發(fā)布時(shí)間：2017-09-24 12:07

  本文關(guān)鍵詞：H7N9禽流感患者恢復(fù)期T細(xì)胞受體庫(kù)特征研究

  更多相關(guān)文章： 高通量測(cè)序 免疫組庫(kù) 抗原互補(bǔ)決定區(qū) 生物信息學(xué) 禽流感病毒

【摘要】：目的建立H7N9禽流感患者恢復(fù)期T細(xì)胞受體庫(kù),尋找H7N9特異性T細(xì)胞受體變化。方法收集2013年3月至5月確診的8例人感染禽流感H7N9患者恢復(fù)期血液以及10例健康人血液,分離基因組DNA,采用Ⅲumina He Seq2000測(cè)序平臺(tái)對(duì)T細(xì)胞受體庫(kù)β鏈(TRB)抗原互補(bǔ)決定區(qū)3進(jìn)行高通量測(cè)序,分析TRB庫(kù)的多樣性等特征。結(jié)果與正常組比較,H7N9患者某些TRBV基因使用頻率如TRBV30、TRBV27存在顯著差異。使用主成分分析降維后,發(fā)現(xiàn)恢復(fù)期患者TRBV-TRBJ基因配對(duì)模式與正常人有顯著差別,可用于區(qū)分H7N9患者和正常人群�；颊摺颊�、正常人—正常人之間的共享序列數(shù)量和頻率明顯大于患者-正常人,且患者間TRB庫(kù)具有較高相似度。多樣性指數(shù)在患者組明顯低于正常人群,顯示在感染恢復(fù)期其免疫功能仍處于相對(duì)低下?tīng)顟B(tài)。同時(shí)H7N9患者中超高表達(dá)克隆明顯增多,且序列間存在較高相似性。結(jié)論 H7N9恢復(fù)期患者T細(xì)胞受體庫(kù)有H7N9特征性變化,這些特征將為疾病的診斷和治療性T細(xì)胞的研究提供重要信息。
【作者單位】： 復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院呼吸科;深圳華大基因股份有限公司;復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院;
【關(guān)鍵詞】： 高通量測(cè)序 免疫組庫(kù) 抗原互補(bǔ)決定區(qū) 生物信息學(xué) 禽流感病毒
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(編號(hào):81170056、81490533)
【分類號(hào)】：R511.7
【正文快照】： are H7N9-specific changes in TRB repertoires of H7N9 infected patients in convalescent phase,which havepotential implication in diagnosis and therapeutic T cell development.自2013年,在中國(guó)首次報(bào)道實(shí)驗(yàn)室確診的人感染禽流感病毒H7N9以來(lái)[1],該新發(fā)傳染病在2014

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 盧百川;;人類T細(xì)胞受體的α-鍵基因定位在14號(hào)染色體的有關(guān)T細(xì)胞瘤區(qū)[J];國(guó)外醫(yī)學(xué).遺傳學(xué)分冊(cè);1986年05期

2 童建華，董碩，，張影梅，陳賽娟，陳竺，蔣慧;急性淋巴細(xì)胞白血病T細(xì)胞受體γ、δ鏈基因的重組[J];上海第二醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);1994年04期

3 王立軍,鐘延豐,康德tD,楊金輝;反向聚合酶鏈反應(yīng)擴(kuò)增吉蘭巴蕾綜合征患者T細(xì)胞受體β鏈基因[J];中華醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)雜志;1999年06期

4 羅成娟;江華;陳靜;戴家樂(lè);沈小鈺;薛惠良;湯靜燕;羅長(zhǎng)纓;潘慈;沈樹(shù)紅;周敏;顧龍君;;兒童急性淋巴細(xì)胞白血病T細(xì)胞受體重排刪除環(huán)與嚴(yán)重感染相關(guān)性研究[J];中國(guó)當(dāng)代兒科雜志;2011年06期

5 顧龍君;童建華;陳英;董碩;張影梅;錢珠茲;陳賽娟;薛惠良;謝競(jìng)雄;陳竺;;兒童急性淋巴細(xì)胞白血病T細(xì)胞受體γ和δ鏈基因的重排[J];中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志;1993年03期

6 李揚(yáng)秋,韓素芳,楊力建;胸腺輸出功能的評(píng)價(jià)手段—T細(xì)胞受體重排刪除環(huán)的定量分析[J];中國(guó)實(shí)驗(yàn)血液學(xué)雜志;2003年06期

7 朱霞;朱平;郭曉玲;;慢性特發(fā)性血小板減少性紫癜相關(guān)T細(xì)胞克隆的T細(xì)胞受體特征[J];中華醫(yī)學(xué)雜志;2005年47期

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本文編號(hào)：911300