【摘要】：本研究對(duì)犬瘟熱病毒(Canine distemper virus,CDV)安徽分離株(CDV-AH株)的全基因組序列進(jìn)行了測定和分析。根據(jù)GenBank上已發(fā)表的部分CDV基因組全長序列設(shè)計(jì)了8對(duì)特異性引物,RT-PCR方法分段擴(kuò)增出CDV-AH株的全基因組序列。采用DNAStar軟件和MEGA軟件對(duì)CDV-AH株與其他CDV毒株的基因序列進(jìn)行了比對(duì)和分析,并繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果顯示,CDV-AH株全長15 690 bp,編碼6種結(jié)構(gòu)蛋白(N、P、M、F、H和L),與CDV-PS株核苷酸序列同源性最高,為98.8%,而與CDV-1以及Onderstepoort等疫苗株的序列同源性較低,為92.1%。CDV-AH株在保守區(qū)域出現(xiàn)15處氨基酸突變,這些突變對(duì)其所編碼蛋白結(jié)構(gòu)和功能的影響需要進(jìn)一步研究�；贖基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,CDV-AH株與其他CDV野毒株共同形成一個(gè)拓?fù)淙?屬于亞洲Ⅰ型。
【圖文】：

rvalsequenceORF位置ORFposition編碼氨基酸數(shù)Codedaminoacidnumbers5'端間隔序列5'endintervalsequence基因間隔序列GeneintervalsequenceNAGGGUCAAUGA108-1679523AUUAUAAAAAACUUPAGGACCCAGGU1801-3324507AUUAUAAAAAACUUMAGGACACAAGA3432-4439335AUUAAUCAAAACUUFAGGAUCCAGGA4935-6923662AUUAAAGAAAACUUHAGGGCUCAAGU7079-8902607AUUAUAAAAAAACUULAGGAUCCAGGA9030-155842184AUUAUACGAAAAAAAACUA表2CDV-AH株的基因組結(jié)構(gòu)Table2GenomestructureofCDV-AHstrainbpM1234567820001000750500250100圖1CDV-AH株基因組不同片段的RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1AmplificationresultsofthecompletegenomeofCDV-AHstrainbyRT-PCRM:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn);1~8:CDV-AH株1~8段的RT-PCR產(chǎn)物M:DNAMarker;1-8:GenomefragmentsofCDV-AHstrain80005000300020001000750500250100bpM12圖23'RACE和5'RACE擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.2.Amplificationproductsof3'RACEand5'RACEM:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn);1:3'RACE擴(kuò)增產(chǎn)物;2:5'RACE擴(kuò)增產(chǎn)物M:DNAMarker;1:Amplificationprodutof3'RACE;2:Amplificationproductof5'RACE

FAGGAUCCAGGA4935-6923662AUUAAAGAAAACUUHAGGGCUCAAGU7079-8902607AUUAUAAAAAAACUULAGGAUCCAGGA9030-155842184AUUAUACGAAAAAAAACUA表2CDV-AH株的基因組結(jié)構(gòu)Table2GenomestructureofCDV-AHstrainbpM1234567820001000750500250100圖1CDV-AH株基因組不同片段的RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1AmplificationresultsofthecompletegenomeofCDV-AHstrainbyRT-PCRM:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn);1~8:CDV-AH株1~8段的RT-PCR產(chǎn)物M:DNAMarker;1-8:GenomefragmentsofCDV-AHstrain80005000300020001000750500250100bpM12圖23'RACE和5'RACE擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.2.Amplificationproductsof3'RACEand5'RACEM:DNA分子量標(biāo)準(zhǔn);1:3'RACE擴(kuò)增產(chǎn)物;2:5'RACE擴(kuò)增產(chǎn)物M:DNAMarker;1:Amplificationprodutof3'RACE;2:Amplificationproductof5'RACE
【作者單位】： 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所;西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院;甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院;安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31270194,31502068) 上海市科技興農(nóng)重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目(2016043) 上海市科委創(chuàng)新項(xiàng)目(13391901602) 公益性農(nóng)業(yè)科研專項(xiàng)(201303046) 中央級(jí)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)(2016JB01,31101848)
【分類號(hào)】：S852.655

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本文編號(hào)：2542569