【摘要】：拷貝數(shù)變異(CNV)是基因組中一種重要的遺傳標(biāo)記,其通過(guò)調(diào)節(jié)基因的表達(dá)量、調(diào)控因子和基因的相對(duì)位置、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域以及下游的信號(hào)通路來(lái)影響動(dòng)物的復(fù)雜性狀。將CNV與動(dòng)物的生長(zhǎng)性狀和基因表達(dá)量進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析是鑒定相關(guān)QTL的一種有效手段。之前研究發(fā)現(xiàn),細(xì)胞周期檢查點(diǎn)激酶β(CHKB),Krupple樣因子6(KLF6),磷脂酰肌醇蛋白聚糖1(GPC1)和毒蕈堿型乙酰膽堿受體3(CHRM3)基因在牦�；蚪M中存在CNV,且位于生長(zhǎng)性狀和肉品質(zhì)性狀的QTL中。本研究檢測(cè)了5個(gè)品種牦牛群體中(大通牦牛,無(wú)角牦牛,甘南牦牛,天祝白牦牛和高原牦牛)KLF6,CHKB,GPC1和CHRM3基因CNV的分布,并分析其對(duì)生長(zhǎng)性狀(體重、體高、體斜長(zhǎng)、胸圍和管?chē)?和基因表達(dá)量的影響。通過(guò)在5個(gè)中國(guó)牛群體中檢測(cè)KLF6,CHKB,GPC1和CHRM3基因CNV的分布,發(fā)現(xiàn)在6月齡和5周歲的大通牦牛群體中,CHKB和GPC1基因Normal拷貝數(shù)類(lèi)型個(gè)體的體高、體斜長(zhǎng)、體重和胸圍顯著高于其他拷貝數(shù)類(lèi)型個(gè)體(P0.05);KLF6基因的CNV與體重、體高和胸圍顯著關(guān)聯(lián)(P0.05),CHRM3基因的CNV與5個(gè)生長(zhǎng)性狀均顯著相關(guān)(P0.05)。這些結(jié)果表明CHKB,KLF6,GPC1和CHRM3基因的CNV可能對(duì)牦牛的生長(zhǎng)性狀具有重要的影響。CHKB,KLF6和GPC1基因在天祝白牦牛、甘南牦牛和青海高原牦牛群體中Loss拷貝數(shù)類(lèi)型頻率較高,為優(yōu)勢(shì)拷貝數(shù)類(lèi)型,而在大通牦牛和無(wú)角牦牛群體中Gain拷貝數(shù)類(lèi)型較高。CHRM3基因Gain拷貝數(shù)類(lèi)型在5個(gè)群體中都屬于優(yōu)勢(shì)拷貝數(shù)類(lèi)型。CHKB、KLF6、GPC1和CHRM3基因的表達(dá)量在牦牛腦、肺和肌肉組織中表達(dá)量較高,且在胎牛各組織中的表達(dá)量高于成年牛,說(shuō)明這些基因在細(xì)胞增殖和分化中發(fā)揮著重要的生物學(xué)作用。相關(guān)性分析結(jié)果表明,CHKB,KLF6,GPC1和CHRM3基因的表達(dá)量與CNV呈負(fù)相關(guān),說(shuō)明這4個(gè)基因可能通過(guò)調(diào)節(jié)其在肌肉組織中的表達(dá)量來(lái)影響牦牛的生長(zhǎng)性狀。綜上所述,CHKB,KLF6,GPC1和CHRM3基因的CNV可作為牦牛生長(zhǎng)性狀的候選遺傳標(biāo)記,為牦牛生產(chǎn)性能的選育與提高提供了科學(xué)依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類(lèi)號(hào)】：S823.85


本文編號(hào)：2766353