目的分析2018-2019年云南省昭通市新甲型H1N1、H3N2亞型流感病毒流行情況及基因進化特征,為流感防控提供科學依據。方法收集2018年1月-2019年10月昭通地區(qū)哨點醫(yī)院流感樣病例咽拭子標本2 863份進行real-time RT–PCR檢測,用狗腎傳代細胞(Madin-Darby canine kidney cell,MDCK)對核酸陽性樣本進行病毒分離,分離得到的流感毒株采用血凝抑制實驗進行鑒定分型。最終選取43株新甲型H1N1亞型流感毒株,及15株H3N2亞型毒株進行全基因組測序,使用MEGA 5.2軟件進行序列分析。結果系統(tǒng)發(fā)生分析表明95.35%(41/43)昭通新甲型H1N1分離株屬于6B.1A支系, 93.33%(14/15)H3N2分離株屬于3C.2a1b支系。與參考株A/California/07/2009相比,新甲H1N1分離株HA蛋白有7處抗原位點和1處受體結合位點發(fā)生變異,H3N2分離株有5處抗原位點和4處受體結合位點發(fā)生變異。結論 2018-2019年昭通地區(qū)流行的新甲型H1N1和H3N2亞型流感病毒毒株與WHO推薦的當年北半球的疫苗組分匹配,但H3...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料來源
    1.2 方法
        1.2.1 病原學監(jiān)測
        1.2.2全基因組序列測定
        1.2.3 基因分析與系統(tǒng)進化樹構建
        1.2.4 糖基化位點預測
2 結果
    2.1 昭通市流感毒株分離情況
    2.2 流感病毒HA基因特性分析
3 討論



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