本文選題：秦巴山區(qū)黃牛 + 微衛(wèi)星DNA　； 參考：《農業(yè)生物技術學報》2016年02期

【摘要】：為分析秦巴山區(qū)西鎮(zhèn)牛、赤崖牛、隕巴牛和宣漢牛4個黃牛(Bos taurus)品種的遺傳多樣性,本研究以蜀宣花牛和郟縣紅牛作對照,利用12對微衛(wèi)星引物對6個黃牛品種的289頭黃牛個體進行了遺傳多樣性檢測,統(tǒng)計了各品種的等位基因及頻率、有效等位基因數、遺傳雜合度、多態(tài)信息含量及各群體間遺傳距離,并對其進行聚類分析。結果表明,6個黃牛品種在12個微衛(wèi)星位點共發(fā)現(xiàn)110個等位基因,等位基因頻率為0.001 6~0.517 3,總群體各位點平均有效等位基因數為2.787 7~7.132 6;各位點多態(tài)信息含量為0.519 2~0.895 3;平均雜合度為0.667 2~0.724 1。群體間發(fā)現(xiàn)特有等位基因11個,基因頻率為0.008 1~0.381 6;優(yōu)勢等位基因(P0.4)19個,基因頻率為0.403 2~0.820 0;共有等位基因41個,占全部等位基因的37.27%,僅有13個共有等位基因為優(yōu)勢等位基因(P0.4),占37.71%。群體間Nei's遺傳一致度為0.596 5~0.840 8,標準遺傳距離(Ds)為0.173 5~0.524 7。聚類分析結果顯示,6個黃牛品種聚為3類,隕巴牛與宣漢牛首先聚在一起,然后同西鎮(zhèn)牛聚在一類;赤崖牛與郟縣紅牛聚為一類;蜀宣花牛自成一類。研究結果表明,12對微衛(wèi)星標記可用于秦巴山區(qū)黃牛遺傳多樣性的分析,秦巴山區(qū)各黃牛品種遺傳多樣性豐富,選育程度不同,4個黃牛品種雖然地理分布格局相近,自然環(huán)境相似,但親緣關系并非相近,應為來源不同的品種。因此,西鎮(zhèn)牛、赤崖牛、隕巴牛和宣漢牛不宜合并為1個品種。本研究所揭示的秦巴山區(qū)黃牛品種的遺傳分化特點及親緣關系,為研究品種的遺傳共適應特點,預測雜交優(yōu)勢,制定育種戰(zhàn)略等提供了科學依據。
[Abstract]:For the analysis of Qinba Mountain West Town Red Cliff cattle, cattle, cattle and Xuanhan cattle Pakistan from 4 cattle (Bos taurus) a variety of breeds, in this study, Shu Xuan cattle and Jiaxian Red Bull as control, the genetic diversity detection by using 12 pairs of microsatellite primers of 6 cattle breeds 289 the head of cattle, the varieties and the allele frequencies, effective number of alleles, heterozygosity, polymorphism information content and genetic distance among the populations, and carries on the cluster analysis. The results showed that 6 cattle breeds were found 110 alleles in 12 microsatellite loci, etc. the allele frequency of 0.001 6~0.517 3, the total population the average effective number of alleles was 2.787 7~7.132 6; the polymorphism information content was 0.519 2~0.895 3; the average heterozygosity was 0.667 2~0.724 between the 1. groups found specific allele 11, gene frequency was 0.008 1~0.381 6; advantage Allele (P0.4) 19, gene frequency was 0.403 2~0.820 0; a total of 41 alleles, allele accounted for 37.27%, only a total of 13 alleles was the dominant allele (P0.4), 37.71%. group Nei's genetic identity was 0.596 5~0.840 8 standard. Transmission distance (Ds) results showed that 0.173 5~0.524 7. cluster analysis, 6 cattle breeds were clustered into 3 groups, the Pakistan Xuanhan cattle and clustered together firstly, and then with the town of West cattle gathered in a class; the red cliff Jiaxian cattle and Red Bull clustered; Shu Xuan is a type of cattle. The results showed that 12 pairs of microsatellite markers can be used to analyze the diversity of Qinba mountain cattle genetic, Qinba mountain cattle breeds the abundant genetic diversity and breeding in different degrees, 4 cattle breeds although geographical distribution patterns are similar, similar to the natural environment, but the relationship is not close to the source should be so different varieties. West Town, cattle, Red Cliff cattle, meteorite cattle and Xuanhan cattle should not be combined into 1 varieties. The genetic differentiation characteristics and genetic relationships of yellow cattle breeds revealed in this study provide scientific basis for the study of genetic co adaptability, prediction of crossbreeding strength and establishment of breeding strategy.

【作者單位】： 西北農林科技大學動物科技學院;漢中職業(yè)技術學院農林系;國家肉牛改良中心;鎮(zhèn)巴縣畜牧獸醫(yī)工作站;
【基金】：國家高技術研究發(fā)展計劃(863計劃)(No.2013AA102505和No.2011AA100307-02) 國家現(xiàn)代農業(yè)產業(yè)技術體系(No.CARS-38) 陜西省科技統(tǒng)籌創(chuàng)新工程計劃(No.2014KTZB02-02) 陜西省科學技術研究發(fā)展計劃項目(No.2012NY2-17)
【分類號】：S823.81

【參考文獻】

相關期刊論文 前5條

1 張自富;昝林森;王志剛;張桂香;廖信軍;賈善剛;韓旭;于福清;張劍;;14個中外黃牛品種的遺傳多樣性分析[J];西北農林科技大學學報(自然科學版);2007年02期

2 常洪，耿社民，，武彬，陳幼春;秦嶺兩側黃牛群體遺傳檢測報告[J];畜牧獸醫(yī)學報;1994年02期

3 張繼全,邵春榮,王毓英,陳幼春;Nei氏標準遺傳距離的估測精度[J];畜牧獸醫(yī)學報;1998年01期

4 張潤鋒;林亞秋;李曉峰;鄭靜;汪曉菲;;3個黃牛品種Y-STR多態(tài)性[J];西北農業(yè)學報;2012年11期

5 耿社民;武斌;;西鎮(zhèn)牛與其它黃牛品種間親緣關系剖析[J];畜牧獸醫(yī)雜志;1991年02期

【共引文獻】

相關期刊論文 前10條

1 李齊發(fā),謝莊;中國地方品種牛血液同工酶遺傳多樣性研究進展[J];黃牛雜志;2001年04期

2 張愛玲,馬月輝,耿社民;分子水平下檢測家畜遺傳多樣性的抽樣問題[J];黃牛雜志;2003年04期

3 劉慶華;甘乾福;梁學武;;閩南黃牛的微衛(wèi)星多態(tài)性研究[J];中國牛業(yè)科學;2006年06期

4 王淑新;連林生;;畜禽雜種優(yōu)勢預測方法的研究進展[J];當代畜牧;2008年01期

5 劉慶華;甘乾福;梁學武;;福建黃牛的遺傳多態(tài)性及分類[J];福建農林大學學報(自然科學版);2007年06期

6 朱波峰,李靖;應用STR基因座基因型頻率對阿昌族及其他種族和民族的遺傳距離進行比較[J];中國人民公安大學學報(自然科學版);2004年01期

7 蔡大偉;孫洋;;中國家養(yǎng)動物起源的古DNA研究進展[J];邊疆考古研究;2012年02期

8 常洪,苗澤榮,耿社民,武彬;中亞以東南家牛親緣系統(tǒng)研究[J];江蘇農業(yè)研究;1999年01期

9 魯翠云;金萬昆;孫效文;李大宇;朱曉東;馬海濤;于東梅;楊建新;;樣本容量對養(yǎng)殖群體內主要遺傳結構分析參數的影響[J];水產學報;2008年05期

10 孫紅梅;邢秀梅;榮敏;叢波;;家兔遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)生關系的微衛(wèi)星分析[J];生物多樣性;2008年05期

相關博士學位論文 前9條

1 孫維斌;秦川牛肉用性狀及八個黃牛品種遺傳關系的DNA分子標記研究[D];西北農林科技大學;2003年

2 毛鳳顯;貴州和鄰近地區(qū)山羊品種微衛(wèi)星遺傳多樣性及微衛(wèi)星與考力代羊體重等性狀的遺傳連鎖研究[D];甘肅農業(yè)大學;2004年

3 邢秀梅;中國茸鹿分子遺傳多樣性研究[D];中國農業(yè)科學院;2006年

4 包文斌;中國家雞和紅色原雞遺傳多樣性及親緣關系分析[D];揚州大學;2007年

5 王雷;水貂微衛(wèi)星多態(tài)性與經濟性狀相關的研究[D];中國農業(yè)科學院;2007年

6 李慧芳;中國地方家鴨品種的分子遺傳多樣性研究[D];揚州大學;2008年

7 冀德君;中國牛亞科家畜4個結構基因的遺傳分化研究[D];揚州大學;2008年

8 白玉妍;應用微衛(wèi)星DNA標記進行藍狐（Alopex lagopus）親權鑒定和分子遺傳多樣性研究[D];東北林業(yè)大學;2009年

9 韋力;日本伏翼（Pipistrellus abramus）微衛(wèi)星位點的篩選及其種群遺傳結構特征[D];華東師范大學;2010年

相關碩士學位論文 前10條

1 楊清芳;五個山羊品種遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[D];河北農業(yè)大學;2011年

2 劉秀霞;吐魯番斗雞攻擊行為的觀察及雞的攻擊行為相關基因的SNP分析[D];石河子大學;2009年

3 張娜娜;11個微衛(wèi)星和BMP15外顯子在兩個山羊品種中遺傳多樣性研究[D];河南科技大學;2010年

4 陳東海;華東地區(qū)虎紋蛙三個地理種群的遺傳多樣性與遺傳結構研究[D];浙江師范大學;2011年

5 劉博;夏南牛和皮南牛微衛(wèi)星標記研究及生長發(fā)育模型的建立[D];河南農業(yè)大學;2011年

6 王昕;中國部分地方豬種微衛(wèi)星DNA指紋的群體遺傳學研究[D];西北農林科技大學;2001年

7 邱榮斌;朱瀗親緣關系鑒定的RAPD及蛋白質多態(tài)性研究[D];西北農林科技大學;2002年

8 趙艷紅;利用微衛(wèi)星標記分析部分山羊品種的遺傳多樣性[D];內蒙古農業(yè)大學;2003年

9 張增利;中國主要地方綿羊品種遺傳多樣性研究[D];河北農業(yè)大學;2003年

10 呂慎金;我國七個綿羊群體微衛(wèi)星DNA的遺傳多樣性研究[D];西北農林科技大學;2003年

【二級參考文獻】

相關期刊論文 前4條

1 常洪;耿社民;武彬;李寫一;陳幼春;;中國黃牛品種遺傳檢測抽樣方法的研究[J];黃牛雜志;1989年03期

2 吳偉,王棟,曹紅鶴;微衛(wèi)星DNA標記對5個中外黃牛品種/群體遺傳結構的研究[J];吉林農業(yè)大學學報;2000年04期

3 單雪松,張沅;奶牛weaver基因連鎖微衛(wèi)星位點多態(tài)性分析[J];吉林農業(yè)大學學報;2003年02期

4 常洪,耿社民,武彬,李寫一,陳幼春;中國黃牛品種基因頻率抽樣估計效率的研究[J];西北農林科技大學學報(自然科學版);1989年03期

相關博士學位論文 前2條

1 蔡欣;中國黃牛母系和父系起源的分子特征與系統(tǒng)進化研究[D];西北農林科技大學;2006年

2 辛亞平;中國部分黃牛群體Y染色體微衛(wèi)星多態(tài)性與分子進化及生產性能關系初步研究[D];西北農林科技大學;2007年

相關碩士學位論文 前1條

1 張志清;中國四個黃牛品種的父系和母系起源研究[D];西北農林科技大學;2005年

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 尚占環(huán),姚愛興;生物遺傳多樣性研究方法及其保護措施[J];寧夏農學院學報;2002年01期

2 蔣楠;作物遺傳多樣性的保護和持續(xù)利用[J];四川教育學院學報;2003年09期

3 張靜;;作物遺傳多樣性的保護和持續(xù)利用[J];神州;2013年17期

4 ;《遺傳多樣性研究的原理與方法》評介[J];動物學研究;2000年02期

5 解新明,云錦鳳;植物遺傳多樣性及其檢測方法[J];中國草地;2000年06期

6 胡守榮,夏銘,郭長英,陸曉春;林木遺傳多樣性研究方法概況[J];東北林業(yè)大學學報;2001年03期

7 陳寬維;“我國家禽遺傳多樣性研究”前景誘人[J];中國家禽;2003年02期

8 朱秀志;彭正松;;四川珍稀林木資源及其遺傳多樣性研究狀況[J];西部林業(yè)科學;2006年04期

9 高秀琴;蘭進好;穆平;林琪;;小麥遺傳多樣性研究進展[J];山東農業(yè)科學;2007年03期

10 黃耀江;許宙;周文化;劉越;馮金朝;;雞的遺傳多樣性的研究方法及研究進展[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學進展;2007年05期

相關會議論文 前10條

1 胡志昂;;對我國遺傳多樣性研究的幾點意見[A];生物多樣性研究進展——首屆全國生物多樣性保護與持續(xù)利用研討會論文集[C];1994年

2 何文珊;陸鍵鍵;;分子生物學技術在遺傳多樣性研究中的應用[A];生物多樣性與人類未來——第二屆全國生物多樣性保護與持續(xù)利用研討會論文集[C];1996年

3 劉娟;李貝寧;劉春生;周應群;;栽培對道地甘草遺傳多樣性的影響研究[A];中華中醫(yī)藥學會第十屆中藥鑒定學術會議暨WHO中藥材鑒定方法和技術研討會論文集[C];2010年

4 沈裕琥;王海慶;黃相國;葛菊梅;張懷剛;;作物品種間遺傳多樣性的研究進展[A];21世紀作物科技與生產發(fā)展學術討論會論文集[C];2002年

5 沈裕琥;王海慶;黃相國;葛菊梅;張懷剛;;作物品種間遺傳多樣性的研究進展[A];中國科學院西北高原生物研究會論文集[C];2002年

6 沙偉;林琳;鄭云梅;;小仙鶴蘚遺傳多樣性分析[A];中國植物學會七十五周年年會論文摘要匯編（1933-2008）[C];2008年

7 ;“全國生物遺傳多樣性高峰論壇”日程安排[A];全國生物遺傳多樣性高峰論壇會刊[C];2012年

8 芒來;楊虹;;蒙古馬遺傳多樣性研究進展[A];遺傳學進步與人口健康高峰論壇論文集[C];2007年

9 毛培勝;王新國;黃鶯;;分子標記技術在牧草遺傳多樣性研究中的應用[A];2009中國草原發(fā)展論壇論文集[C];2009年

10 周秋白;鄭宇;周莉;桂建芳;;鄱陽湖鯽魚遺傳多樣性分析[A];中國魚類學會2008學術研討會論文摘要匯編[C];2008年

相關重要報紙文章 前10條

1 胡云章;絢麗的民族文化 豐富的遺傳多樣性[N];大眾科技報;2008年

2 劉霞;人類語言源于非洲再添新證據[N];科技日報;2011年

3 卞晨光;保護家畜遺傳多樣性刻不容緩[N];中國畜牧獸醫(yī)報;2012年

4 本報記者 游雪晴;中國的人類遺傳多樣性研究成果豐碩[N];科技日報;2001年

5 記者 胡德榮;亞洲人群遺傳多樣性研究獲最新成果[N];健康報;2009年

6 張桂香;中國地方水牛的遺傳多樣性[N];農民日報;2004年

7 李倩;不同民族永生細胞庫建設取得進展[N];大眾科技報;2007年

8 李倩;我國永生細胞庫初具規(guī)模[N];人民日報;2007年

9 記者 耀輝;云南5成果喜獲國家科技獎[N];云南經濟日報;2006年

10 肖力偉 譯;中國栽培的大豆品種 遺傳多樣性變異豐富[N];農民日報;2011年

相關博士學位論文 前10條

1 周蕓蕓;神農架川金絲猴的遺傳多樣性及保護研究[D];中央民族大學;2015年

2 彭亮;丹參種質資源及其遺傳多樣性研究[D];西北農林科技大學;2015年

3 劉海龍;大葉櫸遺傳多樣性與離體保存研究[D];中南林業(yè)科技大學;2015年

4 狄曉艷;油松遺傳多樣性與光合生理生態(tài)特性研究[D];山西大學;2014年

5 陳雪平;茄子遺傳多樣性研究與遺傳連鎖圖譜構建[D];河北農業(yè)大學;2015年

6 郭文韜;大鯢遺傳多樣性及皮膚附屬物特性研究[D];華中科技大學;2013年

7 宋叢文;珙桐天然群體的遺傳多樣性分析及其保存樣本策略研究[D];華中農業(yè)大學;2005年

8 肖海峻;鵝觀草種質資源遺傳多樣性研究[D];中國農業(yè)科學院;2007年

9 羅世家;珙桐遺傳多樣性與保護生物學研究[D];華中農業(yè)大學;2012年

10 徐建榮;福壽螺繁殖生態(tài)與遺傳多樣性研究[D];中國海洋大學;2009年

相關碩士學位論文 前10條

1 王琳;基于ISSR的連翹遺傳多樣性研究[D];山西農業(yè)大學;2015年

2 陳偉帥;小麥抗病遺傳多樣性對條銹病的調控效應[D];中國農業(yè)科學院;2015年

3 王若丁;西藏工布烏頭天然群體的遺傳多樣性分析[D];東北林業(yè)大學;2015年

4 鄧宏中;基于SSR標記的中國水稻地方品種與選育品種遺傳多樣性研究[D];中國農業(yè)科學院;2015年

5 劉麗;西藏墨脫地區(qū)野生草莓的遺傳多樣性分析[D];東北林業(yè)大學;2015年

6 張佳佳;沈陽森林動物園丹頂鶴(Grus japonensis)遺傳多樣性分析和親緣關系研究[D];東北林業(yè)大學;2015年

7 梅芳芳;三種水生被子植物在中國六大湖泊的遺傳多樣性[D];華中師范大學;2015年

8 劉鵬;野豌豆屬牧草的遺傳多樣性研究[D];蘭州大學;2015年

9 胡益波;枳遺傳多樣性及其與紅橘雜交后代遺傳研究[D];華中農業(yè)大學;2015年

10 馬旭丹;水稻部分骨干親本的指紋圖譜構建和遺傳多樣性分析[D];華中農業(yè)大學;2015年

本文編號：1761704