本文選題：斯氏副柔線蟲(chóng)　切入點(diǎn)：轉(zhuǎn)錄組　出處：《中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年04期 　論文類(lèi)型：期刊論文

【摘要】：為了系統(tǒng)了解斯氏副柔線蟲(chóng)的轉(zhuǎn)錄組特征并構(gòu)建其轉(zhuǎn)錄組圖譜,以不同發(fā)育階段的斯氏副柔線蟲(chóng)為研究對(duì)象,應(yīng)用Illumina Nextseq 500高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái)對(duì)其進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生物信息學(xué)分析,結(jié)果每個(gè)樣本均得到3GB的原始數(shù)據(jù),經(jīng)質(zhì)量控制和拼接組裝后,共獲得128 454個(gè)Unigene,序列片段的平均長(zhǎng)度與N50值分別為634和1 037bp;將Unigenes與COG,Nr,Trembl等數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明有35 324個(gè)Unigene比對(duì)到COG數(shù)據(jù)庫(kù),根據(jù)蛋白種類(lèi)大致分為25類(lèi);通過(guò)GO功能分類(lèi),5 227個(gè)Unigene映射到GO不同的功能節(jié)點(diǎn)上;通過(guò)KEGG pathways分析,共有13 424個(gè)Unigene參與了8 155個(gè)代謝通路。該研究結(jié)果為斯氏副柔線蟲(chóng)病的基礎(chǔ)理論、診斷方法及防治研究奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to systematically understand the transcriptional characteristics of nematode skrjabini and construct its transcriptional map, we studied the nematodes in different developmental stages. The transcriptome sequencing and bioinformatics analysis were performed on Illumina Nextseq 500 high-throughput sequencing platform. The results showed that 3GB of raw data were obtained from each sample. A total of 128,454 Unigenees were obtained, the average length and N _ (50) of the sequences were 634 and 1 037 BP, respectively. The results showed that 35 324 Unigene were compared to the COG database, which were divided into 25 classes according to the protein types. According to go functional classification, 5227 Unigene were mapped to different functional nodes of go, 13 424 Unigene were involved in 8 155 metabolic pathways by KEGG pathways analysis. The diagnosis method and the prevention and cure research lay the foundation.
【作者單位】： 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31260603)
【分類(lèi)號(hào)】：S852.731

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前7條

1 趙治國(guó);楊曉野;楊蓮茹;顧巍;吉亞圖;王瑞;李文生;趙曉慧;;駱駝斯氏副柔線蟲(chóng)病傳播媒介的篩選與確定[J];中國(guó)獸醫(yī)科學(xué);2010年01期

2 趙治國(guó);楊曉野;汪明;左海濤;娜仁花;段潤(rùn)枝;顧巍;;駱駝斯氏副柔線蟲(chóng)病研究進(jìn)展[J];中國(guó)獸醫(yī)雜志;2009年12期

3 趙治國(guó);楊曉野;楊蓮茹;王瑞;王海艷;趙林立;敖威華;郭鐵箏;;內(nèi)蒙古雙峰駝斯氏副柔線蟲(chóng)病的流行病學(xué)調(diào)查[J];中國(guó)獸醫(yī)科學(xué);2012年12期

4 趙治國(guó);王海艷;郭鐵箏;楊蓮茹;王瑞;趙林立;敖威華;劉虹;楊曉野;;阿拉善雙峰駝斯氏副柔線蟲(chóng)感染情況及病理組織學(xué)變化[J];動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2012年11期

5 張曉東;楊曉野;楊蓮茹;李林川;左海濤;娜仁花;趙治國(guó);王俊杰;;斯氏副柔線蟲(chóng)rDNA-ITS片段的克隆及序列分析[J];畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào);2009年05期

6 李文生;楊蓮茹;楊曉野;趙治國(guó);趙曉慧;李鑫;王瑞;;斯氏副柔線蟲(chóng)線粒體CO1基因的克隆與序列分析[J];畜牧與獸醫(yī);2011年05期

7 ;[J];;年期

相關(guān)會(huì)議論文 前5條

1 楊曉野;趙治國(guó);李林川;楊蓮茹;顧巍;王瑞;;常規(guī)生物學(xué)檢查法對(duì)斯氏副柔線蟲(chóng)傳播媒介的篩選[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜寄生蟲(chóng)學(xué)分會(huì)第六次代表大會(huì)暨第十次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2009年

2 楊蓮茹;楊曉野;劉珍蓮;張連生;;內(nèi)蒙古地區(qū)駱駝斯氏副柔線蟲(chóng)(Parabronema skrjabini)病調(diào)查[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜寄生蟲(chóng)學(xué)分會(huì)第五次代表大會(huì)暨第八次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2004年

3 楊曉野;趙治國(guó);汪明;楊蓮茹;左海濤;娜仁花;顧巍;王瑞;;駱駝斯氏副柔線蟲(chóng)病研究進(jìn)展[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜寄生蟲(chóng)學(xué)分會(huì)第六次代表大會(huì)暨第十次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2009年

4 楊曉野;趙治國(guó);李文生;楊蓮茹;張曉東;王瑞;;駱駝斯氏副柔線蟲(chóng)感染生前糞便診斷方法研究[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜寄生蟲(chóng)學(xué)分會(huì)第六次代表大會(huì)暨第十次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2009年

5 楊曉野;楊連茹;李文生;劉群;趙治國(guó);王瑞;;斯氏副柔線蟲(chóng)線粒體COI基因克隆與序列分析[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜寄生蟲(chóng)學(xué)分會(huì)第六次代表大會(huì)暨第十一次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2011年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前1條

1 趙治國(guó);我國(guó)駱駝斯氏副柔線蟲(chóng)病傳播媒介的研究[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前4條

1 史紅蕾;駱駝斯氏副柔線蟲(chóng)在傳播媒介角蠅體內(nèi)發(fā)育過(guò)程的研究[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 楊波;角蠅生活習(xí)性及其斯氏副柔線蟲(chóng)感染情況的調(diào)查研究[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

3 李文生;角蠅體內(nèi)斯氏副柔線蟲(chóng)的觀察及COI基因特異性序列分析[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

4 鄭文青;駱駝斯氏副柔線蟲(chóng)病流行病學(xué)調(diào)查及生前PCR診斷方法建立[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

，

本文編號(hào)：1610398