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gga-miR-206在金茅黑雞胚胎骨骼肌發(fā)育中的表達(dá)分析及靶基因驗(yàn)證

發(fā)布時(shí)間:2020-06-11 21:10
【摘要】:miRNAs是近來(lái)發(fā)現(xiàn)重要的表觀遺傳因子,其在轉(zhuǎn)錄后水平對(duì)基因表達(dá)起重要調(diào)控作用,并廣泛參與機(jī)體的各個(gè)生命過(guò)程。胚胎期的肌肉發(fā)育決定了肌纖維的總數(shù),對(duì)畜禽肌肉產(chǎn)量、生長(zhǎng)速度及成年體重等具有至關(guān)重要的影響。為探究miRNA對(duì)胚胎期骨骼肌發(fā)育的調(diào)控作用及其分子機(jī)制,并為肌肉發(fā)育調(diào)控尋找新的靶點(diǎn),以課題組前期通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)篩選到的雞成肌細(xì)胞由增殖到分化各不同時(shí)期差異表達(dá)的關(guān)鍵miRNAs及預(yù)測(cè)的與其表達(dá)成負(fù)相關(guān)的靶基因(P0.01)信息為基礎(chǔ),本試驗(yàn)以其中顯著上調(diào)關(guān)鍵miRNA gga-miR-206(P0.01)作為研究的切入點(diǎn),并結(jié)合其他數(shù)據(jù)庫(kù)共同預(yù)測(cè)結(jié)果選取其中顯著下調(diào)的遠(yuǎn)端上游元件結(jié)合蛋白1(FUBP1)、胸腺素β4(TMSB4X)及酪氨酸3-單加氧酶/色氨酸5-單加氧酶活化蛋白β(YWHAB)(P0.01)作為候選靶基因。分別通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量、雙熒光素酶報(bào)告檢測(cè)系統(tǒng)以三次獨(dú)立并至少兩次重復(fù)試驗(yàn),對(duì)miRNA及各候選靶基因的表達(dá)量以及靶關(guān)系進(jìn)行了探究和鑒定。主要結(jié)果如下:1、gga-miR-206及候選靶基因發(fā)育表達(dá)譜及相關(guān)關(guān)系分析。運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR的方法,分析了 gga-miR-206與候選靶基因在胚胎發(fā)育各不同時(shí)期骨骼肌中的相對(duì)表達(dá)量并通過(guò)軟件對(duì)其之間相關(guān)性進(jìn)行分析。結(jié)果表明,gga-miR-206在腿肌中的表達(dá)整體呈先上升后下降的趨勢(shì),且在16胚齡(E16)達(dá)到高峰(P0.05),在胚胎發(fā)育后期至出生后又有所回升;而在胸肌中表達(dá)整體呈現(xiàn)下降趨勢(shì),10胚齡(E10)時(shí)表達(dá)量最高(P0.05),在16胚齡(E16)出現(xiàn)一個(gè)小高峰。相關(guān)性分析結(jié)果顯示,在雞胚骨骼肌發(fā)育過(guò)程中,YWHAB的表達(dá)與gga-miR-206呈負(fù)相關(guān)(P0.05);其次,TMSB4X與gga-miR-206的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)(P0.05);與之相反,FUBP1的表達(dá)與gga-miR-206之間呈正相關(guān)(P0.05)。2、候選靶基因組織表達(dá)譜構(gòu)建。運(yùn)用qRT-PCR技術(shù)分別檢測(cè)了三個(gè)候選靶基因在300日齡金茅黑雞A系母本8個(gè)組織中的相對(duì)表達(dá)情況,對(duì)各基因功能進(jìn)行初步定位判斷,結(jié)果顯示:FUBP1富集于肝臟和腿肌組織,極顯著高于其余組織中的表達(dá)量(P0.01);相對(duì)于此,FUBP1在心肌中則表達(dá)較少,而在胸肌和卵巢組織中則幾乎不表達(dá);對(duì)于YWHAB則高表達(dá)于骨骼肌組織(P0.01),在心肌中也有少量表達(dá),而在脾和卵巢組織中表達(dá)最低;TMSB4X在各組織中均有不同程度表達(dá),在心肌和胸肌中相對(duì)高表達(dá),其次為腿肌、肝、脾、肺等組織,而在腎和卵巢組織中表達(dá)量最少,與其余組織間差異顯著或極顯著(P0.05 orP0.01)。3、gga-miR-206與YWHAB/FUBP1靶關(guān)系驗(yàn)證。結(jié)合前述研究?jī)?nèi)容,對(duì)gga-miR-206與YWHAB/FUBP1之間的靶關(guān)系進(jìn)行了鑒定。分別構(gòu)建YWHAB/FUBP13'UTR野生型和突變型pmirGLO表達(dá)載體,并與miR-206模擬物、陰性對(duì)照分別共轉(zhuǎn)染人胚腎293T細(xì)胞,以轉(zhuǎn)染空載組作為空白對(duì)照。雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)結(jié)果顯示,與對(duì)照組相比,共轉(zhuǎn)染YWHAB野生型載體與miR-206 mimics組顯著降低螢火蟲(chóng)熒光素酶的相對(duì)活性(P0.05),但其余各組試驗(yàn)組與對(duì)照組之間均無(wú)顯著差異(P0.05)。結(jié)果提示YWHAB與gga-miR-206存在靶關(guān)系,該基因mRNA3'UTR 1429-1435核苷酸序列為關(guān)鍵作用靶點(diǎn);FUBP1則不是gga-miR-206的靶基因。
【圖文】:

完整性檢測(cè),條帶


Ml邋2邋3邐4邋5邋6邋7邐8邋9邋10邋11邋12逡逑■H逡逑999c/999邋cfd-9cf9逡逑圖2.1雞胚的性別鑒定結(jié)果逡逑6.邋2組織RNA完整性檢測(cè)結(jié)果逡逑對(duì)提取的雞各胚齡骨骼肌組織總RNA進(jìn)行檢測(cè),1%瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果(圖2.2)顯逡逑示總RNA的28S和18S條帶清晰,5S幾乎沒(méi)有,28S條帶與18S條帶的比值>1.5;逡逑OD260/OD280介于1.8?2_0之間。表明RNA完整性好,無(wú)DNA、蛋白質(zhì)和其它雜質(zhì)污染,逡逑可用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。逡逑^28S逡逑-lOO逡逑mnn^i-ss逡逑圖2.邋2邋RNA完整性檢測(cè)逡逑(M:邋Marker;邋1、2、3、4邋為各樣品號(hào))逡逑6.邋3邋mi邋RNA定量分析逡逑ABI邋7500熒光定量PCR結(jié)果顯示(圖2.3-圖2.4),擴(kuò)增曲線重疊性好,熔解曲線顯逡逑示為平滑的單峰,在Tm兩邊均無(wú)雜峰。表明所設(shè)計(jì)引物特異性良好,,無(wú)引物二聚體和非逡逑特異性擴(kuò)增。逡逑

性別鑒定,雞胚


圖2.1雞胚的性別鑒定結(jié)果逡逑6.邋2組織RNA完整性檢測(cè)結(jié)果逡逑對(duì)提取的雞各胚齡骨骼肌組織總RNA進(jìn)行檢測(cè),1%瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果(圖2.2)顯逡逑示總RNA的28S和18S條帶清晰,5S幾乎沒(méi)有,28S條帶與18S條帶的比值>1.5;逡逑OD260/OD280介于1.8?2_0之間。表明RNA完整性好,無(wú)DNA、蛋白質(zhì)和其它雜質(zhì)污染,逡逑可用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。逡逑^28S逡逑-lOO逡逑mnn^i-ss逡逑圖2.邋2邋RNA完整性檢測(cè)逡逑(M:邋Marker;邋1、2、3、4邋為各樣品號(hào))逡逑6.邋3邋mi邋RNA定量分析逡逑ABI邋7500熒光定量PCR結(jié)果顯示(圖2.3-圖2.4),擴(kuò)增曲線重疊性好,熔解曲線顯逡逑示為平滑的單峰,在Tm兩邊均無(wú)雜峰。表明所設(shè)計(jì)引物特異性良好,無(wú)引物二聚體和非逡逑特異性擴(kuò)增。逡逑
【學(xué)位授予單位】:揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S831

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本文編號(hào):2708461

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