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廣西地區(qū)犬細(xì)小病毒的分子流行病學(xué)調(diào)查研究

發(fā)布時(shí)間:2020-10-09 16:19
   為了解廣西地區(qū)犬細(xì)小病毒病的流行病學(xué)情況,及時(shí)發(fā)現(xiàn)和掌握疫情動(dòng)態(tài),現(xiàn)將2015年1月1日至2017年12月31日期間,在廣西地區(qū)的11861例犬傳染性病毒病(以犬瘟熱病毒(canine distemper virus,CDV)、犬細(xì)小病毒(canine parvovirus,CPV)、犬冠狀病毒(canine coronavirus,CCV)為主)及其中7107例犬細(xì)小病毒病單一感染和犬細(xì)小病毒病混合感染的門診記錄情況進(jìn)行調(diào)查分析。結(jié)果表明:犬細(xì)小病毒感染存在性別、年齡、品種、季節(jié)和免疫狀況等方面的差異,其中公犬感染率高,2-3月齡幼犬感染率高,純種犬發(fā)病率高,3-5月份犬發(fā)病率高,未免疫接種的犬感染率高。本實(shí)驗(yàn)建立了快速檢測(cè)犬細(xì)小病毒的PCR方法,最低能檢測(cè)出5-6×6.1342ng/μL的病毒DNA。隨機(jī)采集2016~2017年來(lái)自廣西地區(qū)的120只患病動(dòng)物應(yīng)用膠體金免疫層析法確診為犬細(xì)小病毒的臨床病料,應(yīng)用已建立的PCR檢測(cè)方法對(duì)其進(jìn)行二次檢測(cè),120只患病動(dòng)物的病料均為陽(yáng)性,檢出率為100%。PCR方法檢測(cè)CPV具有更高的靈敏性,而膠體金免疫層析法在臨床操作上更加快捷簡(jiǎn)便。通過(guò)對(duì)廣西不同地區(qū)的120份臨床病料的CPV VP2全基因測(cè)序結(jié)果進(jìn)行CPV亞型分析,發(fā)現(xiàn)CPV-2c亞型占59.17%(71/120),CPV--2亞型占25.83%(31/120),CPV-2b 亞型占 15.00%(18/120),表明 2016~2017年廣西地區(qū)的CPV主要流行的亞型為CPV-2c和CPV-2a,而CPV-2b的比例較低,無(wú)CPV-2亞型,這也是廣西地區(qū)首次發(fā)現(xiàn)CPV-2c;分離株之間以及與參考毒株之間的核苷酸序列、氨基酸序列的同源性都較高。通過(guò)對(duì)從PCR鑒定VP2全基因?yàn)殛?yáng)性的120份樣品(糞便)DNA隨機(jī)挑選出10份樣品進(jìn)行CPV全基因測(cè)序,從測(cè)序結(jié)果可知全基因的核苷酸同源性較高,但氨基酸同源性有高有低,而VP2的核苷酸及氨基酸的同源性都較高,再結(jié)合臨床癥狀觀察可知,這10個(gè)樣品所對(duì)應(yīng)的病犬的臨床癥狀都符合犬細(xì)小病毒病的臨床癥狀,所以CPV起抗原決定簇作用的部位在VP2片段上,與報(bào)道相符合。綜上所述,廣西地區(qū)犬細(xì)小病毒病的分子流行病學(xué)調(diào)查及遺傳差異分析,為探討臨床免疫失敗的原因及有針對(duì)性地開發(fā)寵物用CPV疫苗奠定了理論基礎(chǔ)。
【學(xué)位單位】:廣西大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S858.292
【部分圖文】:

退火溫度,犬細(xì)小病毒,片段


57.0oC、58.0°C、59.0。0、60.00C的退火溫度中,均可擴(kuò)增出明顯的DNA片段,且擴(kuò)增逡逑出來(lái)的DNA片段值與期望值693bp相當(dāng),最后通過(guò)從各方面因素考慮,選擇最終的退逡逑火溫度為55.0°C邋(圖3-1)。逡逑M邋1邐2邐3邐4邐5邐6789邐10逡逑__邋Jl?■栜:1j#二逡逑2000邋bp逡逑圖3-1邋PCR檢測(cè)的最佳退火溫度逡逑Fig.3-1邋The邋optimum邋annealing邋temperature邋for邋PCR邋detection逡逑M:邋DL2000邋DNAMarker;邋1?10為犬細(xì)小病毒DNA的PCR產(chǎn)物,退火溫度分別為51.0°C、52.0°C、逡逑53.0。。、54.0。0、55.0°C、56.0。0、57.0°C、58.0。。、59.0。。、60.0。0。逡逑3.3.I.2最適DNA模板量的確立逡逑通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳顯示,觀察到在犬細(xì)小病毒(CPV)DNA模板的量分別為0.2pL、逡逑0_4jjL、0.6|iL、0.8pL、l_0pL、1.2|iL、1.4叫、1.6pL、1.8|iL、2.0nL邋中,均可擴(kuò)增出明逡逑顯的DNA片段,且擴(kuò)增出來(lái)的DNA片段值與期望值693bp相當(dāng),最后通過(guò)從各方面逡逑因素考慮

引物,犬細(xì)小病毒


邐廣西地區(qū)犬細(xì)小病毒的分子流行病學(xué)調(diào)查研究逡逑M邋123456789邐10逡逑圖3-2邋PCR檢測(cè)的最佳DNA模板量逡逑Fig.3-2邋The邋optimal邋DNA邋template邋amount邋for邋PCR邋detection逡逑M:邋DL2000DNAMarker;邋1?10為犬細(xì)小病毒DNA的PCR產(chǎn)物,犬細(xì)小病毒DNA模板的量分別逡逑為邋0.2jiL、0.4jiL、0.6|aL、0.8jjJL、l.OjiL、1.2(iL、1.4|iL、1.6jiL、1.8|iL、2.0|iL。逡逑3.3.1.3最適引物量的確立逡逑通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳顯示,觀察到在上下游引物(GXP-F1和GXP-R1)的量分別逡逑為邋0.2pL、0.4|iL、0.6(iL、0_8|iL、1.0(_iL、1.2(JL、1.4jiL、1.6(iL、1.8|iL、2.0(iL邋中,均逡逑可擴(kuò)增出明顯的DNA片段,且擴(kuò)增出來(lái)的DNA片段值與期望值693bp相當(dāng),最后通逡逑過(guò)從各方面因素考慮,選擇最終的引物量均為1.0邐(圖>3)。逡逑M邋1邐2邐3邐4邐5邐6邐7邐8邐9邐10逡逑\邐、v/邋<V”;邐>邋w邋、邋V邐:邋,丫邋、?4逡逑__焌嫇趣~杶朸~霉i媝囊1嫇灥逡逑bp邐廣':逡逑圖3-3邋PCR檢測(cè)的最佳引物量逡逑Fig.3-3邋The邋optimum邋primer邋quantity邋for邋PCR邋detection逡逑M:邋DL2000DNAMarker;邋1?10為犬細(xì)小病毒DNA的PCR產(chǎn)物

模板,反應(yīng)體系,犬細(xì)小病毒,引物


__焌嫇趣~杶朸~霉i媝囊1嫇灥逡逑bp邐廣':逡逑圖3-3邋PCR檢測(cè)的最佳引物量逡逑Fig.3-3邋The邋optimum邋primer邋quantity邋for邋PCR邋detection逡逑M:邋DL2000DNAMarker;邋1?10為犬細(xì)小病毒DNA的PCR產(chǎn)物,引物(GXP-F1和GXP-R1)的逡逑量分別為邋0.2叫、0.4nL、0.6叫、0.8[iL、l.OpL、1.2|aL、1.4叫、1.6叫、1.8叫、2.0nL。逡逑3.3.1.4邋PCR反應(yīng)體系和循環(huán)參數(shù)的確立逡逑3.3.1.4.1PCR反應(yīng)體系逡逑27逡逑

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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本文編號(hào):2833910

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