INTS10基因遺傳變異與乙肝病毒感染結(jié)局的關(guān)聯(lián)研究
發(fā)布時間:2024-06-10 19:42
目的:1.探討環(huán)境因素對乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染結(jié)局的影響。2.探討INTS10基因遺傳變異對HBV感染結(jié)局的影響。3.探討INTS10基因遺傳變異與環(huán)境因素之間的交互作用對HBV感染結(jié)局的影響。方法:采用病例-對照研究方法,收集乙肝相關(guān)肝癌者(Hepatocellular Carcinoma,HCC)、慢性乙肝病毒感染者(Chronic HBV infection,CH)和乙肝病毒自限性清除者(Hepatitis B Virus Spontaneous Recovery,SR)作為研究對象,設(shè)立兩個比較組:CH vs.SR比較組和HCC vs.CH比較組。應(yīng)用標(biāo)簽SNP結(jié)合既往GWAS研究結(jié)果的方法選擇與HBV感染有潛在關(guān)聯(lián)的INTS10基因遺傳變異,系統(tǒng)分析遺傳變異和環(huán)境因素(吸煙、飲酒、惡性腫瘤家族史)對HBV感染結(jié)局的影響。應(yīng)用TaqMan-PCR技術(shù)進(jìn)行基因型檢測;采用?2檢驗比較環(huán)境因素和基因型在各組之間的分布差異;采用Logistic回歸模型分析環(huán)境因素對HBV感染結(jié)局的影響;采用Logistic回歸模型和隨機(jī)森林模型分析遺傳變異對H...
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3991811
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【部分圖文】:
圖1-1全球乙肝病毒感染的地區(qū)分布(2011-2016年)
1.1乙肝病毒感染的流行情況乙型肝炎病毒(HepatitisBVirus,HBV)屬于嗜肝DNA病毒科,是目前已知的可以感染人類的最小的DNA病毒,基因組長僅約為3200bp,是引起急、慢性肝病的主要原因[1]。研究表明,HBV導(dǎo)致肝損傷和炎癥發(fā)生的生物機(jī)制,是....
圖1-2課題思探討INTS10基因遺傳變異對HBV感染結(jié)
HCC組(N=737)吸煙飲酒惡性腫瘤家族史設(shè)立兩個比較組:問卷調(diào)查血樣采DNA提取CH組(N=750)基因型檢
圖2-1TaqMan探針原理圖
則考慮重新提取DNA。.5.3基因型檢測實驗利用研究對象的DNA樣本進(jìn)行基因型檢測實驗,本研究共納入2237名研究,13個SNP,共計基因型檢測樣本量為29081個。實驗的原理和操作如下:(1)基因型檢測實驗原理本研究應(yīng)用實時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(Real-....
圖2-2基因型分布散點圖
分析結(jié)果包括基因型分布散點圖(圖2-2)和各反應(yīng)孔的擴(kuò)增曲線圖(圖2-3)。如基因型分布散點圖所示:藍(lán)色散點為GG基因型;紅色散點均為AA基因型;綠色散點均為AG基因型。對于軟件不能提供自動分型結(jié)果的反應(yīng)孔,可根據(jù)擴(kuò)增曲線圖判斷,如圖2-3所示,F(xiàn)AM曲線明顯上....
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