為了調查吉林省豬圓環(huán)病毒2型（PCV2）的流行情況,對2016-2018年采集的434份疑似PCV2感染病料或血清樣品進行PCR檢測,并對其中分離的2株PCV2 （2017/2018）進行全基因組的擴增、測序及遺傳進化分析。PCR檢測結果顯示,PCV2的陽性率為38.5%�；驕y序結果顯示,PCV2-2017和PCV2-2018全基因組長度為1 767 bp。全基因同源性分析顯示,PCV2-2017與法國株AF055394同源性最高,可達99.8%,與PCV2-2018同源性最低,為80.1%;PCV2-2018與法國株AY322001同源性最高達99.8%,與上海株GU124593同源性最低,為77.2%。遺傳進化分析結果顯示,與國內外參考毒株比較,PCV2-2017和PCV2-2018處于2個不同的分支中,其中1個分支中PCV2-2018與國內GU370064、AY691169、AY969004、DQ180393及國外AY322001、AB426905毒株親緣關系較近;PCV2-2017與HM102350、JQ809464、GU124593、AF055394、AF055391、GU... 

【文章來源】：中國獸醫(yī)雜志. 2020,56(03)北大核心

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PCV2-2017 /PCV2-2018吉林株ORF 2核酸序列部分比對結果

PCV2-2017和PCV2-2018分離株中Cap基因長度為702 bp,編碼Cap蛋白。PCV2-2017毒株在GenBank中進行核酸同源性比對,核苷酸同源性在96%～99%;氨基酸同源性比對,同源性在94%～99%,說明PCV2變異主要發(fā)生在ORF2區(qū),共有12個點突變,突變主要集中在670～680 nt,有4個位點突變,其余分散于ORF2的其他位置。PCV2-2018毒株在GenBank中進行核酸同源性比對,核苷酸同源性在99%;氨基酸同源性比對,同源性在96%～99%,突變的位點主要集中在670～680 nt,有4個點突變,部分結果如圖2所示。導致相應的氨基酸也發(fā)生改變,這是否導致抗原性發(fā)生改變還需要進一步研究。圖2 PCV2-2017 /PCV2-2018吉林株ORF 2核酸序列部分比對結果

【參考文獻】：
期刊論文
[1]豬圓環(huán)病毒研究進展[J]. 劉金鑫,孫孟嬌,陳磊,王雪嬌,銀森森.  動物醫(yī)學進展. 2012(02)



本文編號：2993416