【摘要】：豬流行性腹瀉(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的以嘔吐、腹瀉和脫水為主要特征的豬急性接觸性腸道傳染病,對新生仔豬的致死率可達(dá)100%。該病在世界范圍內(nèi)頻發(fā),給養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。本研究以2014年11~12月份在陜西渭南某規(guī)�；B(yǎng)豬場發(fā)生的疑似PEDV感染仔豬為研究對象,經(jīng)臨床癥狀觀察和病理剖檢,初步診斷為豬流行性腹瀉;通過對20份小腸病料進(jìn)行PEDV M基因的RT-PCR檢測,檢測出了9份豬流行性腹瀉病毒核酸,PEDV檢測陽性率為45.0%。參考Gen Bank中CV777經(jīng)典毒株全基因組序列(AF353511.1),設(shè)計了擴(kuò)增PEDV ORF3基因、M基因和S基因部分序列的引物,對相應(yīng)基因進(jìn)行了克隆和序列分析,通過與CV777株對比分析,發(fā)現(xiàn)分離株的M基因具有高度保守性,可以作為檢測PEDV的靶基因;WN毒株與經(jīng)典毒株CV777相比,ORF3基因共存在11處堿基突變,這些堿基突變是否導(dǎo)致病毒毒力的改變還有待研究。S基因變異較大,S蛋白內(nèi)分的核心中和表位(CEO,499-638aa)共有9個氨基酸位點(diǎn)發(fā)生了突變共有9個位點(diǎn)氨基酸發(fā)生了突變這些突變,S基因的突變可能是導(dǎo)致PEDV疫苗免疫效果下降的一個原因。
[Abstract]:Porcine epidemic diarrhea (Porcine epidemic) is an acute contact infectious disease caused by porcine epidemic diarrhea virus (Porcine epidemic diarrhea virus), which is characterized by vomiting, diarrhea and dehydration. The disease occurs frequently all over the world, causing huge economic loss to pig industry. In this study, suspected PEDV infected piglets in Weinan Pig Farm in Weinan, Shaanxi Province, in November and December 2014, were selected as the research objects. After clinical symptom observation and pathological dissection, it was preliminarily diagnosed as epidemic diarrhea in pigs. By RT-PCR detection of PEDV M gene in 20 samples of small intestine disease, 9 porcine epidemic diarrhea virus nucleic acid (PEDV) positive rate was 45.0%. Referring to the whole genome sequence (AF353511.1) of the classical CV777 strain in Gen Bank, primers were designed to amplify the M gene and the S gene sequence of the PEDV ORF3 gene. The corresponding genes were cloned and sequenced. The results were compared with those of the CV777 strain. It was found that the M gene of the isolated strain was highly conserved and could be used as a target gene for the detection of PEDV. Compared with the classical strain CV777, there were 11 base mutations in the ORF3 gene. Whether these base mutations lead to the virulence of the virus remains to be studied. The core neutralizing epitope of the S protein (CEOO 499-638aa) has 9 amino acid loci mutated and 9 amino acid loci mutated. These mutations in the S gene may be one of the reasons for the decrease in the immune response of the PEDV vaccine.
【學(xué)位授予單位】：西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：S858.28

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2159105