本文關(guān)鍵詞：牛乳頭狀瘤病毒貴州株L1基因克隆及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：為分析牛乳頭狀瘤病毒貴州株(BPV-GZ01株)L1基因的分子特征,預(yù)測其編碼蛋白的生物學(xué)功能,本試驗對BPV-GZ01株L1基因進(jìn)行PCR擴增、克隆及序列測定。應(yīng)用生物信息學(xué)相關(guān)軟件及方法對BPV-GZ01株L1基因進(jìn)行序列分析,并對其編碼蛋白進(jìn)行二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)、B細(xì)胞表位、保守結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽預(yù)測。結(jié)果顯示,L1基因序列全長為1 494bp,編碼497個氨基酸;與BPV2、BPV2-SW01、BPV2-AKS01、BPV13、BPV1株相應(yīng)序列核苷酸同源性分別為99.1%、99.8%、99.4%、87.6%和82.8%,氨基酸同源性分別為98.6%、99.4%、98.4%、94.4%和91.3%;系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,BPV-GZ01株與BPV2-SW01株親緣關(guān)系最近;L1蛋白二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲、β-折疊和α-螺旋區(qū)域所占比例較大,預(yù)測此蛋白可能存在6個B細(xì)胞優(yōu)勢抗原表位,無跨膜區(qū)域,無信號肽區(qū)域;三級結(jié)構(gòu)呈彎曲狀螺旋結(jié)構(gòu)。本研究結(jié)果將為貴州省BPV免疫診斷及核酸疫苗研究提供理論依據(jù)。
【作者單位】： 貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院;貴州省動物疫病研究室;貴州省畜禽遺傳資源管理站;
【關(guān)鍵詞】： 牛乳頭狀瘤病毒 L基因 生物信息學(xué)分析 蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測
【基金】：貴州省農(nóng)業(yè)委員會科技專項《動物疫病防控能力提升專項》(黔農(nóng)財[2015]149號) “貴州省動物疫病防控與獸醫(yī)公共衛(wèi)生保障科技創(chuàng)新人才團隊”(黔科合人才團隊[2015]4016號) 貴州省黔南州社會發(fā)展科技重大計劃項目《喀斯特石漠化林草牧綜合治理技術(shù)研究與示范》[黔南社發(fā)科(20140325)] 貴州現(xiàn)代肉牛產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(GZCYTX2015-0302-02)
【分類號】：S852.65
【正文快照】： contain 6potential antigen epitopes.And no transmembrane domains and no signal peptide werefound.The tertiary structure of L1protein was curved spiral structure.These results provided atheoretical basis for immunologic diagnosis and further research of n

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1 權(quán)鑫;苦參堿抗牛乳頭狀瘤病毒感染C127細(xì)胞研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 梁辰;牛乳頭狀瘤病毒的檢測及其細(xì)胞感染試驗[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

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本文編號：1082798