目的對(duì)19例人感染高致病性H5N6禽流感病毒的血凝素(hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA)蛋白進(jìn)行分子進(jìn)化分析。方法運(yùn)用下一代測(cè)序平臺(tái)對(duì)病毒分離物進(jìn)行全基因組測(cè)序,從美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)和全球流感序列數(shù)據(jù)庫(kù)(global initiative on sharing avian influenza data, GISAID)下載參考序列,利用Blasts、Mega 6.1及Clustal X 2.1等軟件進(jìn)行序列分析。結(jié)果 2014-2018年中國(guó)共發(fā)生23例人感染H5N6禽流感病毒病例。對(duì)19個(gè)病例的H5N6病毒的HA和NA基因進(jìn)行進(jìn)化分析。HA進(jìn)化分析顯示病毒都屬于Clade 2.3.4.4,其中涉及17個(gè)病例的病毒屬于Group C;首例H5N6病例毒株(A/Sichuan/26221/2014)屬于Group D;福建一個(gè)病例(A/Fujian-Sanyuan/21099/2017)屬于Group B。所有19個(gè)病例的病毒HA蛋...

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圖12014-2018年19例人感染H5N6病毒HA基因進(jìn)化樹(shù)

Lee等[3,13]研究發(fā)現(xiàn),從2012年末開(kāi)始,2.3.4.4H5Nx病毒的HA基因分化出4個(gè)不同進(jìn)化群:GroupA(Buan-like)、B(Gochang-like)、C和D。本研究中,HA進(jìn)化分析顯示(圖1),31株病毒都屬于Clade2.3.4.4,其中涉及17....

圖22014-2018年19例人感染H5N6病毒NA基因進(jìn)化樹(shù)

從NA進(jìn)化樹(shù)分析可見(jiàn),H5N6病毒的NA起源于中國(guó)家禽中流行LPAIH6N6病毒,進(jìn)化上為兩大分支:A分支屬于早期H5N6病毒,NA蛋白莖區(qū)沒(méi)有發(fā)生缺失;B分支NA蛋白莖區(qū)出現(xiàn)11個(gè)氨基酸的缺失。見(jiàn)圖2。2.4分子特征分析

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