秦川牛PSMC2基因的SNP及其對體尺和胴體性狀的影響
本文關(guān)鍵詞: 秦川牛 PSMC2 多態(tài)性 體尺 胴體性狀 出處:《西北農(nóng)林科技大學(xué)》2015年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:體尺和胴體性狀是秦川牛肉牛重要的經(jīng)濟(jì)性狀,是受到多個(gè)基因控制的數(shù)量性狀。本研究旨在分析秦川牛PSMC2基因外顯子的多態(tài)性及其與秦川牛體尺和胴體性狀的關(guān)聯(lián)性。本實(shí)驗(yàn)選擇171頭相同飼養(yǎng)條件下24-30月齡的健康秦川牛去勢公牛,采用DNA測序技術(shù),檢測PSMC2基因的SNP位點(diǎn),結(jié)果表明:PSMC2基因在擴(kuò)增序列的第131位、基因組的第4495565位處發(fā)生一處單堿基CG的突變;在序列第198位、基因組第4495632位發(fā)生一處AG突變;在序列第265位、基因組第4495699位發(fā)生一處CG突變以及在序列第285位、基因組第4495719位發(fā)生一處CG突變。運(yùn)用SPSS統(tǒng)計(jì)軟件中的GLM模型,將發(fā)現(xiàn)的SNP位點(diǎn)與體尺及胴體性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析,發(fā)現(xiàn)C131G基因座與空腹24 h宰前活重指標(biāo)顯著相關(guān),其中CG基因型個(gè)體顯著高于CC基因型(P0.05),在整個(gè)群體中出現(xiàn)了CG基因型優(yōu)于CC基因型的趨勢;A198G基因座在6個(gè)體尺及胴體指標(biāo)上兩種基因型個(gè)體差異均不顯著(P0.05),但在群體中出現(xiàn)了AG基因型優(yōu)于AA基因型的趨勢;C265G基因座中三種基因型個(gè)體在三個(gè)體尺指標(biāo)及屠宰率指標(biāo)上無顯著差異(P0.05),在宰前活重、胴體重指標(biāo)上出現(xiàn)了CCGGCG的趨勢,且CC基因型顯著高于CG基因型(P0.05)。C285G基因座中三種基因型個(gè)體與腰角寬、胴體重指標(biāo)顯著相關(guān),在腰角寬指標(biāo)上GG基因型顯著高于CG基因型(P0.05),在宰前活重指標(biāo)上CC基因型顯著高于GG基因型(P0.05),在胴體重指標(biāo)上CC基因型極顯著高于GG基因型個(gè)體(P0.01),并且群體中宰前活重和胴體重指標(biāo)出現(xiàn)了CCCGGG的趨勢。結(jié)果提示,秦川牛PSMC2基因中存在SNP位點(diǎn)且與部分體尺和胴體性狀顯著相關(guān),可考慮作為標(biāo)記輔助選擇中的分子標(biāo)記,為秦川肉牛留種、選育提供參考,從而加快具有優(yōu)質(zhì)經(jīng)濟(jì)性狀牛種群的建立。
[Abstract]:Body size and carcass traits are important economic traits of Qinchuan beef cattle. The aim of this study was to analyze the polymorphism of PSMC2 gene exon of Qinchuan cattle and its association with body size and carcass traits of Qinchuan cattle. Under the condition of 24-30 months old healthy Qinchuan cattle ovariectomized bull. DNA sequencing technique was used to detect the SNP site of PSMC2 gene. The results showed that the PSMC2 MC2 gene was in the 131st position of the amplified sequence. A single base CG mutation occurred at the 4495565 position of the genome. A AG mutation occurred at the 198th position of the sequence and at the 4495632 position of the genome. A CG mutation occurred at the 4495699 position of the genome and at the 285th position of the sequence. A CG mutation occurred at the 4495719 position of the genome. Using the GLM model in the SPSS statistical software, the relationship between the SNP loci and body size and carcass traits was analyzed. It was found that the C131G locus was significantly correlated with the fasting 24 h pre-mortem weight, and the CG genotype was significantly higher than the CC genotype (P0.05). CG genotype was superior to CC genotype in the whole population. There was no significant difference between the two genotypes in the size of 6 individuals and carcass index in A198G locus, but there was a trend that AG genotype was superior to AA genotype in population. There was no significant difference among the three genotypes in the three genotypes of C265G locus in terms of body size and slaughter rate, but there was a trend of CCGGCG in the premortem weight and carcass weight index. CC genotype was significantly higher than that of CG genotype (P0.05G. C285G locus). The three genotypes were significantly correlated with waist angle width and carcass weight index. GG genotype was significantly higher than CG genotype P0.05L in waist angle width index, and CC genotype was significantly higher than GG genotype P0.05 in pre-mortem weight index. In carcass weight index, CC genotype was significantly higher than GG genotype individuals (P0.01), and there was a trend of CCCGGG in pre-slaughter weight and carcass weight index. There is a SNP locus in the PSMC2 gene of Qinchuan cattle, which is significantly related to some body size and carcass traits. It can be considered as a molecular marker in marker-assisted selection to provide reference for breeding and breeding of Qinchuan beef cattle. So as to accelerate the establishment of cattle population with high quality economic traits.
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S823
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,本文編號(hào):1451490
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