本文關(guān)鍵詞：2013年北京市朝陽區(qū)柯薩奇A6型病毒分子流行病學(xué)研究

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【摘要】：目的了解2013年北京市朝陽區(qū)柯薩奇A6型(Coxsackievirus A6,CVA6)病毒的流行特點及其基因特征。方法對2013年收集的795份手足口病患者的咽拭子樣本進(jìn)行腸道病毒檢測,對非EV71、非CVA16型病毒陽性樣本進(jìn)行CVA6熒光定量PCR檢測,選取CVA6陽性樣本進(jìn)行VP1片段(794bp)序列擴(kuò)增與測序,運用Clustalx軟件和MEGA4.0軟件對本地區(qū)CVA6的VP1片段序列與從NCBI下載的CVA6的VP1參考序列進(jìn)行聚類分析。結(jié)果腸道病毒通用型核酸陽性樣本共計382例(48.1%,382/795),其中非EV71、非CVA16型病毒236例(61.8%,236/382);非EV71、非CVA16型病毒陽性樣本中有CVA6型病毒樣本185例(78.4%,185/236)�；赩P1片段的聚類分析,結(jié)果顯示2013年該地區(qū)的CVA6型病毒與中國地區(qū)的參考序列明顯聚為一類;CVA6在系統(tǒng)進(jìn)化樹中形成A、B和C等3個基因型,C基因型又可分為C1和C2兩個基因亞型;兩個基因亞型間的核苷酸序列差異度為10.8%~13.2%。朝陽區(qū)所有的CVA6都位于C基因型,C1亞型包括了大部分該地區(qū)序列。結(jié)論 2013年該地區(qū)的CVA6已經(jīng)超過了EV71和CVA16,首次成為北京市朝陽區(qū)手足口病的主要病原體。該地區(qū)存在CVA6的C1和C2兩個基因亞型的共循環(huán),其中C1亞型對該地區(qū)2013年CVA6的暴發(fā)流行起關(guān)鍵作用。
【作者單位】： 北京市朝陽區(qū)疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 手足口病 柯薩奇A型病毒 系統(tǒng)進(jìn)化分析
【分類號】：R512.5;R181.3
【正文快照】： 手足口病( hand-foot-mouth disease,HFMD) 是由人腸道病毒引起的一類兒童常見傳染病。引起HFMD的主要病原體為人腸道病毒A組中的腸道病毒71 型( enterovirus 71,EV71) 和柯薩奇A16 型( coxsackievirus A16,CVA16) 。常見癥狀有發(fā)熱和手、足、口皮疹或皰疹、無菌性腦膜炎,少部

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本文編號：700262