本文關(guān)鍵詞：I.人類21號(hào)染色體已知基因序列多態(tài)研究及與靈長(zhǎng)類動(dòng)物基因序列比較 II.應(yīng)用SNP尋找復(fù)雜疾病致病基因，環(huán)境因子敏感基因及HBV病毒株的研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《中國(guó)科學(xué)院研究生院（上海生命科學(xué)研究院）》 2002年

I.人類21號(hào)染色體已知基因序列多態(tài)研究及與靈長(zhǎng)類動(dòng)物基因序列比較 II.應(yīng)用SNP尋找復(fù)雜疾病致病基因，環(huán)境因子敏感基因及HBV病毒株的研究

施錦繡  

【摘要】： 單核苷酸堿基多態(tài)（single nucleotide polymorphism，SNP）是基因組序列中最為常見(jiàn)的遺傳多態(tài)。在本論文中我們擬建立人類21號(hào)染色體中國(guó)人SNP數(shù)據(jù)目錄和單倍型圖譜，尋找人類與黑猩猩等靈長(zhǎng)類動(dòng)物的序列差異，并將SNP應(yīng)用于復(fù)雜疾�。ㄔl(fā)性高血壓）致病基因的尋找，環(huán)境因子敏感基因（相同苯環(huán)境下更易引發(fā)苯中毒）的尋找和乙型肝炎（hepatitis B virus，HBV）病毒株的研究。 我們?cè)?1個(gè)漢族及一些少數(shù)民族個(gè)體，4個(gè)DNA樣品池（南方漢族，北方漢族，高加索人和非洲黑人），以及靈長(zhǎng)類動(dòng)物（黑猩猩，大猩猩，長(zhǎng)臂猿和獼猴）的DNA樣本中檢測(cè)了21號(hào)染色體上127個(gè)已知基因的調(diào)控區(qū)及編碼區(qū)序列。在獲得的711,283 堿基人類序列中，我們發(fā)現(xiàn)了1192個(gè)SNP；在人與黑猩猩399,264 堿基序列中，發(fā)現(xiàn)有3003個(gè)堿基差異，在編碼區(qū)，調(diào)控區(qū)及編碼區(qū)旁序列，人類與黑猩猩的差別分別是0.51%，0.88% 和0.85%。我們系統(tǒng)地提供了21號(hào)染色體上SNP的初步情況，包括SNP的分布，群體間差異等，并提出在復(fù)雜疾病的相關(guān)分析中，根據(jù)群體的特殊性來(lái)選擇SNP是必要的。在人與黑猩猩等靈長(zhǎng)類動(dòng)物的比較中，則提示那些僅存在于人類的序列變化可能通過(guò)引起蛋白結(jié)構(gòu)或表達(dá)的改變而形成人類特征，從而為我們更好了解人類自身提供了十分有用的信息并豐富了對(duì)人類進(jìn)化的認(rèn)識(shí)。 在48個(gè)位于隔離人群血壓分布兩端的樣本中，我們對(duì)24個(gè)血壓調(diào)節(jié)候選基因的調(diào)控區(qū)及編碼區(qū)進(jìn)行了SNP的檢測(cè)。在124,421堿基序列中發(fā)現(xiàn)了286個(gè)SNP位點(diǎn)，其中有21個(gè)位點(diǎn)顯示在高血壓和低血壓兩群體間分布差異很大。在更多樣本中對(duì)頻率分布差異大的SNP進(jìn)行分型，回歸分析結(jié)果顯示位于過(guò)氧化氫酶基因（catalase，CAT）和生長(zhǎng)因子1（growth hormone，GH1）調(diào)控區(qū)的SNP位點(diǎn)與血壓水平顯著相關(guān)。以152名苯中毒工人作為病 WP=6 例組，152名從事接苯作業(yè)而沒(méi)有苯中毒表現(xiàn)的工人為對(duì)照組，篩查了細(xì)胞色素氧化酶P450 2E1 （cytochrome P450 2E1，CYP2E1），髓性過(guò)氧化物酶（myeloperoxidase，，MPO）和還原型輔酶I醌類氧化還原酶（NAD(P)H：quinone oxidoreductase I，NQO1）基因的調(diào)控區(qū)及編碼區(qū)，檢測(cè)了胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶M1和T1（glutathione-s-transferase M1，GSTM1；glutathione-s-transferase T1，GSTT1)的基因型。研究結(jié)果提示NQO1、CYP2E1、GSTT1代謝酶基因多態(tài)性和生活方式在苯中毒易感性機(jī)制中共同發(fā)揮作用。通過(guò)尋找西藏地區(qū)HBV病毒株S及C開(kāi)放閱讀框內(nèi)的DNA變異，揭示存在于西藏地區(qū)的HBV是C/D重組型和C型，血清型為ayw2和adw，同時(shí)C基因處有兩個(gè)位點(diǎn)可能與免疫失敗相關(guān)聯(lián)。

【關(guān)鍵詞】：
【學(xué)位授予單位】：中國(guó)科學(xué)院研究生院（上海生命科學(xué)研究院）
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2002
【分類號(hào)】：Q987
【目錄】：

中文摘要5-7

英文摘要7-9

第一部分 ――人類21號(hào)染色體已知基因序列多態(tài)研究及與靈長(zhǎng)類動(dòng)物基因序列比較9-88

第一章 引言10-20

1． 單核苷酸堿基多態(tài)10-16

2． 猿基因組16-19

3．21 號(hào)染色體介紹19-20

第二章 材料與方法20-30

1． 樣本20-23

2． PCR測(cè)序方法尋找多態(tài)23-27

3． 數(shù)據(jù)分析27-30

第三章 結(jié)果與討論30-67

1． 人類單核苷酸堿基多態(tài)30-53

2． 人與黑猩猩比較53-60

3． 人與黑猩猩及其它靈長(zhǎng)類比較60-67

第四章 結(jié)論67-68

第五章 參考文獻(xiàn)68-74

第六章 附錄74-88

1．21 號(hào)染色體已知基因列表74-83

2． DNA樣品池測(cè)序效果評(píng)估83-87

3． 實(shí)驗(yàn)誤差統(tǒng)計(jì)87-88

第二部分 ――應(yīng)用SNP尋找復(fù)雜疾病致病基因，環(huán)境因子敏感基因及分析乙型肝炎病毒基因型88-139

第一章 利用單核苷酸多態(tài)研究血壓調(diào)控候選基因與原發(fā)性高血壓的相關(guān)性89-102

第二章 基因CYP2E1，MPO，NQO1，GSTM1和GSTT1的遺傳多態(tài)與慢性苯中毒易感性102-121

第三章 流行于西藏地區(qū)的HBV病毒株基因型、血清型分析及S、C基因的變異檢測(cè)121-138

第四章 結(jié)論138-139

發(fā)表文章139-141

致謝141

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【引證文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【同被引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)引證文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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1 秦立紅;草原紅牛初生公牛與成年公牛背最長(zhǎng)肌基因表達(dá)差異分析[D];吉林大學(xué);2010年

2 林燕;大白菜小孢子早期胚胎發(fā)生相關(guān)基因的表達(dá)分析[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

3 李關(guān)榮;家蠶sch系統(tǒng)胚胎期高溫致死性的基因表達(dá)差異研究[D];西南農(nóng)業(yè)大學(xué);2002年

4 陳捷;骨髓和動(dòng)員外周血CD34～+細(xì)胞基因表達(dá)差異[D];第一軍醫(yī)大學(xué);2002年

5 謝曉東;小麥雜交當(dāng)代和親本自交種子發(fā)育早期的基因表達(dá)差異與雜種優(yōu)勢(shì)[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年

6 王章奎;普通小麥雜交種與親本間根系基因表達(dá)差異與雜種優(yōu)勢(shì)分子機(jī)理[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

7 馮潔;廣西地區(qū)長(zhǎng)壽及長(zhǎng)壽相關(guān)表型的遺傳學(xué)研究[D];中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2010年

8 陳思;BCL11B基因在T細(xì)胞分化和增殖中調(diào)節(jié)作用的研究[D];暨南大學(xué);2010年

9 項(xiàng)智鋒;豬小腸NaPi-Ⅱb基因克隆和表達(dá)調(diào)控研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

10 陳蓉;禽類Piwill基因與piRNAs生物學(xué)功能的初步研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2013年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 張威;基因集富集分析在腫瘤標(biāo)志物篩選中的比較研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2013年

2 張海燕;大豆耐鹽基因定位及耐鹽相關(guān)基因分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)[D];新疆農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

3 梅菊芬;茶樹(shù)冷馴化過(guò)程中基因表達(dá)差異的初步分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

4 董芳英;基于聚類結(jié)果的基因集差異表達(dá)分析[D];浙江大學(xué);2010年

5 馬曉娣;不同耐熱性小麥葉片超微結(jié)構(gòu)及基因表達(dá)差異的研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

6 任愛(ài)輝;小鼠胎肝與骨髓基因表達(dá)差異的比較研究[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2003年

7 梁洪雨;靈長(zhǎng)類動(dòng)物腦中特殊類型細(xì)胞基因表達(dá)情況的研究[D];東北林業(yè)大學(xué);2012年

8 曹玉江;黃瓜顯微結(jié)構(gòu)及類黃酮和類胡蘿卜素關(guān)鍵酶基因表達(dá)差異的初步研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

9 張奎;鴨源性E.coli耐藥相關(guān)基因mRNA表達(dá)差異分析及中藥對(duì)E.coli耐藥性的消除試驗(yàn)[D];西南大學(xué);2009年

10 夏建冰;幼齡茶樹(shù)在干旱脅迫下基因表達(dá)差異分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

  本文關(guān)鍵詞：I.人類21號(hào)染色體已知基因序列多態(tài)研究及與靈長(zhǎng)類動(dòng)物基因序列比較 II.應(yīng)用SNP尋找復(fù)雜疾病致病基因，環(huán)境因子敏感基因及HBV病毒株的研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：148458