柔嫩艾美耳球蟲耐藥相關(guān)基因特性初步研究及耐藥株與敏感株全基因組重測(cè)序分析
發(fā)布時(shí)間:2020-12-13 20:09
柔嫩艾美耳球蟲(Eimeria tenella)是一種寄生于雞盲腸的單細(xì)胞寄生原蟲,是雞球蟲病的主要病原體,目前國內(nèi)外對(duì)雞球蟲病的防治主要依靠藥物。長(zhǎng)期使用藥物使其對(duì)藥物表現(xiàn)出嚴(yán)重的抗性,給禽類的養(yǎng)殖帶來了大量的經(jīng)濟(jì)損失。為研究雞球蟲耐藥性產(chǎn)生的機(jī)制,本實(shí)驗(yàn)室前期以柔嫩艾美耳球蟲的藥物敏感株(DS)為親本,誘導(dǎo)出抗地克珠利耐藥株(DZR)和抗馬杜拉霉素耐藥株(MRR)。對(duì)2個(gè)耐藥株和敏感株進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選了敏感株與耐藥株的差異表達(dá)基因。在此基礎(chǔ)上,本研究選擇4個(gè)在耐藥株體內(nèi)顯著上調(diào)的基因,分別為柔嫩艾美耳球蟲含HD域蛋白(HD domain-containing protein,EtHDCP)、3-磷酸甘油醛脫氫酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,EtGAPDH)、伴侶蛋白TCP-1環(huán)狀復(fù)合物亞基α(T-complex protein 1 subunitα,EtTCP-1α)和蘋果酸脫氫酶(Malate dehydrogenase,EtMDH)。對(duì)這4個(gè)基因進(jìn)行特性和功能的初步分析,并用全基因組重測(cè)序的方法對(duì)敏感株和2個(gè)耐藥株進(jìn)行測(cè)...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:93 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
純化的柔嫩艾美耳球蟲4個(gè)階段蟲體Fig.2.1Purified4developmentalstagesofEimeriatenellaA:孢子化卵囊(×200);B:未孢子化卵囊(×200);C:子孢子(×200);D:裂殖子(×400)
經(jīng)凝膠電泳分析其完整性(圖2.2),可見提取的總 RNA 具有典型的 3 個(gè)條帶,表明提取的 RNA 未被降解,完整性較好。分光光度計(jì)檢測(cè)結(jié)果 OD260/OD280=1.93,表明 RNA 未被蛋白質(zhì)和 DNA 污染,可進(jìn)行下一步的反轉(zhuǎn)錄,用反轉(zhuǎn)錄 M-MLV 試劑盒,得到柔嫩美耳球蟲孢子化卵囊的 cDNA 第一鏈,保存于-20℃。
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第二章 4 個(gè)耐藥相關(guān)基因的克隆和生物信息學(xué)分析因的 cDNA 片段。2.3.3.4 EtMDH 基因的 ORF 克隆根據(jù) EtMDH 基因 ORF 序列,設(shè)計(jì)特異性引物,以柔嫩艾美耳球蟲孢子化卵囊 cDNA 為模板,設(shè)定合適的退火溫度進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增。瓊脂糖凝膠電泳對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行分析,可以發(fā)現(xiàn)在 954 bp處有特異性的單一條帶(圖 2.3D),與預(yù)期條帶位置相符;將條帶位置正確的 PCR 產(chǎn)物切下,用膠回收試劑盒對(duì) PCR 產(chǎn)物進(jìn)行回收。純化后的 PCR 產(chǎn)物與 pGEM-T-easy 載體 4℃條件下連接 8h 后,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌 TOP10 感受態(tài)細(xì)胞中,在 LB 固體平板中挑取陽性菌落進(jìn)行培養(yǎng),并用 PCR 對(duì)菌液進(jìn)行鑒定和測(cè)序。測(cè)序結(jié)果與原序列比對(duì)正確,表明成功擴(kuò)增獲得 EtMDH 基因的 cDNA 片段。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抗精噁唑禾草靈和甲基二磺隆看麥娘ACCase和ALS基因突變[J]. 趙寧,郭文磊,李偉,呂玲玲,劉偉堂,王金信. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2017(05)
[2]四個(gè)半LIM結(jié)構(gòu)域蛋白1對(duì)人肝癌細(xì)胞紫杉醇耐藥影響的研究[J]. 周蕾,姜妮,周心娜,王小利,任軍. 中國臨床藥理學(xué)雜志. 2017(12)
[3]小檗堿對(duì)禽源大腸桿菌抑菌作用及耐藥消除作用的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[J]. 張石磊,翟向和,王春光,陳諫,賈澤,張鐵. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(05)
[4]惡性瘧原蟲與耐藥性相關(guān)分子遺傳標(biāo)記的研究進(jìn)展[J]. 徐超,黃炳成,閆歌,魏慶寬. 中國病原生物學(xué)雜志. 2016(12)
[5]柔嫩艾美耳球蟲2個(gè)抗藥株的抗藥性評(píng)估[J]. 謝雨翔,韓紅玉,趙其平,王自文,董輝,徐帥兵,朱順海,崔曉霞,唐敏,楊志遠(yuǎn),黃兵. 中國動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2016(06)
[6]耿氏硬草對(duì)乙酰輔酶A羧化酶類除草劑抗性水平及分子機(jī)制初探[J]. 袁國徽,王恒智,趙寧,路興濤,劉偉堂,王金信. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報(bào). 2016(03)
[7]乙酰輔酶A羧化酶B基因多態(tài)性與2型糖尿病的相關(guān)性研究[J]. 唐俊婷,李會(huì)芳,劉華,王玉明,宋滇平. 中國糖尿病雜志. 2016(01)
[8]鼠傷寒沙門菌ATCC13311誘導(dǎo)耐藥株的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和分析[J]. 李琳,馮帥,汪瑩,代興楊,楊艷菲,曾明華. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(07)
[9]乙酰輔酶A羧化酶基因多態(tài)性與冠心病關(guān)系[J]. 陳業(yè)達(dá),張高華,梁巖,林美華,張乃尊,金律,饒紹奇. 中國公共衛(wèi)生. 2015(09)
[10]抗精噁唑禾草靈的日本看麥娘ACCase基因突變[J]. 畢亞玲,吳翠霞,郭文磊,李琦,李蓉榮,王金信. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2015(03)
博士論文
[1]基于全基因組SNP對(duì)豬品種分子種質(zhì)特性挖掘與保護(hù)的研究[D]. 李文婷.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]骨膜蛋白在非小細(xì)胞肺癌中的作用及相關(guān)機(jī)制的研究[D]. 胡文霞.河北醫(yī)科大學(xué) 2017
[3]空腸彎曲菌酰胺醇類誘導(dǎo)耐藥株與敏感株的組學(xué)比較研究[D]. 李會(huì).中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]中華按蚊擬除蟲菊酯殺蟲劑抗性研究[D]. 朱國鼎.蘇州大學(xué) 2014
[5]應(yīng)用全基因組重測(cè)序技術(shù)初步探討瘢痕增生的發(fā)病機(jī)制[D]. 劉暢.中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院 2014
[6]牙鲆微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選和美洲牡蠣抗病相關(guān)基因SNP的初步分析[D]. 于海洋.中國海洋大學(xué) 2010
[7]羊胃腸線蟲對(duì)常用驅(qū)蟲藥抗藥性的初步研究[D]. 蔡葵蒸.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[8]帶科主要絳蟲45W和14ku/18ku基因變異的研究[D]. 賈萬忠.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2003
碩士論文
[1]浮游態(tài)和生物被膜狀態(tài)嗜水氣單胞菌對(duì)四環(huán)素耐藥相關(guān)蛋白的研究[D]. 李碗芯.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[2]中華按蚊線粒體基因組進(jìn)化及抗藥性相關(guān)基因多態(tài)性研究[D]. 王琰.第二軍醫(yī)大學(xué) 2015
[3]柔嫩艾美耳球蟲兩個(gè)保守蛋白的初步研究[D]. 翟頎.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[4]基于SNP的捻轉(zhuǎn)血矛線蟲(H.contortus)遺傳多樣性分析及P-糖蛋白基因核苷酸差異位點(diǎn)篩選[D]. 葛程.上海師范大學(xué) 2015
[5]P2X7受體和TCP-1蛋白在淋巴瘤中的表達(dá)及相關(guān)性研究[D]. 曾佳.大連醫(yī)科大學(xué) 2013
[6]細(xì)粒棘球絳蟲GAPDH蛋白的生物信息學(xué)分析及其重組表達(dá)純化和酶活性檢測(cè)[D]. 吳巨龍.蘭州大學(xué) 2013
[7]柔嫩艾美耳球蟲鈣依賴蛋白激酶的研究[D]. 李洋.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
本文編號(hào):2915111
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:93 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
純化的柔嫩艾美耳球蟲4個(gè)階段蟲體Fig.2.1Purified4developmentalstagesofEimeriatenellaA:孢子化卵囊(×200);B:未孢子化卵囊(×200);C:子孢子(×200);D:裂殖子(×400)
經(jīng)凝膠電泳分析其完整性(圖2.2),可見提取的總 RNA 具有典型的 3 個(gè)條帶,表明提取的 RNA 未被降解,完整性較好。分光光度計(jì)檢測(cè)結(jié)果 OD260/OD280=1.93,表明 RNA 未被蛋白質(zhì)和 DNA 污染,可進(jìn)行下一步的反轉(zhuǎn)錄,用反轉(zhuǎn)錄 M-MLV 試劑盒,得到柔嫩美耳球蟲孢子化卵囊的 cDNA 第一鏈,保存于-20℃。
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第二章 4 個(gè)耐藥相關(guān)基因的克隆和生物信息學(xué)分析因的 cDNA 片段。2.3.3.4 EtMDH 基因的 ORF 克隆根據(jù) EtMDH 基因 ORF 序列,設(shè)計(jì)特異性引物,以柔嫩艾美耳球蟲孢子化卵囊 cDNA 為模板,設(shè)定合適的退火溫度進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增。瓊脂糖凝膠電泳對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行分析,可以發(fā)現(xiàn)在 954 bp處有特異性的單一條帶(圖 2.3D),與預(yù)期條帶位置相符;將條帶位置正確的 PCR 產(chǎn)物切下,用膠回收試劑盒對(duì) PCR 產(chǎn)物進(jìn)行回收。純化后的 PCR 產(chǎn)物與 pGEM-T-easy 載體 4℃條件下連接 8h 后,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌 TOP10 感受態(tài)細(xì)胞中,在 LB 固體平板中挑取陽性菌落進(jìn)行培養(yǎng),并用 PCR 對(duì)菌液進(jìn)行鑒定和測(cè)序。測(cè)序結(jié)果與原序列比對(duì)正確,表明成功擴(kuò)增獲得 EtMDH 基因的 cDNA 片段。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抗精噁唑禾草靈和甲基二磺隆看麥娘ACCase和ALS基因突變[J]. 趙寧,郭文磊,李偉,呂玲玲,劉偉堂,王金信. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2017(05)
[2]四個(gè)半LIM結(jié)構(gòu)域蛋白1對(duì)人肝癌細(xì)胞紫杉醇耐藥影響的研究[J]. 周蕾,姜妮,周心娜,王小利,任軍. 中國臨床藥理學(xué)雜志. 2017(12)
[3]小檗堿對(duì)禽源大腸桿菌抑菌作用及耐藥消除作用的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[J]. 張石磊,翟向和,王春光,陳諫,賈澤,張鐵. 中國畜牧獸醫(yī). 2017(05)
[4]惡性瘧原蟲與耐藥性相關(guān)分子遺傳標(biāo)記的研究進(jìn)展[J]. 徐超,黃炳成,閆歌,魏慶寬. 中國病原生物學(xué)雜志. 2016(12)
[5]柔嫩艾美耳球蟲2個(gè)抗藥株的抗藥性評(píng)估[J]. 謝雨翔,韓紅玉,趙其平,王自文,董輝,徐帥兵,朱順海,崔曉霞,唐敏,楊志遠(yuǎn),黃兵. 中國動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2016(06)
[6]耿氏硬草對(duì)乙酰輔酶A羧化酶類除草劑抗性水平及分子機(jī)制初探[J]. 袁國徽,王恒智,趙寧,路興濤,劉偉堂,王金信. 農(nóng)藥學(xué)學(xué)報(bào). 2016(03)
[7]乙酰輔酶A羧化酶B基因多態(tài)性與2型糖尿病的相關(guān)性研究[J]. 唐俊婷,李會(huì)芳,劉華,王玉明,宋滇平. 中國糖尿病雜志. 2016(01)
[8]鼠傷寒沙門菌ATCC13311誘導(dǎo)耐藥株的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和分析[J]. 李琳,馮帥,汪瑩,代興楊,楊艷菲,曾明華. 中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2015(07)
[9]乙酰輔酶A羧化酶基因多態(tài)性與冠心病關(guān)系[J]. 陳業(yè)達(dá),張高華,梁巖,林美華,張乃尊,金律,饒紹奇. 中國公共衛(wèi)生. 2015(09)
[10]抗精噁唑禾草靈的日本看麥娘ACCase基因突變[J]. 畢亞玲,吳翠霞,郭文磊,李琦,李蓉榮,王金信. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2015(03)
博士論文
[1]基于全基因組SNP對(duì)豬品種分子種質(zhì)特性挖掘與保護(hù)的研究[D]. 李文婷.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]骨膜蛋白在非小細(xì)胞肺癌中的作用及相關(guān)機(jī)制的研究[D]. 胡文霞.河北醫(yī)科大學(xué) 2017
[3]空腸彎曲菌酰胺醇類誘導(dǎo)耐藥株與敏感株的組學(xué)比較研究[D]. 李會(huì).中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]中華按蚊擬除蟲菊酯殺蟲劑抗性研究[D]. 朱國鼎.蘇州大學(xué) 2014
[5]應(yīng)用全基因組重測(cè)序技術(shù)初步探討瘢痕增生的發(fā)病機(jī)制[D]. 劉暢.中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院 2014
[6]牙鲆微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選和美洲牡蠣抗病相關(guān)基因SNP的初步分析[D]. 于海洋.中國海洋大學(xué) 2010
[7]羊胃腸線蟲對(duì)常用驅(qū)蟲藥抗藥性的初步研究[D]. 蔡葵蒸.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[8]帶科主要絳蟲45W和14ku/18ku基因變異的研究[D]. 賈萬忠.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2003
碩士論文
[1]浮游態(tài)和生物被膜狀態(tài)嗜水氣單胞菌對(duì)四環(huán)素耐藥相關(guān)蛋白的研究[D]. 李碗芯.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[2]中華按蚊線粒體基因組進(jìn)化及抗藥性相關(guān)基因多態(tài)性研究[D]. 王琰.第二軍醫(yī)大學(xué) 2015
[3]柔嫩艾美耳球蟲兩個(gè)保守蛋白的初步研究[D]. 翟頎.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[4]基于SNP的捻轉(zhuǎn)血矛線蟲(H.contortus)遺傳多樣性分析及P-糖蛋白基因核苷酸差異位點(diǎn)篩選[D]. 葛程.上海師范大學(xué) 2015
[5]P2X7受體和TCP-1蛋白在淋巴瘤中的表達(dá)及相關(guān)性研究[D]. 曾佳.大連醫(yī)科大學(xué) 2013
[6]細(xì)粒棘球絳蟲GAPDH蛋白的生物信息學(xué)分析及其重組表達(dá)純化和酶活性檢測(cè)[D]. 吳巨龍.蘭州大學(xué) 2013
[7]柔嫩艾美耳球蟲鈣依賴蛋白激酶的研究[D]. 李洋.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2010
本文編號(hào):2915111
本文鏈接:http://www.sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/2915111.html
最近更新
教材專著