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豬高糖高脂飼喂條件下肝臟轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時(shí)間:2018-06-10 07:21

  本文選題:巴馬香豬 + 轉(zhuǎn)錄組 ; 參考:《廣西大學(xué)》2016年碩士論文


【摘要】:隨著社會(huì)的發(fā)展,人們對(duì)豬肉品質(zhì)的要求也在不斷提高,如何提高肉的品質(zhì)已成為現(xiàn)在畜牧業(yè)的研究重點(diǎn)。肌內(nèi)脂肪的含量是評(píng)定肉品質(zhì)的一個(gè)重要指標(biāo),加深對(duì)其的研究是相當(dāng)必要的。脂肪代謝與肌內(nèi)脂肪的沉積之間有著密切的關(guān)系,而肝臟脂肪代謝作為脂肪代謝中重要的一部分,也是影響肌內(nèi)脂肪的沉積的一個(gè)重要因素。所以加深對(duì)肝臟脂肪代謝的研究有助于找到其對(duì)肌內(nèi)脂肪沉積影響的分子機(jī)制。本研究中,首先在實(shí)驗(yàn)組巴馬香豬的日糧中添加10%的糖和15%的脂肪,構(gòu)建出肥胖豬模型。實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組在pH值、肉色、系水力和剪切力等肉質(zhì)性狀上都存在明顯差異。血液生理指標(biāo)中與血脂相關(guān)的指標(biāo)都有明顯的改變,這些指標(biāo)的變化都與脂肪性狀的改變有著密切的關(guān)系。然后將實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組的肝臟樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,得到了613個(gè)在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組肝臟中差異表達(dá)的基因。對(duì)這613個(gè)差異基因進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),有MOGAT2和NKX2-3等與脂肪類(lèi)物質(zhì)吸收相關(guān)的基因,也有SCD和ELOVL家族等與調(diào)控脂肪酸代謝相關(guān)的基因。對(duì)差異基因進(jìn)行GO富集,發(fā)現(xiàn)這些差異基因主要富集于單體代謝過(guò)程、氧化還原過(guò)程、脂質(zhì)代謝過(guò)程等,KEGG將這些差異基因富集于脂肪酸代謝信號(hào)通路、脂肪酸延長(zhǎng)信號(hào)通路、PPAR信號(hào)通路和甘油脂代謝信號(hào)通路等與脂肪代謝相關(guān)的信號(hào)通路中。在轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中還發(fā)現(xiàn)了在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組出現(xiàn)了大量的可變剪切、SNPs和InDel差異,這些現(xiàn)象的發(fā)生,特別是可變剪切的差異可能直接造成了實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組編碼蛋白質(zhì)的不同,進(jìn)而影響著代謝過(guò)程,但是這些現(xiàn)象是否對(duì)實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組的生理性狀造成影響還有待更加深入的研究。本研究旨在利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的方法,推測(cè)出影響肝臟脂肪代謝的分子生物學(xué)機(jī)理,從肝臟脂肪代謝的角度開(kāi)展肉質(zhì)品質(zhì)的相關(guān)研究,為改善豬肉品質(zhì)提供新的途徑。
[Abstract]:With the development of society, people's demand for pork quality is also increasing, how to improve meat quality has become the focus of animal husbandry research. The content of intramuscular fat is an important index to evaluate meat quality. There is a close relationship between fat metabolism and intramuscular fat deposition. As an important part of fat metabolism, hepatic fat metabolism is also an important factor affecting intramuscular fat deposition. Therefore, further study of liver fat metabolism will help to find out the molecular mechanism of its effect on intramuscular fat deposition. In this study, the fat pig model was established by adding 10% sugar and 15% fat into the diet of the experimental group Bama Xiang pig. There were significant differences between the experimental group and the control group in pH value, meat color, water power and shear stress. There were obvious changes in blood physiological indexes related to blood lipids, and the changes of these indexes were closely related to the changes of fat traits. Then 613 differentially expressed genes were obtained from the liver samples of the experimental group and the control group. The 613 differentially expressed genes included MOGAT2, NKX2-3 and SCD and ELOVL family genes related to fatty acid metabolism. It was found that these differentially expressed genes were mainly enriched in monomer metabolism, redox process, lipid metabolism process and so on. KEGG enriched these differentially expressed genes in fatty acid metabolic signaling pathway. Fatty acid prolongation signaling pathway PPAR signaling pathway and glycerol metabolism signaling pathway related to fat metabolism. In transcriptome sequencing, a large number of variable-shear SNPs and InDel differences were found in the experimental and control groups. These phenomena, especially the variable-shear differences, may directly result in the difference of the encoded proteins between the experimental group and the control group. But whether the effects of these phenomena on the physiological characteristics of the experimental and control groups need to be further studied. The aim of this study was to speculate the molecular biological mechanism of liver fat metabolism by transcriptome sequencing, and to carry out the related research on meat quality from the point of view of liver fat metabolism, so as to provide a new way to improve pork quality.
【學(xué)位授予單位】:廣西大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:S828

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本文編號(hào):2002423

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