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雞長鏈非編碼RNA發(fā)掘及組織特異性表達分析

發(fā)布時間:2018-03-03 14:47

  本文選題: 切入點:RNA-seq 出處:《東北農(nóng)業(yè)大學學報》2016年07期  論文類型:期刊論文


【摘要】:長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,lnc RNA)是一類長度大于200個核苷酸、缺少蛋白編碼功能的RNA。lnc RNA可從多層面調(diào)控基因表達,影響表型性狀。雞作為重要經(jīng)濟動物和模式生物,lnc RNA研究相對滯后。為加快雞lnc RNA研究進展,利用公共數(shù)據(jù)庫(如NCBI-SRA等)中雞高通量轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)數(shù)據(jù),通過生物信息學方法發(fā)掘8 040條雞lnc RNA,發(fā)現(xiàn)大量組織特異性表達lnc RNA,為雞lnc RNA功能研究奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:Long chain noncoding RNA(Long non-coding RNAs are a class of RNA.lnc RNA, which is more than 200 nucleotides in length and lacks the function of protein coding to regulate gene expression from multiple levels. Chicken, as an important economic animal and model organism, lagged behind in the study of phenotypic traits. In order to accelerate the progress of chicken lnc RNA research, high throughput transcriptome sequencing RNA-seq data from public databases (such as NCBI-SRA, etc.) were used. 8 040 chicken lnc RNAs were discovered by bioinformatics, and a large number of tissue-specific lnc RNAs were found, which laid a foundation for the study of chicken lnc RNA function.
【作者單位】: 農(nóng)業(yè)部雞遺傳育種重點實驗室黑龍江省普通高等學校動物遺傳育種與繁殖重點實驗室東北農(nóng)業(yè)大學動物科學技術(shù)學院;
【基金】:國家863計劃項目(2013AA102501) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項資金資助項目(CARS-42) 國家自然科學基金(31472088)
【分類號】:S831

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