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陜西部分地區(qū)山羊畢氏腸微孢子蟲多位點基因分型研究

發(fā)布時間:2019-03-09 17:02
【摘要】:為了闡明山羊畢氏腸微孢子蟲的遺傳多樣性,筆者采用基于微衛(wèi)星(MS1、MS3、MS7)和小衛(wèi)星(MS4)位點的多位點序列分型技術(shù)首次對不同用途山羊的122個畢氏腸微孢子蟲分離株進行了多位點序列分型研究。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在MS1、MS4和MS7位點的擴增效率依次為27.9%(34/122)、18.0%(22/122)、50.8%(62/122),而在MS3位點所有樣品均未獲得有效擴增。核苷酸序列分析表明,所有樣品的MS1、MS4和MS7位點分別具有16、9和18個基因型,共形成了14個MLGs。其中,50份絨山羊陽性樣品3個位點擴增效率分別為10.0%(5/50)、14.0%(7/50)和90.0%(45/50),分別具有3、3和10個基因型,共形成了5個MLGs;56份奶山羊陽性樣品3個位點的擴增效率依次為28.6%(16/56)、19.6%(11/56)和8.9%(5/56),分別組成4、4、1個基因型,共組成7個不同的MLGs;16份黑山羊陽性樣品在3個位點的擴增效率依次為81.3%(13/16)、25.0%(4/16)、75.0%(12/16),分別具有9、2、7個基因型,構(gòu)成2個MLGs。
[Abstract]:In order to clarify the genetic diversity of Microsporidium pyrenoides in goats, the authors used microsatellite-based (MS1,MS3,). MS7) and microsatellite (MS4) were used for the first time to study the multi-site genotyping of 122 isolates of Microsporidium Pichia from goats for the first time in this paper. The results were as follows: (1) Multi-site genotyping was carried out for the first time in goats with different uses. The results showed that the amplification efficiency of MS1,MS4 and MS7 loci were 27.9% (34 / 122), 18.0% (22 / 122), 50.8% (62 / 122), respectively, while none of the samples at MS3 site was amplified effectively. Nucleotide sequence analysis showed that there were 16, 9 and 18 genotypes of MS1,MS4 and MS7 loci, respectively, and 14 MLGs. were formed in all samples. Among them, the amplification efficiency of three loci was 10.0% (5 / 50), 14.0% (7 / 50) and 90.0% (45 / 50), respectively, and there were 3, 3 and 10 genotypes in 50 positive samples of cashmere goat. Five MLGs; were formed in total. The amplification efficiency of three loci in 56 dairy goats was 28.6% (16 / 56), 19.6% (11 / 56) and 8.9% (5 / 56), respectively, consisting of 4,4,1 genotype and 7 different MLGs; genotypes. The amplification efficiency of 16 black goat positive samples was 81.3% (13 / 16), 25.0% (4 / 16), 75.0% (12 / 16), respectively, with 9, 2 and 7 genotypes, which constituted 2 MLGs..
【作者單位】: 西北農(nóng)林科技大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院;河南牧翔動物藥業(yè)有限公司;陜西省珍稀野生動物搶救飼養(yǎng)研究中心;
【分類號】:S852.723

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本文編號:2437670

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