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三個(gè)品種馬MSTN、GH基因多態(tài)性及其與體尺性狀的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2019-04-12 19:08
【摘要】:本試驗(yàn)以焉耆馬、伊犁馬和蒙古馬3個(gè)品種所采集的196個(gè)個(gè)體為材料,采用PCR-SSCP及DNA測(cè)序技術(shù),在DNA水平上對(duì)MSTN及GH基因多態(tài)性進(jìn)行研究,并將基因多態(tài)性與馬體尺性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析。研究結(jié)果如下:對(duì)MSTN基因的多態(tài)性檢測(cè),其中焉耆馬和伊犁馬存在多態(tài)性,產(chǎn)生了AA、AG和GG三種基因型;蒙古馬未檢測(cè)到多態(tài)性。經(jīng)DNA測(cè)序,發(fā)現(xiàn)在第一內(nèi)含子區(qū)域一個(gè)堿基發(fā)生突變:g.2115A→G(GQ183900.1)。通過(guò)Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn),在焉耆馬與伊犁馬中MSTN基因處于Hardy-Weinberg非平衡狀態(tài)。對(duì)GH基因進(jìn)行多態(tài)性檢測(cè),發(fā)現(xiàn)所測(cè)三個(gè)品種均存在多態(tài)性,產(chǎn)生了CC、CD及DD三種基因型。經(jīng)DNA測(cè)序,在第五外顯子區(qū)域檢測(cè)到一個(gè)突變位點(diǎn)g.1464T→C(NC_009154.2)。通過(guò)Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn),發(fā)現(xiàn)焉耆馬與伊犁馬GH基因處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),蒙古馬處于Hardy-Weinberg非平衡狀態(tài)。MSTN基因不同基因型與體尺性狀進(jìn)行相關(guān)性分析表明,在焉耆馬和伊犁馬群體中,不同的基因型對(duì)體尺性狀產(chǎn)生了顯著性的影響。其中焉耆馬群體中,胸圍GG型和AG型顯著長(zhǎng)于A(yíng)A型;伊犁馬群體中體長(zhǎng)GG型顯著長(zhǎng)于A(yíng)A型,胸圍GG型顯著長(zhǎng)于A(yíng)G型,極顯著長(zhǎng)于A(yíng)A型,管?chē)鶤G型極顯著長(zhǎng)于A(yíng)A型。使用一般線(xiàn)性模型GLM對(duì)所測(cè)三個(gè)品種馬匹體尺進(jìn)行方差分析,發(fā)現(xiàn)不同品種差異及不同基因型對(duì)體尺差異均有極顯著意義。蒙古馬GH基因不同基因型與體尺性狀進(jìn)行相關(guān)性分析表明,不同的GH基因型對(duì)體尺性狀產(chǎn)生了顯著性的影響,蒙古馬群體中,體高、體長(zhǎng)和胸圍CC型和CD型顯著性高(長(zhǎng))于DD型,管?chē)鶦C型顯著長(zhǎng)于DD型。MSTN及GH基因?qū)︸R體尺性狀具有顯著性影響,在馬匹育種與改良過(guò)程中具有作為分子標(biāo)記輔助的價(jià)值。
[Abstract]:In this experiment, 196 individuals collected from three breeds of Yanqi horse, Yili horse and Mongolian horse were used to study the polymorphism of MSTN and GH genes at DNA level by PCR-SSCP and DNA sequencing techniques. The association between genetic polymorphism and horse body size traits was analyzed. The results were as follows: the polymorphism of MSTN gene was detected in Yanqi horse and Yili horse, which resulted in three genotypes of AA,AG and GG, while no polymorphism was detected in Mongolian horse. By DNA sequencing, it was found that a base mutation occurred in the first intron region: g.2115A (GQ183900.1). The results of Hardy-Weinberg equilibrium test showed that the MSTN gene in Yanqi horse and Yili horse was in the non-equilibrium state of Hardy-Weinberg. The polymorphism of GH gene was detected in all three cultivars, and three genotypes of CC,CD and DD were produced. By DNA sequencing, a mutation, g.1464T / C (NC_009154.2), was detected in exon 5 region. By Hardy-Weinberg equilibrium test, it was found that the GH gene of Yanqi horse and Yili horse was in the Hardy-Weinberg equilibrium state, and the Mongolian horse was in the non-equilibrium state of Hardy-Weinberg. The correlation analysis between the different genotypes of the MSTN gene and body size traits showed that there was no significant difference between the two genotypes. In Yanqi Horse and Yili Horse population, different genotypes had significant effects on body size traits. In Yanqi horse population, the GG type and AGtype of chest circumference were significantly longer than AA type, the GG type of body length in Yili horse population was significantly longer than AA type, the GG type of chest circumference was significantly longer than that of AA type, the GG type of chest circumference was significantly longer than that of AA type, and the AGtype of tube circumference was significantly longer than that of AA type. A general linear model GLM was used to analyze the variance of body size of horses in three breeds. It was found that there were significant differences in body size between different breeds and different genotypes. The correlation analysis between different genotypes of GH gene and body size traits in Mongolian horses showed that different GH genotypes had a significant effect on body size traits, body height in Mongolian horse population, and body height in Mongolian horse population. The body length and chest circumference CC and CD genotype were significantly higher (longer) than DD type, and the tube circumference CC type was significantly longer than DD type. MSTN and GH genes had significant effects on horse body size traits, and were valuable as molecular markers in horse breeding and improvement.
【學(xué)位授予單位】:新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:S821

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