèi)下丘腦-垂體-性腺軸的內(nèi)分泌調(diào)節(jié)[J]. 劉紅云,張才喬.  中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2006(09)

碩士論文
[1]miR-26a-5p在雞卵泡細(xì)胞中的表達(dá)、作用及其調(diào)控分析[D]. 吳海珍.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]PTHLH在雞卵泡發(fā)育中的功能、表達(dá)調(diào)控及其與產(chǎn)蛋性能的關(guān)系[D]. 郭曉莉.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]長(zhǎng)鏈非編碼RNA調(diào)控小鼠卵巢發(fā)育的初步研究[D]. 李加宇.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



本文編號(hào):2994406

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