版納微型豬近交系細(xì)胞色素P450家族基因CYP1A1克隆及生物信息學(xué)分析
本文選題:細(xì)胞色素P家族 切入點(diǎn):CYPA基因 出處:《云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué))》2017年03期
【摘要】:【目的】克隆版納微型豬近交系(Banna mini-pig inbred line,BMI)細(xì)胞色素P450家族基因CYP1A1的編碼區(qū)序列,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析!痉椒ā坷肦T-PCR方法獲得CYP1A1基因的全長(zhǎng)CDS序列,運(yùn)用生物信息學(xué)對(duì)其核酸及蛋白序列進(jìn)行分析,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹!窘Y(jié)果】獲得的BMI CYP1A1 CDS長(zhǎng)度為1551 bp,編碼516個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)分子量為58.39 ku,等電點(diǎn)為7.83,位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的概率是94.1%。CYP1A1蛋白質(zhì)含有1個(gè)細(xì)胞色素P450半胱氨酸血紅素配體位點(diǎn),1個(gè)N-豆蔻;稽c(diǎn),1個(gè)酰胺化作用位點(diǎn),2個(gè)N-糖基化位點(diǎn)、6個(gè)蛋白酶C磷酸化位點(diǎn)和5個(gè)蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點(diǎn)。11個(gè)物種構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,BMI(豬)CYP1A1與牛和山羊的關(guān)系最近。【結(jié)論】以上結(jié)果將為進(jìn)一步研究版納微型豬近交系CYP1A1基因功能奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:[objective] to clone the coding region of cytochrome P450 family CYP1A1 of Banna mini-pig inbred lineage, Banna micropig inbred line, and analyze it by bioinformatics. [methods] the full-length CDS sequence of CYP1A1 gene was obtained by RT-PCR method. The nucleic acid and protein sequences were analyzed by bioinformatics, and the phylogenetic tree was constructed. The length of BMI CYP1A1 CDS was 1551 BP, encoding 516 amino acids. The molecular weight of the protein is 58.39 kuand the isoelectric point is 7.83. The probability of the protein being located in the endoplasmic reticulum is that the 94.1%.CYP1A1 protein contains one cytochrome P450 cysteine heme ligand site, one N-nutmeg acylation site, one amidation site, two N-glycosyl sites. The phylogenetic analysis of 11 species constructed indicates that the relationship between BMI-CYP1A1 and cattle and goat is the most recent. [conclusion] the above results will be further studied. The function of CYP1A1 gene of Banna miniature pig inbred line was established.
【作者單位】: 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)云南省版納微型豬近交系重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31660637,31460580,31660650)
【分類號(hào)】:S828.2
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本文編號(hào):1669298
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