光照信號速激肽及其受體基因調(diào)節(jié)山羊生殖激素分泌機理
發(fā)布時間:2020-12-10 10:57
速激肽(Tachykinins,TKs)屬于激肽類家族成員,研究表明,速激肽通過下丘腦神經(jīng)元影響促性腺激素釋放激素(GnRH)的釋放,從而影響動物發(fā)情、排卵和妊娠等一系列生殖過程。目前認為,有兩個主要通路調(diào)控哺乳動物繁殖現(xiàn)象,一是受外界光照的影響,松果體分泌褪黑激素直接作用于垂體峽部結節(jié)部,調(diào)控促甲狀腺素,然后促甲狀腺激素把信息反饋至下丘腦來調(diào)控哺乳動物相應的生殖功能;另外一個通路是垂體通過調(diào)節(jié)催乳素(PRL)節(jié)律性釋放來調(diào)節(jié)哺乳動物的季節(jié)性繁殖現(xiàn)象,這個通路中的重要信號物質(zhì)可能包括速激肽在內(nèi)的一系列低分子量肽。因此,研究速激肽及其受體基因在山羊下丘腦、垂體和卵巢等組織器官內(nèi)的表達量變化與長短光照之間的聯(lián)系,為探究其參與山羊繁殖過程調(diào)控下丘腦-垂體-性腺軸作用機理提供理論依據(jù)。本試驗以飼養(yǎng)在河南科技大學周山校區(qū)牧場的20只河南槐山羊空懷母羊為研究對象,母羊平均年齡一周歲,平均體重37.75kg。羊只的光照處理分為短光照時期(8 h光照:16 h黑暗)和長光照時期(16 h光照:8 h黑暗),短光照期為六周,長光照期為四周。利用Primer Premier 6.0引物設計軟件,設計目的基...
【文章來源】:河南科技大學河南省
【文章頁數(shù)】:95 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
RNA提取結果凝膠電泳圖
處理與參考基因組的比對分析裝軟件 Trinity 對下丘腦轉(zhuǎn)錄組從頭組裝[78]。首先使用 SOAPdens(芯片上每個反應讀出的短序列)通過片段重疊連成更長的再將 Contig 連在 起得到兩端不能再延長的序列 Unigene,再對理,進 步拼接(Tophat2 軟件[80])。利用 Cufflinks[81]對 TopHat進 行 組 裝 , 并 將 處 理 后 的 高 質(zhì) 量 reads 與 參 考 基01704415.1,包含 28404 注釋基因)進行比對,獲得各樣品 read reads 在基因組上的位置信息。lean Reads 與參考基因組的序列比對,以獲得在參考基因組或基(圖 3-2),定位區(qū)域分為 Exon(外顯子)、Intron(內(nèi)含子(基因間區(qū))。由比對到參考基因組上的 Reads(Mapped Reaads 的百分比表明,所選參考基因組組裝可以滿足信息分析的需求
圖 3-3 不同實驗組差異基因火山圖Fig.3-3 Different gene volcanoes in different experimental groups注:橫坐標代表基因在不同樣本中表達倍數(shù)變化,縱坐標代表基因表達量變化差異的統(tǒng)計學顯著性;差異表達顯著的基因用紅點(上調(diào))和綠點(下調(diào))表示。差異表達不顯著的基因用藍點表示。Note:The horizontal coordinates represent multiple changes in the expression of genes in differentsamples and the difference of gene expression was statistically significant. The differentiallyexpressed genes were indicated by red dots (up-regulation) and green dots (down-regulation).Genes that are not differentially expressed are represented by blue dots差異基因聚類分析結果表明,E2F2 與 O1P1 兩實驗組的差異基因表達譜相近,而 G2H2 與 L1M1 兩實驗組的差異基因表達譜相近(圖 3-4)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Expression of TAC1 and Its Receptors TACR1,TACR2,TACR3 Genes in Different Goat Tissues Under Different Photoperiods[J]. Yuqin WANG,Huibin SHI,Zhilong TIAN,Xiaohui ZHANG,Fang YANG,Yuanxiao LI,Qiujue WU,Jian-ping WANG. Agricultural Biotechnology. 2019(01)
[2]Assessment of Serum PRL,MLT,TSH,FSH and LH Concentrations in the Goat (Capra hircus) Exposing to Different Photoperiod Regimes[J]. Huibin SHI,Zhilong TIAN,Yuqin WANG,Zhibo WU,Fang YANG,Jianping WANG,Mingxing CHU,Cai Hong WEI. Agricultural Biotechnology. 2018(04)
[3]速激肽及其受體基因在哺乳動物生殖領域的研究[J]. 王玉琴,吳至博,張小輝,楊芳,田志龍,施會彬,王建平,李元曉. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(03)
[4]轉(zhuǎn)錄組測序技術在綿山羊育種中的應用研究進展[J]. 路婉茹,徐紅偉,臧榮鑫,陳興麗. 西北民族大學學報(自然科學版). 2017(03)
[5]精子相關抗原6與速激肽1相互作用關系的探討[J]. 閔潔,李夢穎,柳赟昊,劉晙玭,雙超凡,張玲,張志兵. 中華男科學雜志. 2016(12)
[6]轉(zhuǎn)錄組測序技術在絨毛用羊中的應用研究進展[J]. 李曉燕,王曉鑠,王樂樂,張燕軍,蘇蕊,王瑞軍,李金泉. 中國畜牧獸醫(yī). 2015(07)
[7]控制光照對內(nèi)蒙古白絨山羊母羊營養(yǎng)物質(zhì)消化率的影響研究[J]. 李勝利,孫海洲,趙存發(fā),郝巴雅斯胡良,谷英,桑丹,凌樹禮,珊丹,華莉. 家畜生態(tài)學報. 2014(09)
[8]基于RNA-Seq高通量測序技術的牦牛卵巢轉(zhuǎn)錄組研究:進一步完善牦;蚪Y構及挖掘與繁殖相關新基因[J]. 蘭道亮,熊顯榮,位艷麗,徐通,鐘金城,字向東,王永,李鍵. 中國科學:生命科學. 2014(03)
[9]常年發(fā)情和季節(jié)性發(fā)情綿羊在不同季節(jié)生殖激素變化規(guī)律[J]. 賀建寧,王金鑫,狄冉,王耀武,孫曉笛,楊志敏,劉秋月,張鑫榮,任德新,崔保國,蔡占榮,儲明星. 畜牧獸醫(yī)學報. 2013(10)
[10]P物質(zhì)及P物質(zhì)受體在神經(jīng)病理性疼痛中的作用研究進展[J]. 楊敏,祝高春,劉曾旭. 南昌大學學報(醫(yī)學版). 2013(07)
博士論文
[1]小尾寒羊和杜泊羊臂二頭肌轉(zhuǎn)錄組及肌球蛋白輕鏈基因家族結構特征分析[D]. 張春蘭.山東農(nóng)業(yè)大學 2014
碩士論文
[1]綿羊囊胚和孵化囊胚的轉(zhuǎn)錄組測序分析[D]. 石曉雷.新疆農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]P物質(zhì)介導TRPV1在小鼠急性心肌梗死后凋亡中的保護作用[D]. 張羿.重慶醫(yī)科大學 2015
[3]速激肽通路基因多態(tài)性與結直腸癌易感性的關聯(lián)研究[D]. 潘益峰.浙江大學 2012
[4]基于RNA-Seq技術的人轉(zhuǎn)錄組分析研究[D]. 陳超.中南大學 2011
本文編號:2908579
【文章來源】:河南科技大學河南省
【文章頁數(shù)】:95 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
RNA提取結果凝膠電泳圖
處理與參考基因組的比對分析裝軟件 Trinity 對下丘腦轉(zhuǎn)錄組從頭組裝[78]。首先使用 SOAPdens(芯片上每個反應讀出的短序列)通過片段重疊連成更長的再將 Contig 連在 起得到兩端不能再延長的序列 Unigene,再對理,進 步拼接(Tophat2 軟件[80])。利用 Cufflinks[81]對 TopHat進 行 組 裝 , 并 將 處 理 后 的 高 質(zhì) 量 reads 與 參 考 基01704415.1,包含 28404 注釋基因)進行比對,獲得各樣品 read reads 在基因組上的位置信息。lean Reads 與參考基因組的序列比對,以獲得在參考基因組或基(圖 3-2),定位區(qū)域分為 Exon(外顯子)、Intron(內(nèi)含子(基因間區(qū))。由比對到參考基因組上的 Reads(Mapped Reaads 的百分比表明,所選參考基因組組裝可以滿足信息分析的需求
圖 3-3 不同實驗組差異基因火山圖Fig.3-3 Different gene volcanoes in different experimental groups注:橫坐標代表基因在不同樣本中表達倍數(shù)變化,縱坐標代表基因表達量變化差異的統(tǒng)計學顯著性;差異表達顯著的基因用紅點(上調(diào))和綠點(下調(diào))表示。差異表達不顯著的基因用藍點表示。Note:The horizontal coordinates represent multiple changes in the expression of genes in differentsamples and the difference of gene expression was statistically significant. The differentiallyexpressed genes were indicated by red dots (up-regulation) and green dots (down-regulation).Genes that are not differentially expressed are represented by blue dots差異基因聚類分析結果表明,E2F2 與 O1P1 兩實驗組的差異基因表達譜相近,而 G2H2 與 L1M1 兩實驗組的差異基因表達譜相近(圖 3-4)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Expression of TAC1 and Its Receptors TACR1,TACR2,TACR3 Genes in Different Goat Tissues Under Different Photoperiods[J]. Yuqin WANG,Huibin SHI,Zhilong TIAN,Xiaohui ZHANG,Fang YANG,Yuanxiao LI,Qiujue WU,Jian-ping WANG. Agricultural Biotechnology. 2019(01)
[2]Assessment of Serum PRL,MLT,TSH,FSH and LH Concentrations in the Goat (Capra hircus) Exposing to Different Photoperiod Regimes[J]. Huibin SHI,Zhilong TIAN,Yuqin WANG,Zhibo WU,Fang YANG,Jianping WANG,Mingxing CHU,Cai Hong WEI. Agricultural Biotechnology. 2018(04)
[3]速激肽及其受體基因在哺乳動物生殖領域的研究[J]. 王玉琴,吳至博,張小輝,楊芳,田志龍,施會彬,王建平,李元曉. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(03)
[4]轉(zhuǎn)錄組測序技術在綿山羊育種中的應用研究進展[J]. 路婉茹,徐紅偉,臧榮鑫,陳興麗. 西北民族大學學報(自然科學版). 2017(03)
[5]精子相關抗原6與速激肽1相互作用關系的探討[J]. 閔潔,李夢穎,柳赟昊,劉晙玭,雙超凡,張玲,張志兵. 中華男科學雜志. 2016(12)
[6]轉(zhuǎn)錄組測序技術在絨毛用羊中的應用研究進展[J]. 李曉燕,王曉鑠,王樂樂,張燕軍,蘇蕊,王瑞軍,李金泉. 中國畜牧獸醫(yī). 2015(07)
[7]控制光照對內(nèi)蒙古白絨山羊母羊營養(yǎng)物質(zhì)消化率的影響研究[J]. 李勝利,孫海洲,趙存發(fā),郝巴雅斯胡良,谷英,桑丹,凌樹禮,珊丹,華莉. 家畜生態(tài)學報. 2014(09)
[8]基于RNA-Seq高通量測序技術的牦牛卵巢轉(zhuǎn)錄組研究:進一步完善牦;蚪Y構及挖掘與繁殖相關新基因[J]. 蘭道亮,熊顯榮,位艷麗,徐通,鐘金城,字向東,王永,李鍵. 中國科學:生命科學. 2014(03)
[9]常年發(fā)情和季節(jié)性發(fā)情綿羊在不同季節(jié)生殖激素變化規(guī)律[J]. 賀建寧,王金鑫,狄冉,王耀武,孫曉笛,楊志敏,劉秋月,張鑫榮,任德新,崔保國,蔡占榮,儲明星. 畜牧獸醫(yī)學報. 2013(10)
[10]P物質(zhì)及P物質(zhì)受體在神經(jīng)病理性疼痛中的作用研究進展[J]. 楊敏,祝高春,劉曾旭. 南昌大學學報(醫(yī)學版). 2013(07)
博士論文
[1]小尾寒羊和杜泊羊臂二頭肌轉(zhuǎn)錄組及肌球蛋白輕鏈基因家族結構特征分析[D]. 張春蘭.山東農(nóng)業(yè)大學 2014
碩士論文
[1]綿羊囊胚和孵化囊胚的轉(zhuǎn)錄組測序分析[D]. 石曉雷.新疆農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]P物質(zhì)介導TRPV1在小鼠急性心肌梗死后凋亡中的保護作用[D]. 張羿.重慶醫(yī)科大學 2015
[3]速激肽通路基因多態(tài)性與結直腸癌易感性的關聯(lián)研究[D]. 潘益峰.浙江大學 2012
[4]基于RNA-Seq技術的人轉(zhuǎn)錄組分析研究[D]. 陳超.中南大學 2011
本文編號:2908579
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