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鴨蛋蛋殼顏色的遺傳機(jī)制及其與蛋殼質(zhì)量的關(guān)系研究

發(fā)布時(shí)間:2017-03-28 04:00

  本文關(guān)鍵詞:鴨蛋蛋殼顏色的遺傳機(jī)制及其與蛋殼質(zhì)量的關(guān)系研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:蛋殼顏色是影響禽蛋品質(zhì)的指標(biāo)之一。綠殼是家禽中普遍存在的一種蛋殼顏色,綠殼蛋以其獨(dú)特的蛋殼顏色和豐富的營(yíng)養(yǎng)深受消費(fèi)者喜愛,但是迄今為止在綠殼蛋研究方面仍有兩個(gè)問題尚未解答:(1)綠殼蛋蛋殼顏色是由膽綠素(一種膽汁色素)在蛋殼中的沉積所引起。這種蛋殼色素的加入是否會(huì)影響蛋殼的質(zhì)量?(2)雞綠殼蛋性狀是由SLCO1B3基因變異引起,但進(jìn)一步檢測(cè)卻發(fā)現(xiàn)鴨綠殼蛋的性狀并非由相同的突變?cè)斐。造成鴨綠色蛋殼表型的形成的遺傳機(jī)制是什么?本研究以鴨綠色蛋殼性狀為研究對(duì)象,在金定麻鴨群體中選取綠殼鴨蛋272枚、白殼鴨蛋315枚,并測(cè)定鴨蛋的蛋殼顏色、蛋殼厚度和蛋殼強(qiáng)度。分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)綠殼鴨蛋的蛋殼強(qiáng)度、蛋殼厚度均顯著高于白殼蛋(P0.05),鴨蛋的蛋殼厚度與蛋殼強(qiáng)度之間沒有顯著的關(guān)聯(lián),蛋殼的顏色與蛋殼強(qiáng)度及厚度之間也沒有顯著的關(guān)聯(lián)。對(duì)綠殼鴨蛋形成機(jī)制的研究,主要采用反向遺傳學(xué)的思路從檢測(cè)差異表達(dá)基因著手探索可能潛在的分子調(diào)控機(jī)制。試驗(yàn)選取3只白殼鴨、3只綠殼鴨,利用下一代測(cè)序技術(shù)對(duì)合成和分泌蛋殼色素的關(guān)鍵部位——蛋殼腺進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。結(jié)果在綠殼鴨和白殼鴨蛋殼腺中共發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因1438個(gè)(P0.05,FDR q0.05),其中綠殼鴨相對(duì)于白殼鴨有677個(gè)基因上調(diào)表達(dá),761個(gè)基因下調(diào)表達(dá)。功能富集分析結(jié)果顯示,差異表達(dá)基因主要參與細(xì)胞膜的構(gòu)成及物質(zhì)在細(xì)胞膜中的轉(zhuǎn)運(yùn)過程。有機(jī)離子轉(zhuǎn)運(yùn)多肽(OATP)是一類介導(dǎo)多種物質(zhì)在細(xì)胞膜轉(zhuǎn)運(yùn)的膜蛋白,而負(fù)責(zé)綠殼著色的膽綠素正是其轉(zhuǎn)運(yùn)的底物之一。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果和OATP基因家族的功能指出OATP基因家族成員是研究禽類綠殼蛋形成機(jī)制的重要候選基因。本研究應(yīng)用RT-PCR技術(shù)對(duì)OATP基因家族中的10個(gè)基因在蛋殼腺和肝臟中的表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)SLCO2B1基因在綠殼鴨蛋殼腺中正常表達(dá),但在白殼鴨蛋殼腺中不表達(dá)。其余9個(gè)基因或者在兩個(gè)群體中均不表達(dá),或者表達(dá)未見顯著差異。為了闡明SLCO2B1差異表達(dá)的原因,本研究利用RACE和RT-PCR技術(shù)克隆SLCO2B1基因完整轉(zhuǎn)錄本序列,經(jīng)序列比對(duì)SLCO2B1基因序列在綠殼和白殼鴨間同源性高達(dá)98.64%,這說明SLCO2B1基因的表達(dá)差異不是由引物結(jié)合異常引起。同時(shí),本研究對(duì)SLCO2B1基因上游5 kb及前6個(gè)外顯子區(qū)域序列進(jìn)行了重測(cè)序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)該基因存在多處與綠殼性狀顯著關(guān)聯(lián)的結(jié)構(gòu)變異。這一結(jié)果支持SLCO2B1基因表達(dá)差異更有可能是由順式元件突變引起。綜上所述,本研究結(jié)果支持蛋殼顏色和蛋殼質(zhì)量間存在生物學(xué)聯(lián)系。鑒于綠殼鴨蛋在蛋殼厚度和強(qiáng)度方面的優(yōu)勢(shì),開展綠殼蛋鴨選育對(duì)改善鴨蛋蛋殼質(zhì)量,降低破蛋率具有積極的意義。轉(zhuǎn)錄組研究結(jié)果指出鴨綠色蛋殼表型的形成很可能與細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)或是細(xì)胞膜轉(zhuǎn)運(yùn)功能的異常有關(guān)。對(duì)OATP基因家族成員的進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),SLCO2B1表達(dá)水平在綠殼鴨和白殼鴨間存在較大差異,是研究鴨綠色蛋殼表型遺傳基礎(chǔ)的重要候選基因,未來對(duì)SLCO2B1調(diào)節(jié)突變的鑒定將有助于闡釋鴨綠色蛋殼表型形成的機(jī)制,進(jìn)而為綠殼鴨的選育提供一種分子檢測(cè)的手段。
【關(guān)鍵詞】: 蛋殼顏色 蛋殼質(zhì)量 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 OATP SLCO2B1
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S834
【目錄】:
  • 摘要6-8
  • ABSTRACT8-12
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述12-21
  • 1.1 國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展12-19
  • 1.1.1 鴨蛋蛋殼色素種類、結(jié)構(gòu)和來源12-13
  • 1.1.2 蛋殼色素的沉積過程13-14
  • 1.1.3 蛋殼顏色的生物學(xué)功能14-15
  • 1.1.4 蛋殼顏色的遺傳學(xué)規(guī)律15-17
  • 1.1.5 OATP基因家族概述17-19
  • 1.2 論文的選題依據(jù)、研究?jī)?nèi)容和研究意義19-21
  • 1.2.1 選題依據(jù)19-20
  • 1.2.2 研究?jī)?nèi)容20
  • 1.2.3 研究意義20-21
  • 第二章 蛋殼顏色與質(zhì)量關(guān)系研究21-28
  • 2.1 試驗(yàn)材料21-22
  • 2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物21
  • 2.1.2 主要的試驗(yàn)儀器21-22
  • 2.2 試驗(yàn)方法22
  • 2.2.1 樣品采集22
  • 2.2.2 蛋殼顏色、厚度和強(qiáng)度測(cè)定22
  • 2.2.3 試驗(yàn)數(shù)據(jù)分析22
  • 2.3 試驗(yàn)結(jié)果22-26
  • 2.3.1 蛋殼質(zhì)量分析22-23
  • 2.3.2 蛋殼強(qiáng)度、厚度與蛋殼顏色之間的關(guān)系23-26
  • 2.4 討論26-27
  • 2.5 小結(jié)27-28
  • 第三章 綠頭鴨蛋殼腺組織轉(zhuǎn)錄組分析28-42
  • 3.1 試驗(yàn)材料28-29
  • 3.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物28
  • 3.1.2 試驗(yàn)儀器和試劑28-29
  • 3.2 試驗(yàn)方法29-31
  • 3.2.1 樣品采集29
  • 3.2.2 蛋殼腺總RNA的提取29
  • 3.2.3 RNA高通量測(cè)序29-30
  • 3.2.4 測(cè)序數(shù)據(jù)分析30-31
  • 3.3 試驗(yàn)結(jié)果31-40
  • 3.3.1 測(cè)序結(jié)果概述31-33
  • 3.3.2 差異表達(dá)基因的檢測(cè)結(jié)果33-34
  • 3.3.3 差異表達(dá)基因的GO富集分析34-35
  • 3.3.4 差異表達(dá)基因的pathway分析35-40
  • 3.4 討論40-41
  • 3.5 小結(jié)41-42
  • 第四章 OATP基因家族研究42-55
  • 4.1 材料與方法42-49
  • 4.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物42
  • 4.1.2 主要試驗(yàn)儀器與試劑42-43
  • 4.1.3 試驗(yàn)方法43-49
  • 4.2 試驗(yàn)結(jié)果49-52
  • 4.2.1 10個(gè)OATP基因RT-PCR檢測(cè)結(jié)果49-51
  • 4.2.2 SLCO2B1基因全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本克隆51
  • 4.2.3 SLCO2B1基因 5‘端序列變異檢測(cè)51-52
  • 4.3 討論52-54
  • 4.4 小結(jié)54-55
  • 結(jié)論55-56
  • 參考文獻(xiàn)56-61
  • 縮略詞表61-62
  • 致謝62-63
  • 作者簡(jiǎn)介63

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本文編號(hào):271593

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