豬ANK1新的可變剪接體功能預(yù)測、組織表達譜分析與真核表達載體構(gòu)建
本文選題:豬 切入點:ANK基因 出處:《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年07期
【摘要】:為進一步了解豬ANK1基因,本研究以廣西巴馬豬作為實驗對象,分析ANK1基因結(jié)構(gòu)與功能,并利用實時熒光定量PCR方法,分析ANK1基因在廣西巴馬小型豬11個不同組織(心臟,肝臟,脾臟,肺臟,腎臟,大腸,小腸,胰腺,皮下脂,胃,背最長肌)中的表達水平。組織表達譜分析結(jié)果表明ANK1基因在11個組織中均有表達,mRNA表達量表現(xiàn)為:胰腺心臟背最長肌胃大腸肝臟腎臟小腸脾臟肺臟脂肪。ANK1基因編碼的蛋白通過生物信息學(xué)分析表明,編碼156個氨基酸,存在跨膜結(jié)構(gòu)和跨膜信號肽,分子量為17 799.27,理論等電點6.31,α螺旋和無規(guī)則卷曲所占比例比較大。通過酶切技術(shù)成功獲得p EGFP-ANK1重組質(zhì)粒并轉(zhuǎn)染到C2C12細胞中,于48 h拍照發(fā)現(xiàn)細胞發(fā)出熒光,說明ANK1基因真核表達載體構(gòu)建成功。
[Abstract]:In order to further understand pig ANK1 gene, this study analyzed the structure and function of ANK1 gene in Guangxi Bama pig, and analyzed ANK1 gene in 11 tissues (heart, liver) of Guangxi Bama mini-pig by real-time fluorescence quantitative PCR. Spleen, lung, kidney, large intestine, small intestine, pancreas, subcutaneous fat, stomach, The expression of ANK1 gene in 11 tissues was as follows: pancreas, heart, longissimus, large intestine, liver, kidney, small intestine, spleen, lung, fat. ANK1 gene. A bioinformatics analysis of the encoded protein shows that, Encoding 156 amino acids with transmembrane structure and transmembrane signal peptide, the molecular weight is 17 799.27, the theoretical isoelectric point is 6.31, the proportion of 偽 helix and irregular curl is relatively large. The recombinant plasmid of p EGFP-ANK1 was successfully obtained by enzyme digestion and transfected into C2C12 cells. The fluorescence of the cells was observed at 48 h, indicating that the eukaryotic expression vector of ANK1 gene was successfully constructed.
【作者單位】: 廣西大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)體系廣西生豬創(chuàng)新團隊項目(nycytxgxcxtd-03-15)資助
【分類號】:Q78;S828
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