整合REV LTR的自然重組馬立克氏病毒GX0101的全基因組序列分析
本文選題:REV + LTR ; 參考:《中國獸藥雜志》2017年10期
【摘要】:GX0101是一株整合禽網(wǎng)狀內(nèi)皮組織增生癥病毒(REV)長末端重復(fù)序列(LTR)的重組馬立克氏病病毒(MDV)。基于MDV GX0101的細(xì)菌人工染色體感染性克隆利用高通量測序技術(shù)完成了對其全基因組的序列分析。GX0101全基因組長178101 bp,其基因組的TRL、UL、IRL、IRS、US和TRS區(qū)分別長12758 bp、113572 bp、12741 bp、12700 bp、11695 bp、13134 bp。與Md5不同,GX0101含有一個sorf2基因。同時(shí),GX0101全基因組含有一個REV LTR重組片段,位于其基因組US區(qū)的sorf1中,sorf2基因前267 bp堿基處。通過與已發(fā)表的近10株MDV的比較,發(fā)現(xiàn)GX0101與英國分離株C12/130的兩個不同毒力的感染性克隆p C12/130-10和p C12/130-15同源性最高。GX0101的全基因組序列的比較分析,有助于進(jìn)一步闡明MDV致病性、傳播性相關(guān)的基因,也有助于揭示不同地域間MDV的遺傳變異和演化關(guān)系。
[Abstract]:GX0101 is a recombinant Marek's disease virus that integrates the long terminal repeat sequence of avian reticuloendotheliosis virus (Rev). Bacterial artificial chromosome infection clone based on MDV GX0101 was sequenced by high-throughput sequencing technique. The whole genome length of GX0101 was 178101 BP, and the length of IRS-US and TRS region was 12758 BP, 113572 BP, 12741 BP, 12700 BP, 11695 BP, 13134 BP, respectively. Different from Md5, GX0101 contains a sorf2 gene. At the same time, the whole genome of GX0101 contained a recombinant REV LTR fragment located at the 267bp base of sorf2 gene in the sorf1 of its US region. By comparing with nearly 10 MDV strains published, we found that the comparative analysis of the whole genome sequence of two infectious clones with different virulence, pC12 / 130-10 and pC12 / 130-15, with the highest homology of pC12 / 130-15, between GX0101 and British isolate C12 / 130, was helpful to further elucidate the pathogenicity of MDV. The transmissible genes also help to reveal the genetic variation and evolution of MDV in different regions.
【作者單位】: 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院;山東省農(nóng)科院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金項(xiàng)目(31402235)
【分類號】:S852.65
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 唐麗云;;構(gòu)建豬繁殖與呼吸綜合征病毒感染性克隆的研究進(jìn)展[J];廣東畜牧獸醫(yī)科技;2011年06期
2 徐紹建;李俊;曹帥;時(shí)建立;周順;徐文;張秀美;王金寶;;豬圓環(huán)病毒2型全序列分析及感染性克隆的構(gòu)建[J];中國獸醫(yī)雜志;2009年01期
3 王光祥;鄭海學(xué);尚佑軍;劉艷紅;常艷燕;田宏;吳錦艷;陳江濤;劉湘濤;;豬圓環(huán)病毒2型感染性克隆的構(gòu)建[J];中國獸醫(yī)科學(xué);2009年11期
4 王明亮;刁有祥;紀(jì)巍;孔義波;高繼明;;豬圓環(huán)病毒2型感染性克隆的構(gòu)建[J];中國獸醫(yī)學(xué)報(bào);2011年03期
5 呂健;韋祖樟;高飛;鄭海紅;童光志;袁世山;;豬繁殖與呼吸綜合征病毒強(qiáng)弱毒株嵌合感染性克隆的構(gòu)建及鑒定[J];畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào);2012年10期
6 李祥健;張建武;呂健;余丹丹;姚火春;袁世山;;豬繁殖與呼吸綜合征病毒嵌合感染性克隆的構(gòu)建和應(yīng)用[J];生物工程學(xué)報(bào);2008年09期
7 韓秀娥;全滟平;高旭;相文華;周建華;;馬傳染性貧血病毒N-連接糖基化回復(fù)突變的感染性克隆構(gòu)建[J];微生物學(xué)報(bào);2008年03期
8 朱麗杰;李剛;曲哲會;王君偉;;口蹄疫病毒全長cDNA感染性克隆的研究進(jìn)展[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2008年02期
9 吳海祥,張楚瑜;正鏈RNA病毒基因組感染性克隆研究進(jìn)展[J];武漢大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版);2002年04期
10 ;中國科學(xué)家完成3種病原微生物全基因組序列[J];現(xiàn)代臨床醫(yī)學(xué)生物工程學(xué)雜志;2002年01期
相關(guān)會議論文 前10條
1 周雙海;謝俊嶺;;豬圓環(huán)病毒2型感染性克隆構(gòu)建的比較分析[A];“生泰爾”杯全國養(yǎng)豬技術(shù)征文大賽——中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會養(yǎng)豬學(xué)分會五屆三次理事會暨生豬產(chǎn)業(yè)科技創(chuàng)新發(fā)展論壇論文集[C];2012年
2 劉長明;危艷武;陸月華;張朝霞;袁婧;黃立平;;豬圓環(huán)病毒1型感染性克隆的構(gòu)建與病毒拯救[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會畜牧獸醫(yī)生物技術(shù)學(xué)分會暨中國免疫學(xué)會獸醫(yī)免疫分會第七次研討會論文集[C];2008年
3 李祥健;張建武;呂健;余丹丹;姚火春;袁世山;;豬繁殖與呼吸綜合征病毒嵌合感染性克隆的構(gòu)建和應(yīng)用[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物傳染病學(xué)分會第三屆豬病防控學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2008年
4 李薇;余興龍;羅維;白霞;李潤成;黎滿香;葛猛;王亞;向衛(wèi)軍;李晶;;三種亞群PCV-2感染性克隆的構(gòu)建及體內(nèi)外感染性試驗(yàn)[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會家畜傳染病學(xué)分會第七屆全國會員代表大會暨第十三次學(xué)術(shù)研討會論文集(上冊)[C];2009年
5 朱明;劉薇;陳金頂;;三株特殊豬乙腦病毒全基因組序列研究[A];2012年鄂粵微生物學(xué)學(xué)術(shù)年會——湖北省暨武漢微生物學(xué)會成立六十年慶祝大會論文集[C];2012年
6 孔義波;張興曉;姜世金;趙欽;孫亞妮;;內(nèi)源性禽白血病病毒SD0501株感染性克隆的構(gòu)建及鑒定[A];山東畜牧獸醫(yī)學(xué)會禽病學(xué)專業(yè)委員會第一次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2009年
7 潘夢;楊小蓉;郭鑫;張大丙;楊漢春;;3型鴨甲肝病毒C-GY株全長感染性克隆的構(gòu)建和病毒拯救的鑒定[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會禽病學(xué)分會第十五次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2010年
8 李爽;章麗嬌;孫海港;蘇文良;韓博;蘇敬良;;鴨BYD病毒全長感染性克隆的構(gòu)建與拯救病毒鑒定[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物傳染病學(xué)分會第十二次人獸共患病學(xué)術(shù)研討會暨第六屆第十四次教學(xué)專業(yè)委員會論文集[C];2012年
9 魏雪濤;李銀;劉宇卓;張敬峰;;一株鵝源副粘病毒分離株全基因組序列的克隆與序列分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會家畜傳染病學(xué)分會第七屆全國會員代表大會暨第十三次學(xué)術(shù)研討會論文集(下冊)[C];2009年
10 呂健;袁世山;;豬繁殖與呼吸綜合征病毒JX0612株全長感染性克隆的構(gòu)建[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物傳染病學(xué)分會第十二次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2007年
相關(guān)重要報(bào)紙文章 前10條
1 通訊員 王靜思 記者 劉傳書;朱瀗全基因組序列圖譜繪制完成[N];科技日報(bào);2011年
2 記者 鳴琦 實(shí)習(xí)生 劉露;朱瀗全基因組序列圖譜繪制完成[N];陜西日報(bào);2011年
3 陳瑜;首個甲蟲全基因組序列問世[N];科技日報(bào);2008年
4 記者 仇逸;上海完成甲感病毒全基因組序列測定[N];新華每日電訊;2009年
5 記者 劉歡;鯉魚全基因組序列圖譜新鮮出爐[N];北京日報(bào);2011年
6 記者 胡左;蒙古高原四個特色物種全基因組序列圖譜繪制完成[N];科技日報(bào);2011年
7 通訊員 郝成濤;軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院分離出甲型流感毒株并完成 全基因組序列測定[N];科技日報(bào);2009年
8 通訊員 梁淡麗 記者 劉傳書;我國繪制完成世界首個鵝全基因組序列圖譜[N];科技日報(bào);2011年
9 記者 江宜航;中國成功繪制鯉魚全基因組序列圖譜[N];中國經(jīng)濟(jì)時(shí)報(bào);2011年
10 記者 唐少曼;我國完成世界首個貝類全基因組序列圖譜[N];中國海洋報(bào);2010年
相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條
1 陳浩;坦布蘇病毒ZC株感染性克隆的構(gòu)建和部分3’非編碼區(qū)功能的初步研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
2 郗冀;新型水貂阿留申病毒感染性克隆的構(gòu)建及其生物學(xué)特性鑒定[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年
3 黃柏成;高致病性豬繁殖與呼吸綜合征病毒感染性克隆的構(gòu)建及其在病毒可視化示蹤上的研究和應(yīng)用[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年
4 黃勤鋒;豬繁殖與呼吸綜合征病毒的感染性克隆及其復(fù)制子載體的研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年
5 于敏;豬戊型肝炎病毒全基因組序列分析及感染性克隆的構(gòu)建[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年
6 劉麗娜;基于全基因組序列分析篩選豬鏈球菌2型保護(hù)性抗原及其實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2008年
7 耿合員;人冠狀病毒NL63中國株全基因組的測序與感染性克隆構(gòu)建[D];中國疾病預(yù)防控制中心;2014年
8 張輝;偽狂犬病毒間質(zhì)蛋白UL14功能研究及TK~-/gG~-株感染性克隆構(gòu)建[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年
9 劉少寧;PRRSV不同毒株感染MARC-145細(xì)胞的蛋白質(zhì)組學(xué)分析及ZCYZ株感染性克隆的拯救[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年
10 黃海龍;福建省HIV-1CRF01_AE流行株的表型分析、基因序列特征、膜蛋白表達(dá)及感染性克隆構(gòu)建的研究[D];福建醫(yī)科大學(xué);2007年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條
1 李丹丹;犬瘟熱病毒SH株的分離鑒定及其感染性克隆的構(gòu)建[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年
2 趙款;PRRSV HuN4株和CH-1a株感染性克隆及其嵌合病毒的構(gòu)建及其初步應(yīng)用[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2016年
3 王偉丞;攜帶遺傳標(biāo)記的豬圓環(huán)病毒2型貴州分離株感染性克隆的構(gòu)建[D];貴州大學(xué);2015年
4 龔茜;PCV2 Cap蛋白Loop DE區(qū)域氨基酸的功能研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年
5 王占鋒;豬圓環(huán)病毒2型湖南分離株全基因擴(kuò)增及感染性克隆構(gòu)建[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年
6 陳海云;雞傳貧病毒安徽分離株感染性克隆的構(gòu)建及其凋亡素抗體的制備[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
7 吳星星;豬圓環(huán)病毒2型新疆株的分離鑒定及感染性克隆的構(gòu)建[D];新疆農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年
8 李祥健;豬繁殖與呼吸綜合征病毒嵌合感染性克隆的構(gòu)建和應(yīng)用[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年
9 李長龍;豬嵴病毒全長cDNA感染性克隆的構(gòu)建及拯救[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2014年
10 徐曉蒙;基于Ion Torrent平臺測序數(shù)據(jù)的微生物全基因組序列組裝及分析方法[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2015年
,本文編號:1793324
本文鏈接:http://www.sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/1793324.html