犬前松弛素原基因的克隆與生物信息學分析
發(fā)布時間:2017-10-09 17:01
本文關(guān)鍵詞:犬前松弛素原基因的克隆與生物信息學分析
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【摘要】:[目的]本試驗通過對犬前松弛素原基因的分析推導獲得犬松弛素基因序列,為犬松弛素多克隆抗體的制備及臨床應用提供理論基礎。[方法]以北京犬和吉娃娃新生胎盤、貴賓犬卵巢為材料,分別提取總RNA,經(jīng)RT-PCR擴增,獲得犬前松弛素原基因,應用生物信息學方法初步分析犬前松弛素原基因的結(jié)構(gòu)及功能。[結(jié)果]完整克隆了從所獲樣品中擴增到的預期大小目的片段,包含一個534 bp的開放閱讀框,編碼177個氨基酸。擴增片段序列分析結(jié)果顯示,與NCBI核酸數(shù)據(jù)庫檢索的犬前松弛素原的c DNA序列同源性為99.6%,均有3個核苷酸位點發(fā)生改變,從而引起相應氨基酸改變,但并未引起蛋白結(jié)構(gòu)的變化。進化樹分析結(jié)果顯示,所獲3條目的片段同為一支,與貓前松弛素原基因的進化距離最近。生物信息分析顯示,3條序列等電點、帶電荷數(shù)、最高(最低)氨基酸、消光系數(shù)、半衰期、不穩(wěn)定系數(shù)均一致,相對分子質(zhì)量、不穩(wěn)定系數(shù)、脂肪系數(shù)、總平均疏水指數(shù)有細微差異;跨膜區(qū)、信號肽、糖基化位點分析結(jié)果一致;二級結(jié)構(gòu)組成一致,包含α-螺旋、延伸鏈、無規(guī)則卷曲,比例存在細微差異。[結(jié)論]成功克隆了犬前松弛素原基因,可以生物信息學分析為基礎進行犬松弛素多克隆抗體的制備。
【作者單位】: 四川農(nóng)業(yè)大學動物醫(yī)學院;
【關(guān)鍵詞】: 犬 前松弛素原基因 松弛素 生物信息學分析
【基金】:國家自然科學基金項目(31172379) 四川省學術(shù)與技術(shù)帶頭人培養(yǎng)基金項目
【分類號】:S829.2
【正文快照】: (College of Veterinary Medicine,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130,China)松弛素(relaxin,RLX)是主要由動物卵巢和妊娠時胎盤合成分泌,具有抑制子宮收縮,松弛骨盆韌帶和恥骨聯(lián)合,軟化宮頸及產(chǎn)道,刺激乳腺發(fā)育功能的重要生殖激素[1-4],同時還具有降解膠原纖維,
本文編號:1001340
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